Pseudomonas chlororaphis
| Pseudomonas chlororaphis | |
|---|---|
| Klasyfikacja naukowa | |
| Domena: | Bakteria |
| Gromada: | pseudomonadota |
| Klasa: | Gammaproteobakterie |
| Zamówienie: | Pseudomonadales |
| Rodzina: | Pseudomonadaceae |
| Rodzaj: | Pseudomonas |
| Gatunek: |
P. chloraphis
|
| Nazwa dwumianowa | |
|
Pseudomonas chlororaphis (Guignard i Sauvageau 1894) Bergey i in . 1930 |
|
| Wpisz szczep | |
|
ATCC 9446 |
|
| Synonimy | |
|
Bacillus chlororaphis Guignard i Sauvageau 1894 |
|
Pseudomonas chlororaphis jest bakterią stosowaną jako inokulant gleby w rolnictwie i ogrodnictwie . Może działać jako kontroli biologicznej przeciwko niektórym grzybiczym patogenom roślin poprzez wytwarzanie antybiotyków typu fenazynowego . Na podstawie analizy 16S rRNA , podobne gatunki zostały umieszczone w jego grupie.
Porównawcze badanie genomiczne i filogenomiczne przeprowadzone w 2020 r. Przeanalizowało 494 kompletne genomy z całego rodzaju Pseudomonas , z czego 43 to szczepy P. chlororaphis . W tym badaniu określono gatunek P. chlororaphis na podstawie jego monofilii i kryterium średniej tożsamości nukleotydowej. Gatunek ten należy do szerszego kompleksu gatunków P. fluorescens , jak określono przez. Liczba białek i zawartość GC szczepów tego gatunku wahała się odpowiednio między 5599–6401 (średnio: 6076) i 61,9–64% (średnio: 62,8%). Ponadto 43 P. chlororaphis proteomy zawierały 3587 białek rdzeniowych (wspólnych dla wszystkich szczepów gatunku), przy czym 11 białek rdzeniowych było specyficznych dla tej grupy, a zatem nieobecnych we wszystkich innych szczepach rodzaju Pseudomonas . Dwa z tych 11 specyficznych dla grupy białek rdzeniowych to bakteriocyna z rodziny holin i białko biosyntetyczne podobne do mitomycyny i mogą one zapewniać przewagę konkurencyjną nad innymi kolonizatorami korzeni.
Grupa Pseudomonas chlororaphis
Pseudomonas chlororaphis nadaje swoją nazwę podgrupie w obrębie rodzaju Pseudomonas . Innymi przedstawicielami P. chlororaphis są P. aurantiaca , P. aureofaciens , P. fragi , P. lundensis i P. taetrolens .
Linki zewnętrzne