RPN2
| Identyfikatory | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RPN2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| , RIBIIR, RPN-II, RPNII, SWP1, ryboforyna II | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Identyfikatory zewnętrzne | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Wikidane | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Dolichylodifosfooligosacharyd – podjednostka 2 glikozylotransferazy białkowej, zwana także ryboforyną ǁ , jest enzymem kodowanym u ludzi przez gen RPN2 .
Funkcjonować
Gen ten koduje integralne białko błonowe ryboforyny typu I , występujące wyłącznie w szorstkiej siateczce śródplazmatycznej. Kodowane białko jest częścią kompleksu transferazy N-oligosacharylowej, który łączy oligosacharydy o wysokiej zawartości mannozy z resztami asparaginy występującymi w motywie konsensusowym Asn-X-Ser/Thr powstających łańcuchów polipeptydowych. Białko to ma podobną sekwencję do podjednostki SWP1 drożdżowej transferazy oligosacharylowej. Wykazano, że RPN2 jest markerem prognostycznym raka u ludzi i może być potencjalnym celem o znaczeniu klinicznym.
Struktura
Gen
Gen RPN2 leży na chromosomie 20q11.23 i składa się z 19 eksonów .
Białko
RPN2 składa się z 631 reszt aminokwasowych i waży 69284 Da.
Funkcjonować
RPN2 jest unikalną integralną glikoproteiną w szorstkiej błonie ER , która bierze udział w translokacji i utrzymaniu wyjątkowości strukturalnej szorstkiej błony ER. Jest także istotną podjednostką kompleksu transferazy N-oligosacharylowej, która sprzęga oligosacharydy o wysokiej zawartości mannozy z resztami asparaginy w motywie konsensusowym NXS/T powstających łańcuchów polipeptydowych . RPN2 reguluje glikozylację w przypadku oporności wielolekowej, a zatem jej zakłócanie może zmniejszyć lokalizację glikoproteiny P w błonie poprzez zmniejszenie jej statusu glikozylacji i przywrócenie wrażliwości na docetaksel .
Znaczenie kliniczne
Wykazano, że RPN2 jest markerem prognostycznym raka u ludzi. RPN2 ulega silnej ekspresji w komórkach macierzystych raka piersi i jest powiązany z przerzutami nowotworu . Niedawne badania wykazały, że jego ekspresja jest skorelowana z klinicznie agresywnymi cechami raka piersi, co sugeruje możliwe zastosowanie w medycynie personalizowanej. wyciszanie RPN2 tłumi rakotwórczość i uwrażliwia guzy na leczenie cisplatyną , co prowadzi do dłuższego przeżycia NSCLC myszy noszących RNAi, co sugeruje, że RPN2 może stanowić obiecujący nowy cel dla medycyny opartej na RNAi przeciwko NSCLC. Podobne potencjalne zastosowanie wykazano także w leczeniu kostniakomięsaka , raka płaskonabłonkowego przełyku i raka jelita grubego . Doniesiono także, że RPN2 jest jednym z protrombinę na powierzchni monocytów , co sugeruje jego udział w patofizjologii zakrzepicy u pacjentów z APS .
Interakcje
tetraspanina CD63
protrombina
Organizmy modelowe
| Charakterystyka | Fenotyp |
|---|---|
| Żywotność homozygoty | Nieprawidłowy |
| Recesywne badanie śmiertelne | Nieprawidłowy |
| Płodność | Normalna |
| Masy ciała | Normalna |
| Lęk | Normalna |
| Ocena neurologiczna | Normalna |
| Siła uścisku | Normalna |
| Gorący talerz | Normalna |
| Dysmorfologia | Normalna |
| Kalorymetria pośrednia | Normalna |
| Test tolerancji glukozy | Normalna |
| Odpowiedź słuchowa pnia mózgu | Normalna |
| DEXA | Normalna |
| Radiografia | Normalna |
| Temperatura ciała | Normalna |
| Morfologia oka | Normalna |
| Chemia kliniczna | Normalna |
| Immunoglobuliny osocza | Normalna |
| Hematologia | Normalna |
| Limfocyty krwi obwodowej | Normalna |
| Test mikrojądrowy | Normalna |
| Masa serca | Normalna |
| Histopatologia mózgu | Normalna |
| Histopatologia oka | Normalna |
| Zakażenie Salmonellą | Normalna |
| Zakażenie Citrobacterem | Normalna |
| Wszystkie testy i analizy z |
Do badania funkcji RPN2 wykorzystano organizmy modelowe . Linię myszy z warunkowym nokautem , zwaną Rpn2 tm1a(EUCOMM)Wtsi, wytworzono w ramach programu Międzynarodowego Konsorcjum Myszy Knockout — wysokowydajnego projektu mutagenezy mającego na celu tworzenie i rozpowszechnianie zwierzęcych modeli chorób wśród zainteresowanych naukowców.
Samce i samice zwierząt poddano standaryzowanemu badaniu fenotypowemu w celu określenia skutków delecji. Na zmutowanych myszach przeprowadzono dwadzieścia sześć testów i zaobserwowano dwie istotne nieprawidłowości. W czasie ciąży nie zidentyfikowano homozygotycznych zmutowanych zarodków, w związku z czym żaden nie przeżył do odsadzenia . Pozostałe testy przeprowadzono na dorosłych myszach z mutacją heterozygotyczną ; u tych zwierząt nie zaobserwowano żadnych dodatkowych istotnych nieprawidłowości.
Dalsza lektura
- Stoffel M, Xiang K, Bell GI (listopad 1992). „Polimorfizm powtórzeń dinukleotydów w locus ludzkiej ryboforyny II (RPN2) na chromosomie 20q”. Genetyka molekularna człowieka . 1 (8): 656. doi : 10.1093/hmg/1.8.656 . PMID 1301181 .
- Löffler C, Rao VV, Hansmann I (czerwiec 1991). „Mapowanie genu ryboforyny II (RPN II) na ludzkim chromosomie 20q12-q13.1 metodą hybrydyzacji in situ”. Genetyka człowieka . 87 (2): 221–2. doi : 10.1007/BF00204188 . PMID 2066112 . S2CID 26258810 .
- Kumar V, Heinemann FS, Ozols J (czerwiec 1998). „Interleukina-2 indukuje N-glikozylację w komórkach T: charakterystyka oligosacharylotransferazy ludzkich limfocytów”. Komunikaty dotyczące badań biochemicznych i biofizycznych . 247 (2): 524–9. doi : 10.1006/bbrc.1998.8780 . PMID 9642163 .
- Fu J, Kreibich G (luty 2000). „Zatrzymanie podjednostek kompleksu oligosacharylotransferazy w siateczce śródplazmatycznej” . Journal of Biological Chemistry . 275 (6): 3984–90. doi : 10.1074/jbc.275.6.3984 . PMID 10660554 .
- Gevaert K, Goethals M, Martens L, Van Damme J, Staes A, Thomas GR, Vandekerckhove J (maj 2003). „Badanie proteomów i analiza przetwarzania białek metodą spektrometrii masowej identyfikacji posortowanych peptydów N-końcowych”. Biotechnologia Przyrody . 21 (5): 566–9. doi : 10.1038/nbt810 . PMID 12665801 . S2CID 23783563 .
- Kelleher DJ, Karaoglu D, Mandon EC, Gilmore R (lipiec 2003). „Izoformy oligosacharylotransferazy, które zawierają różne podjednostki katalityczne STT3, mają różne właściwości enzymatyczne” . Komórka Molekularna . 12 (1): 101–11. doi : 10.1016/S1097-2765(03)00243-0 . PMID 12887896 .
- Shibatani T, David LL, McCormack AL, Frueh K, Skach WR (kwiecień 2005). „Analiza proteomiczna ssaczej oligosacharylotransferazy ujawnia wiele podkompleksów, które zawierają Sec61, TRAP i dwie potencjalne nowe podjednostki”. Biochemia . 44 (16): 5982–92. doi : 10.1021/bi047328f . PMID 15835887 .
- Tu LC, Yan X, Hood L, Lin B (kwiecień 2007). „Analiza proteomiczna interakcji genu 1 regulowanego w dół N-myc i jego interakcji z programem odpowiedzi na androgeny w komórkach raka prostaty” . Proteomika molekularna i komórkowa . 6 (4): 575–88. doi : 10.1074/mcp.M600249-MCP200 . PMID 17220478 .