Rhizobium lentis
Klasyfikacja naukowa | |
---|---|
Rhizobium lentis | |
Domena: | Bakteria |
Gromada: | Pseudomonadota |
Klasa: | Alfaproteobakterie |
Zamówienie: | Hyfomikrobiale |
Rodzina: | Rhizobaceae |
Rodzaj: | Ryzob |
Gatunek: |
R. lentis
|
Nazwa dwumianowa | |
Rhizobium lentis Harun-lub Rashid i in. 2015
|
Rhizobium lentis to gram-ujemna bakteria wyizolowana z guzków korzeni soczewicy w Bangladeszu.
Opis
Rhizobium lentis to bakterie w kształcie pałeczek występujące w glebie. Wymagają tlenu i nie tworzą zarodników .
Rhizobium lentis dobrze rośnie na podłożu agarowym YEMA , gdzie tworzy kolonie okrągłe, wypukłe i kremowobiałe. Bakterie te rosną w temperaturze 12–37°C, ale mogą przetrwać w temperaturach tak niskich jak 4°C. Szczepy dobrze rosną przy pH 5,5 do 8,2. Większość badanych szczepów jest oporna na ampicylinę , kanamycynę i kwas nalidyksowy . Szczepy nie tolerują tetracykliny i nie wykazują żadnego wzrostu na podłożu LB.
Rhizobium lentis może wykorzystywać α-D-laktozę, β-metylo-D-glukozyd, D-sorbitol , D-mannit, D-arbitol-glicerol, D-fruktozo-6-fosforan, kwas L-asparaginowy , kwas D-glukonowy, śluz kwas metylowy kwasu D-mlekowego, kwas L-mlekowy, L-histydyna , kwas β-hydroksy-D, L-masłowy, kwas D-jabłkowy, kwas L-jabłkowy, kwas octowy i kwas mrówkowy . Nie są w stanie wykorzystać D-maltozy, D-trehalozy, D-celobiozy, gentiobiozy , sacharozy , D-rafinozy, α-D-glukozy, D-turanozy, D-melibozy, mannozy , galaktoza , 3-metyloglukoza, inozyna , kwas D-asparaginowy, glicylo-L-prolina, L-alanina , L-arginina , L-seryna , pektyna, kwas D-sacharynowy, kwas p-hydroksy-fenylooctowy, pirogronian metylu , kwas cytrynowy , kwas bromobursztynowy, kwas acetylooctowy lub kwas propionowy . R. lentis może rosnąć w obecności antybiotyków linkomycyny , fioletu tetrazolowego i błękitu tetrazolowego, ale nie w obecności 1% mleczanu sodu , troleandomycyna , chlorek litu , telluryn potasu lub maślan sodu .
Typowym szczepem R. lentis jest BLR27T (= LMG 28441T = DSMZ 29286T).
Aplikacje
Różne szczepy tego gatunku mogą tworzyć guzki i przyspieszać wzrost soczewicy, grochu i latyrusu .
Genetyka
Rhizobium lentis jest genetycznie bardzo blisko spokrewniony z pokrewnymi gatunkami Rhizobium etli i Rhizobumphaseoli . Zawartość GC w DNA szczepu typu wynosi 61,1%.
Sekwencja genomu jest dostępna w Narodowym Centrum Informacji Biotechnologicznej i europejskim archiwum nukleotydów .
Historia
Rhizobium lentis został po raz pierwszy opisany w 2015 roku po wyizolowaniu z guzków korzeniowych Lens culinaris w dystrykcie Natore w Bangladeszu. Został nazwany „lentis” w odniesieniu do Lens , rodzaju rośliny, z której wyizolowano bakterie.
Dalsza lektura
- Rashid, MH, Gonzalez, H., Young, JPW i Wink, M. (2014) Rhizobium leguminosarum to symbiont soczewicy na Bliskim Wschodzie i w Europie, ale nie w Bangladeszu. Ekologia mikrobiologii FEMS, 87: 64 -77.
- Rashid, MH, Schafer, H., Gonzalez, H i Wink, M. (2012) Genetyczna różnorodność ryzobii brodawkowatej soczewicy ( Lens culinaris ) w Bangladeszu. Mikrobiologia systematyczna i stosowana, 35: 98-109.