Rodzina TA hol

domniemana rodzina holinów związana z transglikozylazą 3-4 TMS (TA Hol) ( TC# 1.E.43 ) jest grupą holinów, która nie należy do żadnej z siedmiu nadrodzin holinów. Homologowie obejmują tysiące różnych białek fagowych i bakteryjnych o długości od 80 do 140 reszt aminoacylowych (aas), które wykazują od 3 do 4 segmentów transbłonowych (TMS). Białka te są podobne do holin pod względem wielkości i topologii i są określane jako „związane z transglikozylazą”, „domniemana holina”, „białko transbłonowe podobne do faga”, „białko YeaQ” itp. W bazie danych białek NCBI. Od początku 2016 roku pozostają funkcjonalnie niescharakteryzowane. Pochodzą z szerokiej gamy typów bakterii i archeonów, w tym zarówno bakterii Gram-ujemnych , jak i Gram-dodatnich . Białka te są spokrewnione z rodziną RDD ( TC# 9.B.45 ) w bazie danych konserwowanych domen. Reprezentatywną listę białek należących do rodziny TA Hol można znaleźć w Transporter Classification Database .

Zobacz też

• Holin
• Lizyna
• Baza danych klasyfikacji transporterów

Dalsza lektura

•    Reddy, BL; Saier, MH (2013). „Analizy topologiczne i filogenetyczne rodzin i nadrodzin bakteryjnych holinów” . Biochim. Biofiza. Akta . 1828 (11): 2654–71. doi : 10.1016/j.bbamem.2013.07.004 . PMC 3788059 . PMID 23856191 . .
•    Saier, MH; Reddy, BL (2015). „Holiny u bakterii, eukariotów i archeonów: wielofunkcyjne ksenologie o potencjalnych zastosowaniach biotechnologicznych i biomedycznych” . J. Bacteriol . 197 (1): 7–17. doi : 10.1128/JB.02046-14 . PMC 4288690 . PMID 25157079 . .
•   Wang, IN; Smith, DL; Młody, R (2000). „Holins: zegary białkowe infekcji bakteriofagowych”. rok Wielebny Microbiol . 54 : 799-825. doi : 10.1146/annurev.micro.54.1.799 . PMID 11018145 . .
•   młody, r.; Blasi, U (1995). „Holins: forma i funkcja w lizie bakteriofagów”. Mikrobiol FEMS. ks . 17 (1–2): 191–205. doi : 10.1111/j.1574-6976.1995.tb00202.x . PMID 7669346 . .

Od tej edycji w tym artykule wykorzystano treść z „1.E.43 Putative 3-4 TMS Transglycosylase-associated Holin (TA Hol) Family” , która jest licencjonowana w sposób umożliwiający ponowne wykorzystanie na licencji Creative Commons Attribution-ShareAlike 3.0 Unported Licencja , ale nie na podstawie GFDL . Należy przestrzegać wszystkich odpowiednich warunków.