Słowniczek wirusologii
Ten słowniczek wirusologii to lista definicji terminów i pojęć używanych w wirusologii , badaniu wirusów , w szczególności w opisie wirusów i ich działania. Pokrewne dziedziny obejmują mikrobiologię , biologię molekularną i genetykę .
A
- wirus zwierzęcy
- Każdy wirus zdolny do zarażenia jednego lub więcej gatunków zwierząt .
- dryf antygenowy
- Stopniowa zmiana antygenowości wirusa wynikająca z nagromadzenia mutacji w genach kodujących białka powierzchniowe, co może skutkować powstaniem nowych szczepów wirusa, które nie są tak skutecznie hamowane przez te same przeciwciała gospodarza , które zapobiegały zakażeniu przez oryginalny szczep. Dryf antygenowy jest często możliwy dzięki naturalnej selekcji zmutowanych szczepów pod presją ze strony an immunologiczna . Kontrastowe przesunięcie antygenowe .
- imprinting antygenowy
- Zobacz pierworodny grzech antygenowy .
- przesunięcie antygenowe
- Każda nagła i poważna zmiana w antygenowości wirusa, szczególnie w wyniku reasortacji między dwoma lub więcej różnymi szczepami wirusa lub dwoma lub więcej różnymi wirusami, które wymieniają materiał genetyczny i w ten sposób łączą się, tworząc nowy podtyp mający mieszaninę antygenów powierzchniowych szczepów pierwotnych. Kontrastowy dryf antygenowy .
- lek przeciwwirusowy
- Klasa leków przeciwdrobnoustrojowych stosowanych w leczeniu chorób spowodowanych infekcjami wirusowymi , a nie bakteriami lub innymi czynnikami zakaźnymi. W przeciwieństwie do większości antybiotyków , leki przeciwwirusowe zazwyczaj nie niszczą docelowych wirusów, ale zamiast tego hamują ich rozwój. Różnią się one od środków wirusobójczych .
- montaż
- Budowa wirusa w komórce gospodarza , napędzana metabolizmem gospodarza.
- załącznik
- Pierwszy etap infekcji żywiciela komórki przez wirusa, w którym dochodzi do przypadkowej kolizji między cząsteczką wirusa a odpowiednim obszarem receptora na powierzchni komórki, co pozwala cząstce wirusa na fizyczne przyczepienie się do komórki za pomocą sił elektrostatycznych. Brak odpowiednich obszarów przyczepu może zapewnić komórce odporność na infekcję.
- szczep atenuowany Zmutowany
- szczep wirusowy , który ma niską zjadliwość lub jest niezjadliwy u jednego lub więcej naturalnych gatunków żywicieli , w związku z czym może być stosowany jako szczepionka atenuowana . Atenuowane szczepy otrzymuje się przez pasażowanie w hodowli komórkowej lub poprzez pobieranie próbek od innego gatunku żywiciela niż ten, u którego wirus zwykle powoduje chorobę.
B
- fag
- Każdy wirus , który infekuje i replikuje się w bakteriach lub archeonach .
- Para podstawowa (bp)
- klasyfikacji Baltimore
C
- cap
- cap snatching
- kapsyd
- Zewnętrzna otoczka białka, która zamyka i chroni materiał genetyczny wirusa.
- kapsomer
- Podjednostka wirusowego kapsydu , która samoorganizuje się z innymi kapsomerami, tworząc kapsyd.
- kooptacyjna
- koinfekcja
- Jednoczesna infekcja komórki lub gospodarza więcej niż jednym patogenem, tj. więcej niż jednym gatunkiem lub szczepem wirusa lub wirusem i innym typem mikroorganizmu, takim jak bakteria .
- złożony
- efekt cytopatyczny (CPE)
- Każda zmiana w strukturze, morfologii lub fizjologii komórki gospodarza spowodowana inwazją wirusową. Typowe przykłady CPE obejmują zaokrąglenie zakażonej komórki, fuzję z sąsiednimi komórkami w celu utworzenia syncytii oraz pojawienie się jądrowych lub cytoplazmatycznych ciałek inkluzyjnych . Zmiany te mogą, ale nie muszą, powodować lizę i śmierć komórki.
D
- dalton (Da)
- Jednostka masy często używana do opisania wielkości wirusa lub cząsteczki wirusa.
- Wirus DNA
- Typ wirusa , którego materiałem genetycznym jest DNA i replikuje się przy użyciu polimerazy DNA zależnej od DNA . W klasyfikacji Baltimore wirusy DNA należą do grupy I ( wirusy z dwuniciowym DNA ) lub grupy II ( wirusy z jednoniciowym DNA ); Wirusy grupy VII również mają genom DNA, ale są klasyfikowane oddzielnie, ponieważ replikują się przez pośredni RNA .
- Wirus dsDNA
- Dwuniciowy wirus DNA ; tj. wirus, którego genom jest zakodowany w dwóch komplementarnych niciach DNA, które zwykle występują jako jedna lub więcej kolistych cząsteczek . Wirusy dsDNA stanowią grupę I w systemie klasyfikacji Baltimore i wykorzystują metody replikacji i transkrypcji, które są zasadniczo podobne do metod stosowanych przez większe organizmy, takie jak bakterie. Wirus
- dsDNA-RT Wirus
- dsRNA
mi
- ecovirology
- emergent virus ( wirus wyłaniający się z ekowirusa)
- Każdy wirus, który niedawno zaadaptował się i pojawił jako nowy czynnik chorobotwórczy. Pojawiające się wirusy są często wynikiem transmisji między różnymi gatunkami lub szybkiego wzrostu częstości występowania lub ciężkości związanej z nimi choroby w populacji żywiciela.
- wejście
- endogennego elementu wirusowego (EVE)
- otoczone otoczką
G
- gigantyczny wirus
- Bardzo duży wirus, zwłaszcza jeden z tak zwanych wirusów nukleocytoplazmatycznego dużego DNA (NCLDV), które mają wyjątkowo duże genomy w porównaniu z przeciętnym wirusem i zawierają wiele unikalnych genów, których nie ma w innych organizmach. Niektóre z tych wirusów są większe niż typowa bakteria.
- Antygen specyficzny dla grupy
- Global Virus Network (GVN).
H
- helikalny
- wirus pomocniczy zależny wirus
- pomocniczy
- Każdy wirus , który wspomaga lub umożliwia replikację wirusa koinfekującego , który nie jest zdolny do samodzielnej replikacji.
- żywiciel
- Każdy większy organizm, który jest nosicielem wirusa w jakimś symbiotycznym związku, czy to pasożytniczym lub w przeciwnym wypadku. Chociaż niektóre wirusy mogą przetrwać przez krótki czas poza żywicielem, wszystkie wirusy są bezwzględnymi pasożytami i dlatego ostatecznie zależą od żywiciela, aby się rozmnażać. Ich rozmnażanie jest z definicji szkodliwe dla żywiciela, w którym występuje, chociaż wirusy mogą również biernie infekować i być przenoszone przez żywicieli pośrednich, którym wyrządzają niewielką lub żadną szkodę.
- tropizm żywiciela
- Swoistość, z jaką niektóre patogeny, w tym większość wirusów, infekują określonych żywicieli i tkanki żywiciela. Tropizm żywiciela powoduje, że większość patogenów jest zdolna do infekowania tylko ograniczonego zakresu organizmów żywiciela.
- Ludzki wirus niedoboru odporności (HIV)
I
- dwudziestościan
- Mający symetrię dwudziestościanu .
- integraza (IN)
- ciałek inkluzyjnych
- wrodzona odporność
k
Ł
- opóźnienie
- 1. Zdolność patogennego wirusa do pozostawania w stanie uśpienia lub utajenia w komórce przez pewien czas przed reaktywacją i wytworzeniem nowych, niezależnych wirionów .
- 2. Faza cyklu życia niektórych wirusów, w której po początkowej infekcji proliferacja cząstek wirusa ustaje, podczas gdy genom wirusa pozostaje po cichu zasymilowany z genomem komórki gospodarza, czasami w nieskończoność. Okres utajony kończy się, gdy wirus reaktywuje się i zaczyna wytwarzać duże ilości wirusowego potomstwa bez infekcji komórki gospodarza dodatkowymi zewnętrznymi wirionami. Opóźnienie jest elementem definiującym lizogenna forma replikacji wirusa.
- żywy szczep referencyjny wirusa (LVRS) cykl
- lizogeniczny
- cykl lityczny
M
- dojrzewanie
- wirusologia molekularna
- krotność infekcji (MOI)
- Stosunek liczby czynników zakaźnych (np. pojedynczych cząstek wirusowych ) do liczby celów infekcji (np. komórek danego gospodarza) w określonej przestrzeni.
- mykowirus
- Każdy wirus zdolny do infekowania jednego lub więcej gatunków grzybów .
N
- nanometr (nm)
- Jednostka długości często używana do opisu rozmiaru wirusa lub cząsteczki wirusa . Jeden nanometr to 10-9 metrów .
- wirus ssRNA o ujemnym sensie
- wirus neurotropowy
- Wirus zdolny do infekowania komórek układu nerwowego .
- neurowirusologia
- nowy wirus
- nukleokapsyd
- Kapsyd wirusa wraz z zawartym w nim genomem wirusa .
O
- pierwotny grzech antygenowy
- onkowirusa
- Tendencja układu immunologicznego człowieka do preferencyjnego wykorzystywania pamięci immunologicznej przebytej infekcji, gdy w kolejnych infekcjach napotkana zostanie druga, nieco inna wersja patogenu (np. wirus lub bakteria). Sukces przeciwciał opracowanych przeciwko dominującym antygenom pierwotnej infekcji ustanawia „odcisk” w układzie odpornościowym, który reguluje reakcje przeciwciał na późniejsze infekcje, nawet jeśli późniejsze infekcje są spowodowane przez warianty z różnymi dominującymi antygenami. W rezultacie układ odpornościowy nie jest w stanie wytworzyć potencjalnie bardziej skutecznych odpowiedzi na późniejsze infekcje, a każda choroba wywołana przez infekcję jest poważniejsza niż wcześniej.
- wirus sierocy
P
- Pasażowanie
- pasożyta
- w paleowirusologii
- Patrz pasaż seryjny .
- wirus pasażera
- Wirus, który często znajduje się w próbkach pobranych z chorej tkanki, takiej jak guzy, ale nie przyczynia się do wywoływania choroby.
- penetracja
- Patrz wpis .
- mieszanie fenotypów
- Niegenetyczna interakcja, w której cząsteczki wirusa wytwarzane przez komórkę, która jest jednocześnie zakażona dwoma lub więcej wirusami, są konstruowane ze wspólnym zestawem białek otoczki wspólnych dla wszystkich czynników infekujących, ale mimo to zachowują swoje własne unikalne genomy wirusowe. Ta domieszka skutkuje wirusami, które posiadają podobny asortyment identyfikujących białek powierzchniowych, pomimo posiadania innego materiału genetycznego, i jako takie są wyłącznie fenotypowe w tym sensie, że jeśli jeden z tych wirusów miałby przystąpić do infekowania innej komórki samodzielnie (tj. bez koinfekcji), jego materiał genetyczny nie byłby zdolny do reprodukcji tego samego zestawu wspólnych białek u własnego potomstwa.
- wirus roślinny
- Każdy wirus zdolny do infekowania jednego lub więcej gatunków roślin .
- prolate prolate
- wirusa
- ssRNA o dodatniej czułości
- Genom bakteriofaga , który został wstawiony i zintegrowany z kolistym chromosomem bakteryjnym lub który istnieje jako pozachromosomalny plazmid wewnątrz bakterii gospodarza, w szczególności, gdy pozostaje w postaci utajonej, która jest obecna w komórce gospodarza, ale nie został jeszcze przez nią aktywowany.
- pseudotypowanie
- prowirusa
Q
- Numer Q
R
- reasortacja
- Mieszanie materiału genetycznego różnych gatunków lub szczepów w nowe kombinacje u różnych osobników. Reasortacja może wystąpić, gdy dwa lub więcej podobnych wirusów (np. dwa różne szczepy grypy ) zakażają pojedynczą komórkę gospodarza , umożliwiając złożenie nowych cząstek wirusowych z segmentów każdej linii rodzicielskiej.
- recombinant virus
- release
- rep
- Skrót od białka replikacyjnego .
- replikacja
- Dowolny z różnych procesów reprodukcji wirusa.
- odwrotna transkryptaza
- retrowirusa
- Interferencja RNA
- Replikacja toczącego się koła
- wirusa RNA
S
- satelita
- Czynnik podwirusowy , którego replikacja jest całkowicie zależna od koinfekcji wirusa pomocniczego . Satelity mogą występować jako niezależne wiriony , które kodują białka strukturalne, ale mimo to nie mogą się replikować bez wirusa pomocniczego, lub jako proste segmenty kwasów nukleinowych, które „podjechały autostopem” przy użyciu białek kodowanych przez wirusa pomocniczego.
- wyczuć
- przejście seryjne
- Technika laboratoryjna, za pomocą której bakterie lub wirusy są hodowane w kolejnych iteracjach (np. cząstki wirusowe wirusa wyhodowane w jednym środowisku są przenoszone do nowego środowiska, często w nieco innych warunkach) w celu skłonienia wirusa do przystosowania się do nowego środowiska w ciągu okres czasu. Technika ta jest często wykorzystywana do badania ewolucji wirusów i inżynierii genetycznej wirusów o obniżonej zjadliwości , które można wykorzystać w szczepionkach .
- slow virus
- Każdy wirus lub czynnik wirusopodobny , który jest etiologicznie powiązany z tzw powolna choroba wirusowa : choroba, która po dłuższym okresie utajenia ma powolny, postępujący przebieg trwający od miesięcy do lat, zanim w większości przypadków nieuchronnie postępuje do śmierci.
- wirus ssDNA
- szczep
- wirusa ssRNA-RT
- nadkażenie
- czynnikiem podwirusowym
- Proces, w którym komórka, która została wcześniej zakażona wirusem, zostaje współzakażona innym szczepem lub gatunkiem wirusa w wyniku leczenia zastosowanego do opanowania pierwszego wirusa. Drugi wirus często wykształcił oporność na środki przeciwwirusowe leki stosowane w leczeniu pierwotnej infekcji lub zdolność do przezwyciężenia odpowiedzi immunologicznej gospodarza.
- wirusologia syntetyczna
T
u
- niepowlekanie
V
- niepowodzenie wirusologiczne
- Występuje, gdy terapia przeciwwirusowa (ART, analogi nukleotydów itp.) nie powoduje zahamowania i utrzymania miana wirusa poniżej określonego progu.
- kultura wirusowa
- choroba wirusowa
- Każda choroba , która pojawia się, gdy ciało organizmu zostaje zaatakowane przez zakaźne cząsteczki wirusa jednego lub więcej wirusów chorobotwórczych , które przyczepiają się do wrażliwych komórek , dostają się do nich i pasożytują .
- wirusa
- otoczka wirusowa
- Lipid dynamika otoczka obecna w niektórych wirusach, która otacza kapsyd i pomaga w penetracji ściany komórkowej żywiciela .
- miano
- wirusa interferencji wirusowej
- Liczbowe wyrażenie ilości wirusa w danej objętości, zazwyczaj wyrażane jako liczba pojedynczych cząstek wirusa na jednostkę objętości, ale także poprzez ilościowe określenie innych czynników, które są ściśle związane ze stężeniem wirusa lub na które ma wpływ. Miano wirusa często koreluje z ciężkością aktywnej infekcji wirusowej.
- wirusowa macierz
- wirusowa cząsteczka
- Zobacz wirion .
- płytka wirusowa
- białko wirusowe
- wydalanie
- wirusów transformacja
- wirusowa wektor wirusowy
- wiremia
- wirion
- Pojedyncza, stabilna cząsteczka będąca niezależną formą, w której wirus istnieje poza zainfekowaną komórką lub w trakcie infekowania komórki. Wiriony są produktami zakończonego cyklu replikacji wirusa; po uwolnieniu z zainfekowanej komórki są w pełni zdolne do infekowania innych komórek tego samego typu.
- viroid
- viroinformatics
- virokine
- Wirusowy produkt genowy , który ma funkcjonalną homologię z cytokinami gospodarza iw podobny sposób wpływa na funkcje komórkowe.
- wirusologia
- Nauka o wirusach i wirusopodobne, która stara się zrozumieć i wyjaśnić ich strukturę, klasyfikację, ewolucję i mechanizmy infekcji, a także wywoływane przez nie choroby , techniki ich izolowania i hodowli oraz ich zastosowanie w badaniach i terapii . Wirusologia jest często uważana za poddziedzinę mikrobiologii lub nauk medycznych .
- virome
- viropexis
- Aktywne wychwytywanie przez komórkę gospodarza cząstek wirusowych (zwykle związanych z receptorami na powierzchni komórki) przez niespecyficzne pinocyty proces. Viropexis jest ważną metodą wirusowej penetracji komórek gospodarza.
- virophage
- viroplasm
- wirusostatyczny
- Zdolny do zapobiegania replikacji wirusa.
- wirusoterapia
- wirusobójcza
- wirulencja
- Zdolność patogenu do wywoływania choroby, definiowana szeroko w kategoriach nasilenia objawów doświadczanych przez zakażonego żywiciela . Inne czynniki są równe, szczep wirusa który powoduje poważne objawy u podatnego osobnika, można uznać za wysoce zjadliwy, podczas gdy inny szczep, który wywołuje mniej poważne objawy lub nie powoduje żadnych objawów u tego samego osobnika, można uznać za stosunkowo mniej zjadliwy. W praktyce pojęcie zjadliwości może mieć niejednoznaczną interpretację, ponieważ konkretny szczep nie jest sam w sobie odpowiedzialny za ciężkość faktycznie rozwijającej się choroby; równie ważny jest stopień zakaźności wyrażany przez szczep i stan odporności gospodarza, naturalnej lub nabytej, w odniesieniu do tego konkretnego szczepu.
- wirus
- A submikroskopowy czynnik zakaźny , który replikuje się tylko w żywych komórkach innych organizmów. Jako obligatoryjne pasożyty wewnątrzkomórkowe , wirusy muszą infekować gospodarzy komórkowych , aby ukończyć swoje cykle życiowe, co osiągają poprzez dokooptowanie lub „przejęcie” maszynerii molekularnej komórki gospodarza w celu własnej reprodukcji. Wirusy, które nie znajdują się w zakażonej komórce lub nie są w trakcie infekowania komórki, istnieją w postaci niezależnych wirionów . Większość wirionów ma niezwykle prostą budowę i jest fizycznie znikoma, średnio zaledwie 1 ⁄ 100 wielkości typowej bakterii. Wirusy znajdują się w prawie każdym ekosystemie na Ziemi i infekują wszystkie rodzaje form życia, od zwierząt i roślin po mikroorganizmy, takie jak bakterie i archeony.
- wirusowe białko wiążące
- Każde białko ułatwiające wiązanie się wirusa z receptorem na komórce gospodarza.
- licznik wirusów
- Wyspecjalizowany typ cytometru przepływowego używany do szybkiego określania liczby pojedynczych wirionów lub cząstek wirusa w próbce cieczy.
- cząsteczka podobna do wirusa
- wirusoid
Z
Zobacz też
- Słowniczek biologii
- Słowniczek genetyki
- Słowniczek nazewnictwa naukowego
- Wprowadzenie do wirusów
- Lista wirusów
Kategorie: