Saccharomyces paradoxus

Saccharomyces paradoxus
Klasyfikacja naukowa
Królestwo: Grzyby
Dział: Ascomycota
Klasa: drożdżaki
Zamówienie: drożdżaki
Rodzina: Saccharomycetaceae
Rodzaj: Saccharomyces
Gatunek:
S. paradoks
Nazwa dwumianowa
Saccharomyces paradoxus
Bachinskaja, AA, 1914

Saccharomyces paradoxus to dzikie drożdże i najbliższy znany gatunek drożdży piekarniczych Saccharomyces cerevisiae . Jest używany w genomice populacji i badaniach filogenetycznych w celu porównania jego dzikich cech z drożdżami laboratoryjnymi.

Ekologia

Saccharomyces paradoxus jest izolowany głównie z drzew liściastych (dąb, klon, brzoza), aw rzadkich przypadkach z owadów i owoców. Często występuje w sympatii z innymi gatunkami Saccharomyces . Podobnie jak Saccharomyces cerevisiae , występuje na całym świecie i jest mezofilny , co ogranicza jego naturalne występowanie do niskich szerokości geograficznych. Jednak Saccharomyces paradoxus zwykle rośnie w niższych temperaturach niż Saccharomyces cerevisiae , co spowodowało nieznaczne przesunięcie w jego dystrybucji w kierunku chłodniejszych regionów, takich jak wyspy brytyjskie i wschodnia Kanada.

Biogeografia

Saccharomyces paradoxus dystrybucja na całym świecie. Populacje są reprezentowane różnymi kolorami. Zielone gwiazdki wskazują ostatnie wprowadzenia typu europejskiego.
Filogeneza głównych populacji Saccharomyces paradoxus .

W przeciwieństwie do większości innych gatunków Saccharomyces , nie ma dowodów na to, że Saccharomyces paradoxus został udomowiony przez ludzi. W związku z tym jego biogeografia jest w większości naznaczona procesami naturalnymi, takimi jak ograniczona migracja, refugia lodowcowe i adaptacja do klimatu. Co najmniej cztery odrębne genetycznie i fenotypowo populacje Saccharomyces paradoxus zostały zidentyfikowane, odpowiadające głównym podziałom geograficznym: Europa (w tym Zachodnia Syberia), Dalekowschodnia Azja (Japonia, wschodnia Syberia), Ameryka Północna (wschodnie i zachodnie wybrzeża Ameryki Północnej, region Wielkich Jezior) i północno-wschodnia Ameryka (półwysep Gaspé, Dolina Świętego Wawrzyńca i Appalachy). Reprezentatywne szczepy tych populacji wykazują częściową izolację postzygotyczną . Piąta populacja jest reprezentowana przez pojedynczy izolat z Hawajów. Niektóre szczepy z populacji europejskiej występują w Ameryce Północnej i Nowej Zelandii i prawdopodobnie są wynikiem niedawnych wydarzeń kolonizacyjnych. Dwa izolaty z Ameryki Południowej, opisane jako Saccharomyces cariocanus są genetycznie nie do odróżnienia, ale wykazują izolację postzygotyczną po skrzyżowaniu ze szczepami z populacji amerykańskiej, z powodu translokacji chromosomalnych .

Reprodukcja

Saccharomyces paradoxus jest naturalnie homothaliczny i występuje głównie w środowisku jako diploidalny . Rozmnażanie jest głównie klonalne , a 99% rozmnażania płciowego zachodzi między zarodnikami z tego samego woreczka . To usuwa recesywne szkodliwe mutacje, które nagromadziły się podczas ekspansji klonalnej, w procesie znanym jako „odnowa genomu”. Izolacja postzygotyczna między szczepami Saccharomyces paradoxus jest powszechnie obserwowana i może być spowodowana albo rozbieżności genetycznej między populacjami lub zmian chromosomalnych w obrębie populacji.

Podobnie jak w przypadku innych gatunków Saccharomyces , heterotalizm można przywrócić przy użyciu standardowych narzędzi genetycznych w celu uzyskania stabilnych szczepów haploidalnych do celów eksperymentalnych.