Ferrochelataza sirochlorowodorku
| identyfikatory | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ferrochelatazy sirohydrochloryny | |||||||||
| nr WE | 4.99.1.4 | ||||||||
| Bazy danych | |||||||||
| IntEnz | Widok IntEnz | ||||||||
| BRENDA | Wpis BRENDY | ||||||||
| ExPASy | Widok NiceZyme | ||||||||
| KEGG | Wpis KEGG | ||||||||
| MetaCyc | szlak metaboliczny | ||||||||
| PRYM | profil | ||||||||
| Struktury PDB | RCSB PDB PDBe PDB suma | ||||||||
| Ontologia genów | AmiGO / QuickGO | ||||||||
| |||||||||
Enzym ferrochelataza sirochlorowodorku (EC 4.99.1.4) katalizuje następującą reakcję:
- siroheme + 2H + sirochlorowodorek + Fe 2+
Enzym ten należy do rodziny liaz , a konkretnie do klasy „catch-all” liaz, które nie pasują do żadnej innej podklasy. Systematyczna nazwa tej klasy enzymów to ferro-liaza sirohemowa (tworząca sirochlorowodorek) . Enzym ten jest również znany jako SirB i występuje we wszystkich roślinach oraz bakteriach asymilujących/dysymilujących azotany i siarczany. Sirohem jest kofaktorem zarówno asymilujących, jak i dysymilujących reduktaz azotynowych i siarczynowych. Sirohem jest syntetyzowany z centralnego tetrapirolu cząsteczka uroporfirynogenu III, która tworzy pierwszy punkt rozgałęzienia szlaku biosyntezy tetrapirolu, drugim odgałęzieniem jest gałąź hemu/chlorofilu. Gałąź sirohemu składa się z trzech etapów: metylacji , odwodornienia i ferrochelatacji, przy czym ostatni etap jest przeprowadzany przez ferrochelatazę sirochlorowodorku.
Ferrochelataza sirochlorowodorku jest chelatazą klasy II, tj. nie wymaga ATP do swojej aktywności w przeciwieństwie do chelataz klasy I, takich jak chelataza Mg . U E. coli wszystkie trzy etapy biosyntezy sirohemu są przeprowadzane przez jeden wielofunkcyjny enzym o nazwie CysG, podczas gdy u drożdży Saccharomyces cerevisiae ostatnie dwa etapy są przeprowadzane przez dwufunkcyjny enzym o nazwie Met8p. CysG i Met8p mają wspólne fałdy, ale nie są spokrewnione z SirB i stanowią tak zwaną chelatazę klasy III. SirB należy do rodziny białek CbiX, a roślinny SirB jest o połowę krótszy od bakteryjnego SirB i jest wyrównany z jego N- i C-końcowymi połówkami, co sugeruje, że dłuższa forma wyewoluowała z duplikacji genu i fuzji krótszej formy.
Ferrochelataza sirochlorowodorku we wszystkich roślinach lądowych i niektórych zielonych algach , ale nie w bakteriach ani innych algach, składa się z klastra siarki żelaza , który może przełączać się między formami [2Fe-2S] i [4Fe-4S] w zależności od statusu redoks środowiska komórkowego . Chociaż nie jest jasno określone, jaką rolę może odgrywać to przełączanie klastra, postuluje się, że bierze udział w krytycznej regulacji redoks biosyntezy sirohemu.
