Białko transbłonowe 222 jest białkiem , które u ludzi jest kodowane przez gen TMEM222 . Godną uwagi cechą białka kodowanego przez ten gen jest obecność trzech przewidywanych transbłonowych . Przewiduje się, że białko TMEM222 najprawdopodobniej będzie zlokalizowane w pęcherzykach wydzielniczych.
TMEM222 ma domenę o nieznanej funkcji (DUF778). Pseudonimy tego genu obejmują DKFZP564D0478, RP11-4K3__A.4, C1orf160 i MGC111002. Numer dostępu NM_032125.2, najdłuższa sekwencja kodująca (1629 bp), koduje białko o 208 resztach aminokwasowych (23230 daltonów), które jest uważane za konsensusową sekwencję kodującą (CCDS297.2). Istnieją dwie izoformy białka kodowanego przez ten gen. Są podobne, z wyjątkiem drugiego (Q9H0R3-2) pozbawionego pierwszych 96 reszt aminokwasowych, które są obecne w pierwszym (Q9H0R3-1).
Ekspresja genu
ACEVIEW oznaczył TMEM222 jako wysoce ekspresjonowany z 3,8 razy większą ekspresją niż przeciętny gen w bazie danych. Istnieją dowody na ekspresję ze 166 tkanek, w tym mózgu, płuc, okrężnicy, nerki i łożyska.
Homologia
Ortologi i odległe homologi ludzkiego TMEM222 zidentyfikowano w całej Eukarioncie, zwłaszcza u roślin i zwierząt. W ludzkim genomie nie znaleziono paralogów tego genu.
Odległy homolog TMEM222, RTH (RTE1-Homolog), jest homologiem RTE1 (Reversion-to-Ethylene Perception 1), o którym wiadomo, że indukuje zmiany konformacyjne w ETR1 (receptor etylenu 1), co skutkuje ujemną regulacją odpowiadającą utracie percepcji etylenu.
Interakcje białek
dowody z dwóch hybrydowych badań przesiewowych drożdży na interakcje dwóch białek z tym genem. Jednym z nich jest proteaza serynowa ( PRSS23 ), która została zidentyfikowana jako zaangażowana w mysią owulację i jest wydzielana do macierzy pozakomórkowej. Drugim białkiem jest ab-hydrolaza (transkrypt 5 związany z HLA-B), która jest integralna z błoną, a odpowiadający jej gen znajduje się w genomie w pobliżu czynnika martwicy nowotworu (TNF)-alfa i TNF-beta.
Dalsza lektura
Maruyama K, Sugano S (1994). „Oligo-capping: prosta metoda zastąpienia struktury czapeczki eukariotycznych mRNA oligorybonukleotydami”. gen . 138 (1–2): 171–4. doi : 10.1016/0378-1119(94)90802-8 . PMID 8125298 .
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K i in. (1997). „Konstrukcja i charakterystyka biblioteki cDNA wzbogaconej o pełnej długości i wzbogaconej o koniec 5'”. gen . 200 (1–2): 149–56. doi : 10.1016/S0378-1119(97)00411-3 . PMID 9373149 .
Lehner B, Semple JI, Brown SE i in. (2004). „Analiza dwuhybrydowego systemu drożdży o dużej przepustowości i jego zastosowanie do przewidywania funkcji białek wewnątrzkomórkowych kodowanych w ludzkim regionie MHC klasy III”. Genomika . 83 (1): 153–67. doi : 10.1016/S0888-7543(03)00235-0 . PMID 14667819 .
