Nadrodzina czynnika martwicy nowotworu

Nadrodzina czynnika martwicy nowotworu
Mouse Tumor Necrosis Factor Alpha.png
Trimeryczna struktura TNF alfa, wytwarzana przez Mus musculus , oparta na strukturze PDB 2TNF (rozdzielczość 1,4 Å). Różne kolory reprezentują różne monomery. Baeyens, KJ i in. (1999). Rysunek renderowany przy użyciu FirstGlance Jmol.
Identyfikatory
Symbol TNF
Pfam PF00229
InterPro IPR006052
PROZYTA PDOC00224
SCOP2 1tnf / ZAKRES / SUPFAM
Nadrodzina OPM 292
Białko OPM 2hej
Błona 80
Dostępne struktury białek:
Pfam   konstrukcje / ECOD  
WPB RCSB WPB ; PDBe ; WPBj
Suma WPB podsumowanie struktury
TNF
identyfikatorów
PDB 1du3 EBI.jpg
trail-sdr5
Symbol TNF
Pfam PF00229
Klan Pfam CL0100
InterPro IPR006052
PROZYTA PDOC00561
SCOP2 1tnr / SCOPe / SUPFAM
Dostępne struktury białek:
Pfam   konstrukcje / ECOD  
WPB RCSB WPB ; PDBe ; WPBj
Suma WPB podsumowanie struktury

Nadrodzina czynnika martwicy nowotworu ( TNF ) jest nadrodziną białek transbłonowych białek typu II , zawierających domenę homologii TNF i tworzących trimery . Członkowie tej nadrodziny mogą być uwalniani z błony komórkowej przez zewnątrzkomórkowe cięcie proteolityczne i działać jako cytokiny . Białka te ulegają ekspresji głównie w komórkach odpornościowych i regulują różnorodne funkcje komórkowe, w tym odpowiedź immunologiczną i zapalenie, ale także proliferację, różnicowanie, apoptozę i embriogenezę .

Nadrodzina zawiera 19 członków, którzy wiążą się z 29 członkami nadrodziny receptora TNF . Występowanie ortologów u bezkręgowców wskazuje na starożytne pochodzenie tej nadrodziny w ewolucji.

Wzór PROSITE tej nadrodziny znajduje się w arkuszu beta w centralnej części białka, które jest konserwowane u wszystkich członków.

Członkowie

Jest 19 członków rodziny, sklasyfikowanych numerycznie jako TNFSF #, gdzie # oznacza numer członka, po którym czasami następuje litera.

TNFSF# Nazwa Synonimy Gen Funkcjonować
1 Limfotoksyna alfa TNFβ, TNFSF1B LTA Indukcja stanu zapalnego i odpowiedzi przeciwwirusowej, rozwój wtórnych narządów limfatycznych , rola w powstawaniu nowotworów
2 Czynnik martwicy nowotworu TNFα, Dif, Nekrozyna, TNFSF1A, ... TNF Regulacja komórek odpornościowych, indukcja gorączki , wyniszczenia , stanu zapalnego i apoptozy , hamowanie nowotworzenia i replikacji wirusa oraz odpowiedź na sepsę
3 Lymfotoksyna beta TNFγ LTB Indukcja stanu zapalnego i odpowiedzi przeciwwirusowej, rozwój wtórnych narządów limfatycznych , rola w powstawaniu nowotworów
4 Ligand OX40 CD252, Gp34, CD134L TNFSF4 Aktywacja odpowiedzi immunologicznej komórek T przez kostymulację komórek T
5 ligand CD40 CD154, TRAP, Gp39, T-BAM CD40LG Regulacja adaptacyjnej odpowiedzi immunologicznej poprzez aktywację komórki prezentującej antygen
6 Ligand Fas CD178, APTL, CD95L FASLG Regulacja homeostazy limfocytów T poprzez indukcję apoptozy
7 ligand CD27 CD70 CD70 Regulacja aktywacji limfocytów B i homeostazy limfocytów T
8 ligand CD30 CD153 TNFSF8 Indukcja apoptozy limfocytów T i B , zapobieganie autoimmunizacji
9 ligand CD137 4-1 BBL TNFSF9
10 Ligand indukujący apoptozę związany z TNF CD253, APO-2L TNFSF10 Hamowanie powstawania nowotworów , indukcja apoptozy
11 Aktywator receptora liganda czynnika jądrowego kappa-Β CD254, OPGL, TRANCE, ODF TNFSF11 Wzrost tkanek (zwłaszcza regeneracja i przebudowa kości), dojrzewanie komórek dendrytycznych
12 Słaby induktor apoptozy związany z TNF APO-3L, DR3L TNFSF12 Regulacja angiogenezy , indukcja apoptozy
13 Ligand indukujący proliferację CD256, WYSOKI-2, TRDL1 TNFSF13 Regulacja rozwoju komórek B i przeżycia komórek plazmatycznych
13B Czynnik aktywujący komórki B CD257, BLyS, TALL-1, TNFSF20, ... TNFSF13B Stymulacja proliferacji i różnicowania komórek B
14 ŚWIATŁO CD258, HVEML TNFSF14 Stymulacja proliferacji limfocytów T , regulacja apoptozy
15 Inhibitor wzrostu śródbłonka naczyń TL1, TL-1A TNFSF15 Hamowanie angiogenezy
18 Członek nadrodziny TNF 18 GITRL, AITRL, TL-6 TNFSF18 Regulacja przeżywalności komórek T
19 ektodysplasyna A ED1-A1, ED1-A2 EDA Rozwój tkanek ektodermalnych
Ten artykuł zawiera tekst z domeny publicznej Pfam i InterPro : IPR006052

Linki zewnętrzne