VPS4B

VPS4B
Dostępne konstrukcje
WPB	Wyszukiwanie ortologów:
Lista kodów identyfikacyjnych PDB
Identyfikatory
	, SKD1, SKD1B, VPS4-2, MIG1, sortowanie białek wakuolowych 4 homologi B
Identyfikatory zewnętrzne
Lokalizacja genu ( człowiek )
Chr.
Koniec
Lokalizacja genu ( mysz )
Chr.
Koniec
Wzór ekspresji RNA
Ontologia genów
Funkcje molekularne
Składnik komórkowy
Proces biologiczny
	Źródła: Amigo / QuickGO
ortologi
	Wikidane
Wyświetl/edytuj człowieka	Wyświetl/edytuj mysz

Białko 4B związane z sortowaniem białek wakuolowych jest białkiem , które u ludzi jest kodowane przez gen VPS4B .

Białko kodowane przez ten gen należy do rodziny białek AAA (ATPazy związane z różnymi aktywnościami komórkowymi) i jest homologiem drożdżowego białka Vps4.

U ludzi zidentyfikowano dwa paralogi białka drożdży . Dzielą one ze sobą wysoki stopień podobieństwa sekwencji aminokwasów , a także z drożdżowymi białkami Vps4 i mysimi. Badania funkcjonalne wskazują, że oba ludzkie paralogi łączą się z przedziałami endosomalnymi i biorą udział w wewnątrzkomórkowym transporcie białek, podobnie jak białko Vps4 w drożdżach. Gen kodujący ten paralog został zmapowany na chromosomie 18 ; gen dla drugiego ( VPS4A ) znajduje się na chromosom 16 .

Dalsza lektura

Périer F, Coulter KL, Liang H i in. (1994). „Identyfikacja nowego członka rodziny ssaków NSF/CDC48p/Pas1p/TBP-1 poprzez ekspresję heterologiczną w drożdżach” . FEBS Lett . 351 (2): 286–90. doi : 10.1016/0014-5793(94)00879-5 . PMID 8082782 . S2CID 31778093 .
Mao M, Fu G, Wu JS i in. (1998). „Identyfikacja genów ulegających ekspresji w ludzkich hematopoetycznych komórkach macierzystych/progenitorowych CD34+ za pomocą eksprymowanych znaczników sekwencji i wydajnego klonowania pełnej długości cDNA” . proc. Natl. Acad. nauka USA . 95 (14): 8175–80. Bibcode : 1998PNAS...95.8175M . doi : 10.1073/pnas.95.14.8175 . PMC 20949 . PMID 9653160 .
Scheuring S, Bodor O, Röhricht RA, et al. (1999). „Klonowanie, charakteryzacja i funkcjonalna ekspresja genu Mus musculus SKD1 w drożdżach pokazuje, że mysie geny SKD1 i drożdżowe VPS4 są ortologami i biorą udział w wewnątrzkomórkowym handlu białkami”. gen . 234 (1): 149–59. doi : 10.1016/S0378-1119(99)00163-8 . PMID 10393249 .
Biskup N, Woodman P (2000). „ATPaza-deficytowy VPS4 ssaków lokalizuje się w nieprawidłowych endosomach i upośledza handel cholesterolem” . Mol. Biol. komórka . 11 (1): 227–39. doi : 10.1091/mbc.11.1.227 . PMC 14770 . PMID 10637304 .
Zhang QH, Ye M, Wu XY i in. (2001). „Klonowanie i analiza funkcjonalna cDNA z otwartymi ramkami odczytu dla 300 wcześniej niezdefiniowanych genów wyrażanych w hematopoetycznych komórkach macierzystych / progenitorowych CD34 +” . Genom Res . 10 (10): 1546–60. doi : 10.1101/gr.140200 . PMC 310934 . PMID 11042152 .
Howard TL, Stauffer DR, Degnin CR, Hollenberg SM (2002). „CHMP1 działa jako członek nowo zdefiniowanej rodziny białek transportujących pęcherzyki”. J. Cell Sci . 114 (Pt 13): 2395–404. doi : 10.1242/jcs.114.13.2395 . PMID 11559748 .
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH i in. (2003). „Generowanie i wstępna analiza ponad 15 000 pełnej długości sekwencji cDNA człowieka i myszy” . proc. Natl. Acad. nauka USA . 99 (26): 16899–903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M . doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932 .
Beyer A, Scheuring S, Müller S i in. (2003). „Porównawcze analizy sekwencji i ekspresji czterech genów VPS4 ssaków”. gen . 305 (1): 47–59. doi : 10.1016/S0378-1119(02)01205-2 . PMID 12594041 .
Strack B, Calistri A, Craig S i in. (2003). „AIP1 / ALIX jest partnerem wiążącym dla HIV-1 p6 i EIAV p9 funkcjonującym podczas pączkowania wirusa” . komórka . 114 (6): 689–99. doi : 10.1016/S0092-8674(03)00653-6 . PMID 14505569 . S2CID 10733770 .
von Schwedler UK, Stuchell M, Müller B i in. (2003). „Sieć białkowa pączkowania HIV” . komórka . 114 (6): 701–13. doi : 10.1016/S0092-8674(03)00714-1 . PMID 14505570 . S2CID 16894972 .
Fujita H, Umezuki Y, Imamura K i in. (2005). „Białka Vps ssaków klasy E, SBP1 i mVps2 / CHMP2A, oddziałują i regulują funkcję AAA-ATPazy SKD1 / Vps4B” . J. Cell Sci . 117 (cz. 14): 2997–3009. doi : 10.1242/jcs.01170 . PMID 15173323 .
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA i in. (2004). „Stan, jakość i ekspansja projektu cDNA pełnej długości NIH: kolekcja genów ssaków (MGC)” . Genom Res . 14 (10B): 2121-7. doi : 10.1101/gr.2596504 . PMC 528928 . PMID 15489334 .
Katoh K, Suzuki H, Terasawa Y i in. (2006). „Penta-EF-ręczne białko ALG-2 oddziałuje bezpośrednio ze składnikiem ESCRT-I TSG101, a Ca2 + zależnie kolokalizuje się w nieprawidłowych endosomach z dominującą ujemną ATPazą AAA SKD1 / Vps4B” . Biochem. J. _ 391 (cz. 3): 677–85. doi : 10.1042/BJ20050398 . PMC 1276969 . PMID 16004603 .
Takasu H, Jee JG, Ohno A i in. (2005). „Charakterystyka strukturalna domeny MIT z ludzkiego Vps4b”. Biochem. Biofiza. Rez. Komuna . 334 (2): 460–5. doi : 10.1016/j.bbrc.2005.06.110 . PMID 16018968 .
Scott A, Chung HY, Gonciarz-Świątek M, et al. (2005). „Badania strukturalne i mechanistyczne białek VPS4” . EMBO J. 24 (20): 3658–69. doi : 10.1038/sj.emboj.7600818 . PMC 1276703 . PMID 16193069 .
Kimura K, Wakamatsu A, Suzuki Y i in. (2006). „Zróżnicowanie modulacji transkrypcji: identyfikacja i charakterystyka na dużą skalę przypuszczalnych alternatywnych promotorów ludzkich genów” . Genom Res . 16 (1): 55–65. doi : 10.1101/gr.4039406 . PMC 1356129 . PMID 16344560 .
Welsch S, Habermann A, Jäger S i in. (2007). „Analiza ultrastrukturalna białek ESCRT sugeruje rolę błon kanalikowo-pęcherzykowych związanych z endosomami w funkcji ESCRT” . Ruch . 7 (11): 1551–66. doi : 10.1111/j.1600-0854.2006.00489.x . PMID 17014699 .
Olsen JV, Blagoev B, Gnad F i in. (2006). „Globalna, in vivo i specyficzna dla miejsca dynamika fosforylacji w sieciach sygnalizacyjnych” . komórka . 127 (3): 635–48. doi : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . PMID 17081983 . S2CID 7827573 .
Lambert C, Döring T, Prange R (2007). „Dojrzewanie wirusa zapalenia wątroby typu B jest wrażliwe na funkcjonalne hamowanie ESCRT-III, Vps4 i γ2-adaptyny” . J. Wirol . 81 (17): 9050–60. doi : 10.1128/JVI.00479-07 . PMC 1951427 . PMID 17553870 .