Wirus Yokose
| Wirus Yokose | |
|---|---|
| Klasyfikacja wirusów | |
| (nierankingowe): | Wirus |
| królestwo : | Rybowiria |
| Królestwo: | Orthornawirusy |
| Gromada: | Kitrinoviricota |
| Klasa: | Flasuviricetes |
| Zamówienie: | amarillowirusy |
| Rodzina: | Flaviviridae |
| Rodzaj: | Flawiwirus |
| Gatunek: |
Wirus Yokose
|
| Synonimy . | |
|
Wirus Yokase |
|
Wirus Yokose (YOKV) należy do rodzaju Flavivirus z rodziny Flaviviridae . Flaviviridae często występują u stawonogów , takich jak komary i kleszcze, a także mogą zarażać ludzi. Rodzaj Flavivirus obejmuje ponad 50 znanych wirusów, w tym żółtą febrę , wirus Zachodniego Nilu , wirus Zika i japońskie zapalenie mózgu . Wirus Yokose to nowy członek rodziny Flavivirus, który został zidentyfikowany tylko u kilku gatunków nietoperzy. Nietoperze są kojarzone z kilkoma pojawiającymi się chorobami odzwierzęcymi chorób takich jak Ebola i SARS.
Klasyfikacja wirusów
.jpg)
Wirus Yokose należy do rodzaju Flavivirus z rodziny Flaviviridae . Został zidentyfikowany w 1971 roku w Yokosuka na wyspie Kiusiu w Japonii. Szczep Oita-36 wyizolowano z gatunku nietoperza Miniopterus fuliginosus . Molekularna analiza genetyczna wykazała, że wirus Yokose jest nowym członkiem rodzaju Flavivirus. Flawiwirusy są zwykle podzielone na trzy grupy: przenoszone przez komary, przenoszone przez kleszcze i niewektorowe. Wirus Yokose jest klasyfikowany jako NKV, czyli nieznany wektor. Oznacza to, że nie ma znanego wektora stawonogów. Istnieją jednak dowody sugerujące, że może zarażać stawonogi, a mianowicie za pośrednictwem komarów. Stwierdzono, że wirus Yokose jest genetycznie zbliżony do wirusa żółtej gorączki, a sekwencje aminokwasowe wykazują bliską identyfikację z wirusem Entebbe Bat .
Struktura i genom wirusa
Wirus Yokose jest jednoniciowym wirusem RNA o pozytywnym sensie . Jest otoczony i ma symetrię dwudziestościenną z liczbą triangulacji (T) z 3. Ma około 50 nm średnicy. Genom jest niesegmentowany i zawiera 10 857 nukleotydów. Istnieje jedna otwarta ramka odczytu (ORF) poliproteiny o długości 3425 aminokwasów, która koduje trzy białka strukturalne i osiem białek niestrukturalnych. Białka strukturalne obejmują kapsyd (C), przedbłonę / błonę (prM) i otoczkę (E). Białka niestrukturalne obejmują NS1, NS2A, NS2B, NS3, NS4A, 2K, NS4B i NS5. Białko 2K nie występuje w wielu innych flawiwirusach. NS3 działa jako proteaza i helikaza . NS5 działa jako polimeraza RNA zależna od RNA . NS1 jest ważny w procesie replikacji wirusa. NS2A oddziałuje z NS3 i NS5, pomaga w składaniu wirusa i rekrutuje wirusowy genom RNA do kompleksu replikacyjnego związanego z błoną. Struktury drugorzędowe utworzone przez 5' i 3' regionu nietranslacyjnego (NTR) wpływają na transkrypcję i translację. Wirus Yokose ma motyw CS1 w 3' NTR, który jest konserwowany we flawiwirusach przenoszonych przez komary, co sugeruje zdolność do infekowania stawonogów.
Cykl replikacji
Wejście do celi
Wirusowe białko otoczki (E) przyłącza się do receptorów komórki gospodarza i jest pobierane do komórki poprzez endocytozę . Białko otoczki przechodzi następnie zmianę konformacyjną w endosomie pod wpływem kwaśnej natury endosomu. Białko otoczki i błona endosomalna łączą się, a wirus jest uwalniany do cytoplazmy. [ potrzebne źródło ]
Replikacja i transkrypcja
Wirusowy RNA jest tłumaczony na poliproteinę , a następnie cięty przez proteazy wirusowe i komórkowe na białka strukturalne (C, prM i E) i niestrukturalne (NS1, NS2A, NS2B, NS3, NS4A, 2K, NS4B i NS5) . Replikacja zachodzi na powierzchni retikulum endoplazmatycznego w pęcherzykach błonowych. Komplementarna nić RNA o ujemnym sensie jest tworzona przez polimerazę RNA zależną od RNA (białko niestrukturalne NS5), tworząc dwuniciowy RNA. dsRNA ulega transkrypcji, tworząc wirusowe mRNA . [ potrzebne źródło ]
Montaż i wydanie
Wirus gromadzi się w retikulum endoplazmatycznym . Powstaje nukleokapsyd , który pobiera wirusowe glikoproteiny . Jednak bardzo niewiele wiadomo na temat procesu składania Flawiwirusów. Dowody sugerują, że kilka białek niestrukturalnych, takich jak NS2A, przyczynia się do składania. Złożona wizja pąkuje następnie do aparatu Golgiego , gdzie białko prM jest rozszczepiane, co prowadzi do dojrzewania. Wirus jest następnie uwalniany z komórki poprzez egzocytozę i infekuje inne komórki gospodarza. [ potrzebne źródło ]
.jpg)
Gospodarz i lokalizacja
Wiele nie wiadomo na temat patogenności i zjadliwości wirusa Yokose, w tym u nietoperzy. Stwierdzono, że szczep XYBX1332 wyizolowany w Chinach powoduje efekty cytopatyczne w komórkach ssaków. W badaniu nietoperzy owocożernych zakażonych wirusem Yokose nie zaobserwowali żadnych klinicznych objawów choroby.
Obecnie zidentyfikowano tylko gatunki nietoperzy przenoszące szczepy wirusa Yokose. Szczep Oita-36 został wyizolowany z gatunku nietoperza Miniopterus fuliginosus i jest obecnie głównym szczepem wirusa Yokose. Został zidentyfikowany na wyspie Kiusiu u wybrzeży Japonii. Wirus Yokose nie ogranicza się geograficznie do wysp japońskich, ale został wyizolowany również w Chinach. Szczep XYBX1332 wyizolowano z gatunku nietoperza Myotis daubentonii w prowincji Yunnan w Chinach. Jednak ten szczep ma różnice genomowe w porównaniu z oryginalnym szczepem Oita-36 i należy przeprowadzić dalsze badania, aby stwierdzić, czy jest to nowy gatunek flawiwirusa. Przeciwciała przeciwko wirusowi Yokose znaleziono również u nietoperzy owocożernych Rousettus leschenaultii na Filipinach iw Malezji. Pokazuje to, że wirus Yokose nie ogranicza się geograficznie do wysp japońskich, ale może również występować na obszarach śródlądowych Azji.
Jak dotąd nie odnotowano przypadków zakażenia wirusem Yokose u ludzi ani u innych zwierząt. Naukowcy odkryli, że Yokose można manipulować, aby infekować ludzkie komórki i reagować na przeciwciała innego Flawiwirusa obecnego w komórkach. Stwierdzono, że szczepienie przeciwko żółtej febrze było skuteczne w neutralizowaniu wirusa Yokose w ludzkich komórkach.
Patogeniczność i wirulencja
Wiele nie wiadomo na temat patogenności i wirulencji wirusa Yokose. Stwierdzono, że szczep XYBX1332 wyizolowany w Chinach powoduje efekty cytopatyczne w komórkach ssaków. W badaniu nietoperzy owocożernych zakażonych wirusem Yokose nie zaobserwowali żadnych klinicznych objawów choroby. Jednak badanie przeprowadzone na płucnych nietoperzy i komórkach nerki wykazało, że infekcja wirusem Yokose doprowadziła do replikacji wirusa i śmierci komórek wkrótce potem.