czynnik transkrypcyjny Gal4
| Białko regulacyjne GAL4 | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Identyfikatory | |||||||
| Organizm | |||||||
| Symbol | GAL4 | ||||||
| Entrez | 855828 | ||||||
| UniProt | P04386 | ||||||
| |||||||
Czynnik transkrypcyjny Gal4 jest pozytywnym regulatorem ekspresji genów indukowanych galaktozą. Białko to reprezentuje dużą grzybową rodzinę czynników transkrypcyjnych, rodzinę Gal4, która obejmuje ponad 50 członków w drożdżach Saccharomyces cerevisiae , np. Oaf1, Pip2, Pdr1, Pdr3, Leu3.
Gal4 rozpoznaje geny za pomocą UAS G , górnej sekwencji aktywującej i aktywuje je. W komórkach drożdży głównymi celami są GAL1 ( galaktokinaza ), GAL10 ( 4-epimeraza UDP-glukozy ) i GAL7 ( urydylotransferaza galaktozo-1-fosforanu ), trzy enzymy wymagane do metabolizmu galaktozy. To wiązanie okazało się również przydatne w konstruowaniu systemu GAL4/UAS , technice kontrolowania ekspresji u owadów. W drożdżach Gal4 jest domyślnie tłumiony przez Gal80 i aktywowany w obecności galaktozy , gdy Gal3 wiąże Gal80.
Domeny
Dwie domeny wykonawcze, domeny wiążące i aktywujące DNA, zapewniają kluczową funkcję białka Gal4 zgodnego z większością czynników transkrypcyjnych.
Wiązanie DNA
N-koniec Gal4 jest palcem cynkowym i należy do rodziny grzybów Zn(2)-C6 . Tworzy klaster tiolanowy Zn – cysteiny i specyficznie rozpoznaje UAS G w promotorze GAL1.
Transaktywacja Gal4
domen transaktywacyjnych dziewięciu aminokwasów , 9aaTAD, razem z Oaf1, Pip2, Pdr1, Pdr3, ale także p53 , E2A , MLL .
Rozporządzenie
Galaktoza indukuje transkrypcję, w której pośredniczy Gal4, chociaż glukoza powoduje poważną represję.
Jako część regulacji Gal4, hamujące białko Gal80 rozpoznaje i wiąże się z regionem Gal4 (853-874 aa).
Białko hamujące Gal80 jest sekwestrowane przez białko regulatorowe Gal3 w sposób zależny od galaktozy. Pozwala to Gal4 działać, gdy jest galaktoza.
Mutanty
Mutant gal4-64 z utratą funkcji Gal4 (1-852 aa, delecja 29 aa C-końca Gal4) utracił zarówno interakcję z Gal80, jak i funkcję aktywacji.
W odwróconym mutancie Gal4, mutancie Gal4C-62, pojawiła się sekwencja (QTAY N AFMN) ze wzorem 9aaTAD i przywrócona funkcja aktywacji białka Gal4.
Nieaktywne konstrukcje
Domena aktywacyjna Gal4 jest hamowana przez domenę C-końcową w niektórych konstruktach Gal4.
Funkcjonować
Cel
Transkrypcja
W funkcji aktywacji Gal4 pośredniczy MED15 (Gal11).
Białko Gal4 oddziałuje również z innymi mediatorami transkrypcji, takimi jak kompleks Tra1, TAF9 i SAGA/MED15.
Proteosom
Podjednostka białka regulacyjnego proteasomu 26 S Sug2 ma molekularne i funkcjonalne oddziaływanie z funkcją Gal4. Proteolityczny obrót czynnika transkrypcyjnego Gal4 nie jest wymagany do funkcjonowania in vivo. Natywna monoubikwitynacja Gal4 chroni przed destabilizacją za pośrednictwem 19S w warunkach indukujących.
Aplikacja
Szerokie zastosowanie Gal4 polega na skriningu dwuhybrydowym drożdży w celu przeszukiwania lub oznaczania interakcji białko-białko w komórkach eukariotycznych od drożdży do człowieka.
W systemie GAL4/UAS białko Gal4 i górny region aktywujący Gal4 (UAS) są wykorzystywane do badania ekspresji i funkcji genów w organizmach takich jak muszka owocowa.
Gal4 i białko hamujące Gal80 znalazły zastosowanie w technice genetycznej do tworzenia indywidualnie znakowanych komórek homozygotycznych zwanych MARCM (Analiza mozaikowa z represyjnym markerem komórkowym).
Zobacz też
Dalsza lektura
- Gal4p na WikiGenes
- Traven A, Jelicic B, Sopta M (maj 2006). „Drożdże Gal4: powtórka paradygmatu transkrypcji” . Raporty EMBO . 7 (5): 496–9. doi : 10.1038/sj.embor.7400679 . PMC 1479557 . PMID 16670683 .