ADARB1

ADARB1
Dostępne konstrukcje WPB Wyszukiwanie ortologów: Lista kodów identyfikacyjnych PDB
Identyfikatory
	, ADAR2, DRABA2, DRADA2, RED1, deaminaza adenozynowa, specyficzna dla RNA B1, deaminaza adenozynowa specyficzna dla RNA B1, NEDHYMS
Identyfikatory zewnętrzne
Lokalizacja genu ( człowiek ) Chr. Zespół Początek Koniec
Lokalizacja genu ( mysz ) Chr. Zespół Początek Koniec
Wzór ekspresji RNA Błagam Człowiek Mysz (ortolog) BioGPS
Ontologia genów Funkcje molekularne Składnik komórkowy Proces biologiczny Źródła: Amigo / QuickGO
ortologi Gatunek Człowiek Mysz Entrez Ensembl UniProt RefSeq (mRNA) RefSeq (białko) Lokalizacja (UCSC) PubMed search
Wikidane
Wyświetl/edytuj człowieka Wyświetl/edytuj mysz

Edytaza 1 specyficzna dla dwuniciowego RNA jest enzymem kodowanym u ludzi przez gen ADARB1 . Enzym należy do ADAR .

Funkcjonować

Gen ten koduje enzym odpowiedzialny za edycję pre-mRNA podjednostki B receptora glutaminianu poprzez specyficzną dla miejsca deaminację adenozyn . Badania na szczurach wykazały, że enzym ten działał na własne pre-mRNA , przekształcając dinukleotyd AA w dinukleotyd AI, co skutkowało powstaniem nowego miejsca składania . Alternatywny splicing tego genu skutkuje kilkoma wariantami transkryptu, z których niektóre charakteryzowały się obecnością lub brakiem wstawki kasety Alu oraz krótkiej lub długiej C-końcowy .

ADARB1 wymaga małocząsteczkowego heksakisfosforanu inozytolu (IP ₆ ) do prawidłowego funkcjonowania. ADARB1 to edytujący RNA A-to-I , który działa głównie na substraty kodujące białka.

Zobacz też

• Deaminaza adenozyny (ADA), enzym działający na wyizolowaną adenozynę

Dalsza lektura

•    Valenzuela A, Blanco J, Callebaut C, Jacotot E, Lluis C, Hovanessian AG, Franco R (1997). „Gp120 otoczki wirusa HIV-1 i cząsteczki wirusa blokują wiązanie deaminazy adenozyny z ludzkim CD26” . Peptydazy komórkowe w funkcjach i chorobach układu odpornościowego . Postępy w medycynie eksperymentalnej i biologii . Tom. 421. s. 185–92. doi : 10.1007/978-1-4757-9613-1_24 . ISBN 978-1-4757-9615-5 . PMID 9330696 .
•    Melcher T, Maas S, Herb A, Sprengel R, Seeburg PH, Higuchi M (luty 1996). „Enzym edytujący RNA ssaków”. Natura . 379 (6564): 460–4. Bibcode : 1996Natur.379..460M . doi : 10.1038/379460a0 . PMID 8559253 . S2CID 4326456 .
•   O'Connell MA, Gerber A, Keller W (styczeń 1997). „Oczyszczanie ludzkiej dwuniciowej RNA-specyficznej editazy 1 (hRED1) zaangażowanej w edycję pre-mRNA receptora glutaminianu B mózgu” . Journal of Biological Chemistry . 272 (1): 473–8. doi : 10.1074/jbc.272.1.473 . PMID 8995285 .
•   Valenzuela A, Blanco J, Callebaut C, Jacotot E, Lluis C, Hovanessian AG, Franco R (kwiecień 1997). „Wiązanie deaminazy adenozyny z ludzkim CD26 jest hamowane przez glikoproteinę otoczki HIV-1 gp120 i cząsteczki wirusa”. Journal of Immunology . 158 (8): 3721–9. PMID 9103436 .
•    Lai F, Chen CX, Carter KC, Nishikura K (maj 1997). „Edycja RNA kanału jonowego podjednostki receptora glutaminianu B przez cztery dwuniciowe deaminazy adenozynowe RNA DRADA2 składane alternatywnie” . Biologia molekularna i komórkowa . 17 (5): 2413–24. doi : 10.1128/MCB.17.5.2413 . PMC 232090 . PMID 9111310 .
•    Yang JH, Sklar P, Axel R, Maniatis T (kwiecień 1997). „Oczyszczanie i charakterystyka ludzkiej deaminazy adenozynowej RNA do edycji pre-mRNA receptora glutaminianu B” . Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 94 (9): 4354–9. Bibcode : 1997PNAS...94.4354Y . doi : 10.1073/pnas.94.9.4354 . PMC20726 . _ PMID 9113993 .
•    Gerber A, O'Connell MA, Keller W (maj 1997). „Dwie formy ludzkiej dwuniciowej RNA-specyficznej editazy 1 (hRED1) generowanej przez wstawienie kasety Alu” . RNA . 3 (5): 453–63. PMC 1369496 . PMID 9149227 .
•    Villard L, Tassone F, Haymowicz M, Welborn R, Gardiner K (marzec 1997). „Lokalizacja na mapie, organizacja genomu i wzorce ekspresji ludzkiej edycjiazy RNA RED1”. Genetyka komórek somatycznych i molekularnych . 23 (2): 135–45. doi : 10.1007/BF02679972 . PMID 9330641 . S2CID 45104326 .
•    Blanco J, Valenzuela A, Herrera C, Lluís C, Hovanessian AG, Franco R (lipiec 2000). „Gp120 HIV-1 hamuje wiązanie deaminazy adenozyny z CD26 przez mechanizm modulowany przez ekspresję CD4 i CXCR4” . Listy FEBS . 477 (1–2): 123–8. doi : 10.1016/S0014-5793(00)01751-8 . PMID 10899322 . S2CID 22229481 .
•   Herrera C, Morimoto C, Blanco J, Mallol J, Arenzana F, Lluis C, Franco R (czerwiec 2001). „Komodulacja CXCR4 i CD26 w ludzkich limfocytach” . Journal of Biological Chemistry . 276 (22): 19532–9. doi : 10.1074/jbc.M004586200 . PMID 11278278 .
•    Maas S, Patt S, Schrey M, Rich A (grudzień 2001). „Niedopracowanie mRNA receptora glutaminianu GluR-B w glejakach złośliwych” . Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 98 (25): 14687–92. Bibcode : 2001PNAS...9814687M . doi : 10.1073/pnas.251531398 . PMC 64742 . PMID 11717408 .
•    Jayan GC, Casey JL (kwiecień 2002). „Zwiększona edycja RNA i hamowanie replikacji wirusa zapalenia wątroby typu delta przez wysoki poziom ekspresji ADAR1 i ADAR2” . Dziennik wirusologii . 76 (8): 3819–27. doi : 10.1128/JVI.76.8.3819-3827.2002 . PMC 136091 . PMID 11907222 .
•   Jaikaran DC, Collins CH, MacMillan AM (październik 2002). „Edycja adenozyny do inozyny przez ADAR2 wymaga utworzenia trójskładnikowego kompleksu w miejscu GluR-B R / G” . Journal of Biological Chemistry . 277 (40): 37624–9. doi : 10.1074/jbc.M204126200 . PMID 12163487 .
•    Jayan GC, Casey JL (grudzień 2002). „Hamowanie edycji RNA wirusa zapalenia wątroby typu delta przez krótkie hamowanie, w którym pośredniczy RNA, knockdown ADAR1, ale nie ADAR2” . Dziennik wirusologii . 76 (23): 12399–404. doi : 10.1128/JVI.76.23.12399-12404.2002 . PMC 136899 . PMID 12414985 .
•   Slavov D, Gardiner K (październik 2002). „Filogenetyczne porównanie genów i transkryptów pre-mRNA deaminazy adenozynowej ADAR2: konserwacja i różnorodność w sekwencji miejsca edycji i alternatywnych wzorach splicingu”. gen . 299 (1–2): 83–94. doi : 10.1016/S0378-1119(02)01016-8 . PMID 12459255 .

Linki zewnętrzne

• Lokalizacja ludzkiego genomu ADARB1 i strona szczegółów genu ADARB1 w przeglądarce genomu UCSC .