ALOX15B

ALOX15B
Dostępne konstrukcje WPB Wyszukiwanie ortologów: Lista kodów identyfikacyjnych PDB
Identyfikatory
	, 15-LOX-2, 15-lipoksygenaza arachidonianowa, typ B, 15-lipoksygenaza arachidonianowa typ B
Identyfikatory zewnętrzne
Lokalizacja genu ( człowiek ) Chr. Zespół Początek Koniec
Lokalizacja genu ( mysz ) Chr. Zespół Początek Koniec
Wzór ekspresji RNA Błagam Człowiek Mysz (ortolog) BioGPS
Ontologia genów Funkcja molekularna Komponent komórkowy Proces biologiczny Źródła: Amigo / QuickGO
ortologi Gatunek Człowiek Mysz Entrez Ensembl UniProt RefSeq (mRNA) RefSeq (białko) Lokalizacja (UCSC) PubMed search
Wikidane
Wyświetl/edytuj człowieka Wyświetl/edytuj mysz

Arachidonian 15-lipoksygenazy typu II jest enzymem , który u ludzi jest kodowany przez gen ALOX15B . ALOX15B, znany również jako 15-lipoksygenaza-2 ( 15-LO-2 lub 15-LOX-2 ), różni się od pokrewnej oksygenazy, ALOX15 lub 15-lipoksygenazy-1.

Funkcjonować

Gen ten koduje członka rodziny lipooksygenaz strukturalnie pokrewnych niehemowych dioksygenaz żelaza zaangażowanych w wytwarzanie wodoronadtlenków kwasów tłuszczowych. 15-LOX-2 ma 38-39% identyczności sekwencji aminokwasowej z ludzką 15-LOX-1 i 12-lipoksygenazą oraz 44% identyczności sekwencji aminokwasowej z ludzką 5-lipoksygenazą . 15-LOX-2 przekształca kwas arachidonowy prawie wyłącznie w stereoizomer S kwasu 15-hydroksyoperoksyikozatetraenowego, który jest zwykle redukowany do stereoizomeru S kwasu 15-hydroksyeikozatetraenowego przez wszechobecne komórki peroksydazy ; mniej skutecznie metabolizuje kwas linolowy, przekształcając ten kwas tłuszczowy w S kwasu 13-hydronadtlenooktadekadienowego, który podobnie jest szybko redukowany do stereoizomeru S kwasu 13-hydroksyoktadekadienowego . Gen ALOX15B znajduje się w klastrze pokrewnych genów i pseudogenie, który obejmuje około 100 kilozasad na krótkim ramieniu chromosomu 17. Opisano alternatywne warianty transkryptu kodujące różne izoformy.

Zobacz też

• 15-lipoksygenaza arachidonianu
• Kwas 15-hydroksyikozatetraenowy
• ALOX15

Linki zewnętrzne

• Lokalizacja ludzkiego genomu ALOX15B i strona szczegółów genu ALOX15B w przeglądarce genomu UCSC .

Dalsza lektura

•   Sigal E, Grunberger D, Highland E, Gross C, Dixon RA, Craik CS (marzec 1990). „Ekspresja sklonowanej ludzkiej 15-lipoksygenazy retikulocytów i dowody immunologiczne, że 15-lipoksygenazy różnych typów komórek są ze sobą powiązane” . Journal of Biological Chemistry . 265 (9): 5113–20. doi : 10.1016/S0021-9258(19)34092-X . PMID 2318885 .
•   Kilty I, Logan A, Vickers PJ (listopad 1999). „Charakterystyka różnicowa ludzkich izozymów 15-lipoksygenazy i nowego wariantu splicingowego 15S-lipoksygenazy” . Europejski Dziennik Biochemii . 266 (1): 83–93. doi : 10.1046/j.1432-1327.1999.00818.x . PMID 10542053 .
•   Krieg P, Marks F, Fürstenberger G (maj 2001). „Klaster genów kodujący lipoksygenazy typu ludzkiego naskórka na chromosomie 17p13.1: klonowanie, mapowanie fizyczne i ekspresja”. Genomika . 73 (3): 323–30. doi : 10.1006/geno.2001.6519 . PMID 11350124 .
•   Tang S, Bhatia B, Maldonado CJ, Yang P, Newman RA, Liu J, Chandra D, Traag J, Klein RD, Fischer SM, Chopra D, Shen J, Zhau HE, Chung LW, Tang DG (maj 2002). „Dowody na to, że arachidonian 15-lipoksygenazy 2 jest negatywnym regulatorem cyklu komórkowego w normalnych komórkach nabłonka prostaty” . Journal of Biological Chemistry . 277 (18): 16189–201. doi : 10.1074/jbc.M111936200 . PMID 11839751 .
•    Xu XC, Shappell SB, Liang Z, Song S, Menter D, Subbarayan V, Iyengar S, Tang DG, Lippman SM (2003). „Zmniejszona ekspresja 15S-lipoksygenazy-2 w próbkach i komórkach raka przełyku oraz regulacja w górę in vitro przez inhibitor cyklooksygenazy-2, NS398” . Nowotwory . 5 (2): 121–7. doi : 10.1016/s1476-5586(03)80003-9 . PMC 1502398 . PMID 12659684 .
•   Bhatia B, Maldonado CJ, Tang S, Chandra D, Klein RD, Chopra D, Shappell SB, Yang P, Newman RA, Tang DG (lipiec 2003). „Lokalizacja subkomórkowa i funkcje supresyjne guza 15-lipoksygenazy 2 (15-LOX2) i jej wariantów składania” . Journal of Biological Chemistry . 278 (27): 25091–100. doi : 10.1074/jbc.M301920200 . PMID 12704195 .
•   Tang S, Bhatia B, Zhou J, Maldonado CJ, Chandra D, Kim E, Fischer SM, Butler AP, Friedman SL, Tang DG (wrzesień 2004). „Dowody na to, że Sp1 pozytywnie i Sp3 negatywnie regulują, a androgeny nie regulują bezpośrednio funkcjonalnej ekspresji genu 15-lipoksygenazy 2 (15-LOX2) supresora guza w normalnych ludzkich komórkach nabłonka prostaty” . Onkogen . 23 (41): 6942–53. doi : 10.1038/sj.onc.1207913 . PMID 15247906 .
•    Suzuki Y, Yamashita R, Shirota M, Sakakibara Y, Chiba J, Mizushima-Sugano J, Nakai K, Sugano S (wrzesień 2004). „Porównanie sekwencji ludzkich i mysich genów ujawnia homologiczną strukturę blokową w regionach promotora” . Badania genomu . 14 (9): 1711–8. doi : 10.1101/gr.2435604 . PMC 515316 . PMID 15342556 .
•   Limor R, Kaplan M, Sawamura T, Sharon O, Keidar S, Weisinger G, Knoll E, Naidich M, Stern N (marzec 2005). „Angiotensyna II zwiększa ekspresję podobnego do lektyny utlenionego receptora-1 lipoprotein o małej gęstości w ludzkich komórkach mięśni gładkich naczyń poprzez szlak zależny od lipooksygenazy” . American Journal nadciśnienia tętniczego . 18 (3): 299–307. doi : 10.1016/j.amjhyper.2004.09.008 . PMID 15797645 .
•    Subbarayan V, Xu XC, Kim J, Yang P, Hoque A, Sabichi AL, Llansa N, Mendoza G, Logothetis CJ, Newman RA, Lippman SM, Menter DG (marzec 2005). „Odwrotna zależność między ekspresją genu 15-lipoksygenazy-2 i PPAR-gamma w prawidłowym nabłonku w porównaniu z nabłonkiem guza” . Nowotwory . 7 (3): 280–93. doi : 10.1593/neo.04457 . PMC 1501140 . PMID 15799828 .
•   Jiang WG, Watkins G, Douglas-Jones A, Mansel RE (kwiecień 2006). „Redukcja izoform 15-lipoksygenazy (15-LOX) -1 i 15-LOX-2 w ludzkim raku piersi”. Prostaglandyny, leukotrieny i niezbędne nienasycone kwasy tłuszczowe . 74 (4): 235–45. doi : 10.1016/j.plefa.2006.01.009 . PMID 16556493 .
•   Subbarayan V, Krieg P, Hsi LC, Kim J, Yang P, Sabichi AL, Llansa N, Mendoza G, Logothetis CJ, Newman RA, Lippman SM, Menter DG (wrzesień 2006). „Regulacja genu 15-lipoksygenazy-2 przez jego produkt, kwas 15-(S)-hydroksyeikozatetraenowy, poprzez mechanizm ujemnego sprzężenia zwrotnego, który obejmuje receptor gamma aktywowany przez proliferatory peroksysomów” . Onkogen . 25 (44): 6015–25. doi : 10.1038/sj.onc.1209617 . PMID 16682954 .
•   Lesueur F, Bouadjar B, Lefèvre C, Jobard F, Audebert S, Lakhdar H, Martin L, Tadini G, Karaduman A, Emre S, Saker S, Lathrop M, Fischer J (kwiecień 2007). „Nowe mutacje w ALOX12B u pacjentów z autosomalną recesywną wrodzoną rybią łuską i dowody na genetyczną heterogeniczność chromosomu 17p13” . The Journal of Investigative Dermatology . 127 (4): 829–34. doi : 10.1038/sj.jid.5700640 . PMID 17139268 .