Caldalkalibacillus
Caldalkalibacillus | |
---|---|
Klasyfikacja naukowa | |
Domena: | |
Gromada: | |
Klasa: | |
Zamówienie: | |
Rodzina: | |
Rodzaj: |
Caldalkalibacillus
Xue i in. 2006
|
Gatunek | |
C. mannanilyticus |
|
Synonimy | |
Thermalkalibacillus |
Caldalkalibacillus to rodzaj bakterii tlenowych i tworzących przetrwalniki z rodziny Bacillaceae , które plamią Gram-dodatnie lub Gram-zmienne. Typowym gatunkiem tego rodzaju jest Caldalkalibacillus thermarum.
Caldalkalibacillus mannanilyticus był wcześniej gatunkiem należącym do Bacillus , rodzaju , który został uznany za wykazujący rozległą polifilię i został ograniczony przez ostatnie badania filogenetyczne tylko do gatunków blisko spokrewnionych z Bacillus subtilis i Bacillus cereus .
Nazwa Caldalkalibacillus pochodzi od przedrostka „-caldalkali” (od łacińskiego przymiotnika caldus oznaczającego „gorący” i łacińskiego rzeczownika alkalia) oraz przyrostka „-bacillus” (od łacińskiego rzeczownika bacillus odnoszącego się do małego pręt). Razem Caldalkalibacillus przekłada się na Bacillus żyjący w gorących i alkalicznych warunkach).
Charakterystyka biochemiczna i podpisy molekularne
Członkowie tego rodzaju są tlenowi , a niektórzy są ruchliwi i tworzą endospory. Tworzone kolonie mają kolor żółty lub żółtawo-biały. Zakres temperatur wzrostu wynosi 20–65°C, przy czym optymalna temperatura wzrostu dla C. mannanilyticus wynosi około 37°C, podczas gdy C. thermarum optymalnie rośnie w temperaturze 60°C. Zakres pH dla wzrostu wynosi 7,5–10, przy czym optymalny wzrost występuje przy pH 8,5–9,0.
Cztery konserwatywne indele sygnaturowe (CSI) zidentyfikowano za pomocą analiz genomowych dla tego rodzaju w następujących białkach: dehydrogenaza prefenolowa , transferaza izoprenylowa, białko zawierające domenę DUF1027 i deaminaza adeninowa , które w większości przypadków są wspólne wyłącznie dla wszystkich lub większości członków tego rodzaj. Te CSI dostarczają wiarygodnych molekularnych sposobów odróżniania Caldalkalibacillus od innych rodzajów i bakterii Bacillaceae .
Taksonomia
Caldalkalibacillus według stanu na maj 2021 r. zawiera łącznie 3 gatunki z ważnie opublikowanymi nazwami. Ten wzór rozgałęzień obserwuje się również w bazie danych taksonomii genomu (GTDB).
Dalsza lektura
- Zhao, W; Zhang, CL; Romanek CS; Wiegel, J (maj 2008). „Opis Caldalkalibacillus uzonensis sp. Nov. I poprawiony opis rodzaju Caldalkalibacillus” . International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology . 58 (cz. 5): 1106–8. doi : 10.1099/ijs.0.65363-0 . PMID 18450697 .
- Kalamorz F.; Keis, S.; McMillan, DGG; Olsson, K.; Stanton, JA; Stockwell, P.; Czarny, MA; Klingeman, DM; Ziemia, ML; Han, CS; Martin, SL; Becher, SA; Peddie, CJ; Morgan, HW; Matthies, D.; Preiss L.; Meier, T.; brązowy, SD; Cook, GM (17 czerwca 2011). „Szkic sekwencji genomu termoalkalifilowego szczepu Caldalkalibacillus thermarum TA2.A1” . Journal of Bacteriology . 193 (16): 4290–4291. doi : 10.1128/JB.05035-11 . PMC 3147688 . PMID 21685297 .
- Bertrand, Jean-Claude; Caumette, Pierre; Libaron, Filip; Matheron, Robert; Normand, Filip; Sime-Ngando, Télesphore (2015). Mikrobiologia środowiskowa: podstawy i zastosowania: ekologia drobnoustrojów . Skoczek. ISBN 9789401791182 .