Caldalkalibacillus

Caldalkalibacillus
Klasyfikacja naukowa
Domena:
Gromada:
Klasa:
Zamówienie:
Rodzina:
Rodzaj:
Caldalkalibacillus

Xue i in. 2006
Gatunek


C. thermarum C. uzonensis

C. mannanilyticus

Synonimy

Thermalkalibacillus

Caldalkalibacillus to rodzaj bakterii tlenowych i tworzących przetrwalniki z rodziny Bacillaceae , które plamią Gram-dodatnie lub Gram-zmienne. Typowym gatunkiem tego rodzaju jest Caldalkalibacillus thermarum.

Caldalkalibacillus mannanilyticus był wcześniej gatunkiem należącym do Bacillus , rodzaju , który został uznany za wykazujący rozległą polifilię i został ograniczony przez ostatnie badania filogenetyczne tylko do gatunków blisko spokrewnionych z Bacillus subtilis i Bacillus cereus .

Nazwa Caldalkalibacillus pochodzi od przedrostka „-caldalkali” (od łacińskiego przymiotnika caldus oznaczającego „gorący” i łacińskiego rzeczownika alkalia) oraz przyrostka „-bacillus” (od łacińskiego rzeczownika bacillus odnoszącego się do małego pręt). Razem Caldalkalibacillus przekłada się na Bacillus żyjący w gorących i alkalicznych warunkach).

Charakterystyka biochemiczna i podpisy molekularne

Członkowie tego rodzaju są tlenowi , a niektórzy są ruchliwi i tworzą endospory. Tworzone kolonie mają kolor żółty lub żółtawo-biały. Zakres temperatur wzrostu wynosi 20–65°C, przy czym optymalna temperatura wzrostu dla C. mannanilyticus wynosi około 37°C, podczas gdy C. thermarum optymalnie rośnie w temperaturze 60°C. Zakres pH dla wzrostu wynosi 7,5–10, przy czym optymalny wzrost występuje przy pH 8,5–9,0.

Cztery konserwatywne indele sygnaturowe (CSI) zidentyfikowano za pomocą analiz genomowych dla tego rodzaju w następujących białkach: dehydrogenaza prefenolowa , transferaza izoprenylowa, białko zawierające domenę DUF1027 i deaminaza adeninowa , które w większości przypadków są wspólne wyłącznie dla wszystkich lub większości członków tego rodzaj. Te CSI dostarczają wiarygodnych molekularnych sposobów odróżniania Caldalkalibacillus od innych rodzajów i bakterii Bacillaceae .

Taksonomia

Caldalkalibacillus według stanu na maj 2021 r. zawiera łącznie 3 gatunki z ważnie opublikowanymi nazwami. Ten wzór rozgałęzień obserwuje się również w bazie danych taksonomii genomu (GTDB).


Dalsza lektura