Cfr10I/Bse634I

Bse634I
PDB 1cfr EBI.jpg
endonukleazy restrykcyjnej citrobacter freundii cfr10i przy rozdzielczości 2,15 angstremów.
Identyfikatory
Symbol Bse634I
Pfam PF07832
InterPro IPR012415
Dostępne struktury białek:
Pfam   konstrukcje / ECOD  
WPB RCSB WPB ; PDBe ; WPBj
Suma WPB podsumowanie struktury

W biologii molekularnej rodzina endonukleaz restrykcyjnych Cfr10I/Bse634I obejmuje endonukleazy restrykcyjne typu II Cfr10I i Bse634I. Wykazują konserwatywną architekturę tetrameryczną, która ma znaczenie funkcjonalne, w której dwa dimery są ułożone jeden za drugim, z ich przypuszczalnymi szczelinami wiążącymi DNA skierowanymi w przeciwnych kierunkach. Te szczeliny powstają między dwoma monomerami , które oddziałują, głównie poprzez oddziaływania hydrofobowe wspierane przez kilka wiązań wodorowych, tworząc dimer w kształcie litery U. Każdy monomer jest złożony , tworząc zwartą strukturę alfa-beta, której rdzeń składa się z pięcioniciowego mieszanego arkusza beta . Monomer może być podzielony na oddzielne poddomeny N-końcowe i C-końcowe w zawiasie znajdującym się w helisie alfa3. Zarówno Cfr10I, jak i Bse634I rozpoznają dwuniciową sekwencję RCCGGY i tną po purynie R.

Rozpoznawana sekwencja Cut 5' RCCGGY 5' ---R CCGGY--- 3' 3' YGGCCR 3' ---YGGCC R--- 5'
Ten artykuł zawiera tekst z domeny publicznej Pfam i InterPro : IPR012415