Chryseobacterium

Chryseobacterium oleae DSM25575.jpg
Chryseobacterium
Chryseobacterium oleae DSM25575 hodowane na stałych podłożach LB
Klasyfikacja naukowa
Domena:
Gromada:
Klasa:
Zamówienie:
Rodzina:
Rodzaj:
Chryseobacterium

Vandamme i in . 1994
Gatunek

Patrz tekst.

Synonimy
  • Halpernia Nicholson i in . 2020
  • Epilithonimonas O'Sullivan et al . 2006
  • Planobacterium Peng i in . 2009
  • Soonwooa Joung i in . 2010
  • Kaistella Kim i in . 2004
  • Sejongia Yi i in . 2005

Chryseobacterium to rodzaj bakterii Gram-ujemnych . Gatunki Chryseobacterium to chemoorganotroficzne bakterie Gram-ujemne w kształcie pałeczek. Chryseobacterium tworzą kolonie o typowym żółto-pomarańczowym kolorze dzięki pigmentowi typu flexirubina. Rodzaj zawiera ponad 100 opisanych gatunków z różnych siedlisk, w tym źródeł słodkowodnych, gleby, ryb morskich i żywicieli ludzkich.

Historia

Rodzaj Chryseobacterium został pierwotnie stworzony w 1994 roku przez Vandamme i in . dla sześciu taksonów bakterii, które w tamtym czasie były sklasyfikowane jako członkowie rodzaju Flavobacterium : F. balustinum , F. indologenes , F. gleum , F. meningosepticum , F. indoltheticum i F. scophthalmum . W 2005 r. utworzono dodatkowy rodzaj, Elizabethkingia , dla dwóch gatunków należących do rodzaju Chryseobacterium ; mianowicie C. meningosepticum i C. miricola. W 2002 roku Bernardet i in. opublikowali standardy i wytyczne dotyczące opisu nowych taksonów z rodziny Flavobacteriaceae . Do 2006 roku rodzaj Chryseobacterium powiększył się do 10 gatunków, do 2014 roku ponad 60 gatunków, a obecnie ponad 100.

Ekologia

Chryseobacterium spp. zostały odzyskane z gleby, korzeni roślin, kwiatów, rozkładającego się materiału roślinnego i soku klonowego. Chryseobacterium związane z roślinami są zdolne do hamowania grzybów chorobotwórczych dla roślin. Chryseobacterium spp. zostały również odzyskane ze słodkowodnych potoków, jezior, ich osadów, systemów chłodzenia wody, wody pitnej, napojów kwasu mlekowego, rozlewni piwa, szlamu z bioreaktora, zanieczyszczonej gleby, osadów morskich i wiecznej zmarzliny . Chryseobacterium spp. są związane z wieloma zwierzętami - wykryto je w jelicie środkowym komarów, w jelitach karaluchów, odchodach krocionogów i guano pingwinów, homogenatach jelit słodkowodnych widłonogów, ptasich piórach, mleku krowim, surowym mięsie i kurczakach. Chryseobacterium spp. zostały odzyskane ze śluzu pozornie zdrowych ryb, jednak czasami są uważane za organizm psujący. W surowym mleku w Izraelu wykryto trzy nowe odporne na zimno gatunki Chryseobacterium , C. oranimense C. haifense i C. bovis .

Patogeneza

Najbardziej patogenny Flavobacterium spp., Chryseobacterium meningosepticum , który powodował liczne infekcje, został przeklasyfikowany do rodzaju Elizabethkingia . Chryseobacterium indologenes , choć występuje w przyrodzie wszechobecnie, głównie w glebie i wodzie, jest rzadkim patogenem człowieka. Jednak w rzadkich przypadkach może powodować poważne infekcje, szczególnie wśród osób z obniżoną odpornością. W większości przypadków zakażenia są nabyte w szpitalu, często związane z immunosupresją lub założonymi na stałe cewnikami. Opisywano go jako czynnik sprawczy bakteriemii , zapalenia otrzewnej , zapalenia płuc , ropniaka , odmiedniczkowego zapalenia nerek , zapalenia pęcherza moczowego , zapalenia opon mózgowych i zakażeń związanych z centralnym cewnikiem żylnym. Liczba zgłaszanych C. indologenes wzrasta. Większość zgłoszonych infekcji pochodziła z Tajwanu, a tylko około 10% miało miejsce poza Azją. Kilka raportów nadeszło z Australii, Indii, Europy i USA. C. indologenes jest również chorobotwórcza dla kleszczy miękkich, podczas gdy inne Chryseobacterium spp. zostały odzyskane z chorych żółwi, żab i ryb, w szczególności C. scophthalmum, C. joostei, C. piscicola, C. chaponense, C. viscerum i C. oncorhynchi, C. aahli, C. hominis, C. shigense, jak również C. indologenes , który jest związany z chorobami człowieka.

Zgłoszono, że niektóre gatunki Chryseobacterium mają niezwykłe właściwości trawienia macierzy, zdolne do degradacji najtrudniejszych matryc kolagenowych, takich jak pióra lub egzoszkielety. We właściwościach tych prawdopodobnie pośredniczy działanie specyficznych chitynaz i metaloproteaz podobnych do kolagenazy . Wykazano , że niektóre gatunki, takie jak Chryseobacterium nematophagum, są w stanie infekować, zabijać i ostatecznie konsumować wszystkie tkanki nicieni, w tym zwykle wysoce nierozpuszczalny egzoszkielet naskórka. Aktywność chitynazy, żelatynazy i metaloproteazy kolagenazy została powiązana z Chryseobacterium wywieraną przez układy wydzielnicze typu IX. Rzeczywiście, niektóre z tych enzymów posiadają C-końcowe sygnały sekrecyjne typu IX. Chryseobacterium nie mają białek ani struktur kolagenu ani chityny. Gatunki Chryseobacterium należą do rodzaju Bacteriodetes , którego członków coraz częściej opisuje się jako mających niezwykle powiązany układ ruchowy i wydzielniczy.

W genomie Chryseobacterium piperi str. CTM i przedstawiają bardzo zróżnicowaną grupę toksyn podobnych do BoNT. Jedna z przewidywanych C. piperi indukowała martwiczą śmierć komórek w ludzkich komórkach nerki, ale nie stwierdzono, aby rozszczepiała wspólne substraty SNARE BoNT.

Odporność na antybiotyki

Chryseobacterium spp. są z natury oporne na szerokie spektrum antybiotyków , w tym tetracykliny , erytromycynę , linezolid , polimyksyny , aminoglikozydy , chloramfenikol i wiele beta- laktamów , a jednocześnie są średnio wrażliwe na wankomycynę i klindamycynę i różnią się wrażliwością na trimetoprim z sulfametoksazolem .

Gatunek

Gatunki obejmują:

Zobacz też