DNM1L
DNM1L | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Identyfikatory | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
, DLP1, DRP1, DVLP, DYMPLE, EMPF, HDYNIV, dynamin 1-like, dynamin 1-like, EMPF1, OPA5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Identyfikatory zewnętrzne | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Wikidane | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Białko podobne do dynaminy 1 jest GTPazą , która reguluje rozszczepienie mitochondriów . U ludzi białko podobne do dynaminy 1, które jest zwykle określane jako białko 1 związane z dynaminą (Drp1), jest kodowane przez gen DNM1L i jest częścią rodziny białek nadrodziny dynaminy (DSP).
Struktura
Drp1, który jest członkiem nadrodziny białek dynamin , składa się z domeny efektorowej GTPazy i GTPazy, które są oddzielone od siebie helikalnym segmentem aminokwasów. Istnieją 3 mysie i 6 ludzkich izoform Drp1, w tym wariant specyficzny dla mózgu. Drp1 istnieje jako homooligomery, a jego funkcja opiera się na zdolności do oligomeryzacji.
Funkcjonować
Mitochondria rutynowo przechodzą zdarzenia rozszczepienia i fuzji, które utrzymują dynamiczną sieć siatkową. Drp1 jest podstawowym składnikiem rozszczepienia mitochondriów . Rzeczywiście, neurony z niedoborem Drp1 mają duże, silnie połączone mitochondria z powodu dysfunkcyjnej maszynerii rozszczepienia. Rozszczepienie ułatwia mitofagię , czyli rozkład i recykling uszkodzonych mitochondriów. Dysfunkcja aktywności DRP może skutkować dyfuzją zmutowanego DNA lub nieprawidłowych białek w całym układzie mitochondrialnym. Ponadto rozszczepienie prowadzi do fragmentacji mitochondriów, które są bardziej zdolne do wytwarzania reaktywnych form tlenu , które mogą zakłócać normalne procesy biochemiczne wewnątrz komórek. ROS mogą powstawać w wyniku niepełnego przeniesienia elektronów przez łańcuch transportu elektronów. Ponadto rozszczepienie wpływa na przepływ wapnia w komórce, łącząc Drp1 z apoptozą i rakiem.
Kilka badań wykazało, że Drp1 jest niezbędny do prawidłowego rozwoju embrionalnego. Myszy z nokautem Drp1 wykazują nieprawidłowy rozwój mózgu i umierają około 12 dnia embrionalnego. U myszy z nokautem Drp1 specyficznych dla neuronów rozmiar mózgu jest zmniejszony, a apoptoza zwiększona. Tworzenie synaps i wzrost neurytów są również upośledzone. Druga grupa badaczy wygenerowała kolejną linię myszy z nokautem specyficzną dla neuronów. Odkryli, że wyeliminowanie Drp1 spowodowało pojawienie się dużych mitochondriów w komórkach Purkinjego i zapobiegło tworzeniu się cewy nerwowej .
U ludzi utrata funkcji Drp1 wpływa na rozwój mózgu i jest również związana z wczesną śmiertelnością.
Interakcje
Większość wiedzy na temat rozszczepienia mitochondriów pochodzi z badań na drożdżach . Drożdżowym homologiem Drp1 jest dynamina-1 (Dnm1), która oddziałuje z Fis1 poprzez Mdv1. Ta interakcja powoduje, że Dnm1 oligomeryzuje i tworzy pierścienie wokół dzielących się mitochondriów w tak zwanym „punkcie zwężenia”. Wykazano również, że Drp1 oddziałuje z GSK3B . U ssaków receptory Drp1 obejmują Mff, Mid49 i Mid51
Posttranslacyjne modyfikacje Drp1 (np. fosforylacja ) mogą zmieniać jego aktywność i wpływać na szybkość rozszczepienia.
Drp1 ma dwa główne miejsca fosforylacji. Miejsce fosforylacji CDK to S579, a miejscem PKA jest S600 w izoformie 3 Drp1. Uważa się, że fosforylacja przez CDK jest aktywująca, podczas gdy uważa się, że fosforylacja PKA jest hamująca. Ostatnio wykazano , że CaMKII fosforyluje Drp1 w S616. Wykazano, że zachodzi to w odpowiedzi na przewlekłą stymulację beta-adrenergiczną i sprzyja otwieraniu mPTP. Inne modyfikacje potranslacyjne obejmują S-nitrozylację , sumoilację i ubikwitynację . Wyższe modyfikacje S-nitrozylacji Drp1, które zwiększają aktywność Drp1, zaobserwowano w Alzheimera . Ponadto wykazano, że Drp1 oddziałuje z monomerami Aβ, które, jak się uważa, odgrywają ważną rolę w chorobie Alzheimera, zaostrzając chorobę i jej objawy. Drp1 został powiązany z wieloma szlakami i procesami, w tym z podziałem komórek, apoptozą i martwicą . Wykazano, że Drp1 stabilizuje p53 podczas stresu oksydacyjnego, promując jego translokację do mitochondriów i zachęcając do martwicy związanej z mitochondriami. Ponadto cyklina B1-CDK aktywuje Drp1, powodując fragmentację i zapewniając dystrybucję mitochondriów do każdej komórki potomnej po mitozie. Podobnie różne kontrolery transkrypcji są w stanie zmieniać aktywność Drp1 poprzez ekspresję i regulację genów. Na przykład PPARGC1A i [HIF1A] regulowały aktywność Drp1 poprzez ekspresję genów.
Terapia
Hamowanie Drp1 zostało rozważone jako możliwe środki terapeutyczne dla różnych chorób. Najlepiej przebadanym inhibitorem jest mała cząsteczka o nazwie inhibitor podziału mitochondrialnego 1 (mdivi-1), która może mieć niepożądane skutki, takie jak hamowanie kompleksu 1 mitochondrialnego łańcucha oddechowego. Przypuszczalna funkcja inhibitorów polega na zapobieganiu aktywności GTPazy Drp1, zapobiegając w ten sposób aktywacji i lokalizacji w mitochondriach. Wykazano, że Midiv-1 łagodzi skutki niedokrwiennego uszkodzenia reperfuzyjnego po zatrzymaniu krążenia. Leczenie zapobiegło zarówno fragmentacji mitochondriów, jak i zwiększeniu żywotności komórek. Podobnie midiv-1 wykazał działanie neuroprotekcyjne, znacznie zmniejszając śmierć neuronów z powodu napadu. Ponadto badanie wykazało, że midiv-1 był w stanie zapobiegać aktywacji kaspazy 3 poprzez odwrócenie uwalniania cytochromu c w wewnętrznej apoptozie. Niezależnie od tego, czy mdivi-1 hamuje Drp1, czy nie, jego potencjał terapeutyczny jest z pewnością oczywisty. Poza bezpośrednim hamowaniem Drp1, badano pewne inhibitory białek zaangażowanych w potranslacyjne modyfikacje Drp1. FK506 jest inhibitorem kalcyneuryny, który działa w celu defosforylacji pozycji seryny 637 Drp1, zachęcając do translokacji do mitochondriów i fragmentacji. Wykazano, że FK506 zachowuje również morfologię mitochondriów po uszkodzeniu reperfuzyjnym.
Dalsza lektura
- Pawlikowska P, Orzechowski A (2007). „[Rola transbłonowych GTPaz w morfologii i aktywności mitochondriów]”. Postępy Biochemii . 53 (1): 53–9. PMID 17718388 .
- Kamimoto T, Nagai Y, Onogi H, Muro Y, Wakabayashi T, Hagiwara M (styczeń 1998). „Dymple, nowa podobna do dynaminy GTPaza o dużej masie cząsteczkowej, pozbawiona bogatej w prolinę domeny na końcu karboksylowym w komórkach ssaków” . Journal of Biological Chemistry . 273 (2): 1044–51. doi : 10.1074/jbc.273.2.1044 . PMID 9422767 .
- Imoto M, Tachibana I, Urrutia R (maj 1998). „Identyfikacja i charakterystyka funkcjonalna nowego białka ludzkiego, wysoce spokrewnionego z dynaminą drożdży GTPazą Vps1p”. Journal of Cell Science . 111 (Pt 10) (10): 1341–9. doi : 10.1242/jcs.111.10.1341 . PMID 9570752 .
- Rasmussen RK, Rusak J, Price G, Robinson PJ, Simpson RJ, Dorow DS (październik 1998). „Domena kinazy 2-SH3 o mieszanej linii wiąże dynaminę i znacznie zwiększa aktywację GTPazy przez fosfolipid” . Dziennik biochemiczny . 335 (Pt 1) (Pt 1): 119–24. doi : 10.1042/bj3350119 . PMC 1219759 . PMID 9742220 .
- Smirnova E, Shurland DL, Ryazantsev SN, van der Bliek AM (październik 1998). „Ludzkie białko związane z dynaminą kontroluje dystrybucję mitochondriów” . Journal of Cell Biology . 143 (2): 351–8. doi : 10.1083/jcb.143.2.351 . PMC 2132828 . PMID 9786947 .
- Smirnova E, Griparic L, Shurland DL, van der Bliek AM (sierpień 2001). „Białko Drp1 związane z dynaminą jest wymagane do podziału mitochondriów w komórkach ssaków” . Biologia molekularna komórki . 12 (8): 2245–56. doi : 10.1091/mbc.12.8.2245 . PMC58592 . _ PMID 11514614 .
- Karbowski M, Lee YJ, Gaume B, Jeong SY, Frank S, Nechushtan A, Santel A, Fuller M, Smith CL, Youle RJ (grudzień 2002). „Przestrzenne i czasowe powiązanie Bax z miejscami rozszczepienia mitochondriów, Drp1 i Mfn2 podczas apoptozy” . Journal of Cell Biology . 159 (6): 931-8. doi : 10.1083/jcb.200209124 . PMC 2173996 . PMID 12499352 .
- Koch A, Thiemann M, Grabenbauer M, Yoon Y, McNiven MA, Schrader M (marzec 2003). „Białko podobne do dynaminy 1 bierze udział w rozszczepieniu peroksysomów” . Journal of Biological Chemistry . 278 (10): 8597–605. doi : 10.1074/jbc.M211761200 . PMID 12499366 .
- Li X, Gould SJ (maj 2003). „Podobna do dynaminy GTPaza DLP1 jest niezbędna do podziału peroksysomów i jest częściowo rekrutowana do peroksysomów przez PEX11” . Journal of Biological Chemistry . 278 (19): 17012-20. doi : 10.1074/jbc.M212031200 . PMID 12618434 .
- Breckenridge DG, Stojanovic M, Marcellus RC, Shore GC (marzec 2003). „Produkt rozszczepienia kaspazy BAP31 indukuje rozszczepienie mitochondriów poprzez sygnały wapniowe retikulum endoplazmatycznego, zwiększając uwalnianie cytochromu c do cytosolu” . Journal of Cell Biology . 160 (7): 1115–27. doi : 10.1083/jcb.200212059 . PMC 2172754 . PMID 12668660 .
- Yoon Y, Krueger EW, Oswald BJ, McNiven MA (sierpień 2003). „Białko mitochondrialne hFis1 reguluje rozszczepienie mitochondriów w komórkach ssaków poprzez interakcję z białkiem podobnym do dynaminy DLP1” . Biologia molekularna i komórkowa . 23 (15): 5409-20. doi : 10.1128/MCB.23.15.5409-5420.2003 . PMC 165727 . PMID 12861026 .
- Howng SL, Sy WD, Cheng TS, Lieu AS, Wang C, Tzou WS, Cho CL, Hong YR (luty 2004). „Organizacja genomowa, alternatywny splicing i analiza promotora ludzkiego genu białka podobnego do dynaminy”. Komunikaty dotyczące badań biochemicznych i biofizycznych . 314 (3): 766–72. doi : 10.1016/j.bbrc.2003.12.172 . PMID 14741701 .
- Lee YJ, Jeong SY, Karbowski M, Smith CL, Youle RJ (listopad 2004). „Role mediatorów rozszczepienia i fuzji mitochondriów ssaków Fis1, Drp1 i Opa1 w apoptozie” . Biologia molekularna komórki . 15 (11): 5001–11. doi : 10.1091/mbc.E04-04-0294 . PMC 524759 . PMID 15356267 .
- Pitts KR, McNiven MA, Yoon Y (listopad 2004). „Specyficzna dla mitochondriów funkcja białka z rodziny dynamin DLP1 pośredniczy w jego domenach C-końcowych” . Journal of Biological Chemistry . 279 (48): 50286–94. doi : 10.1074/jbc.M405531200 . PMID 15364948 .
- Goehler H, Lalowski M, Stelzl U, Waelter S, Stroedicke M, Worm U, Droege A, Lindenberg KS, Knoblich M, Haenig C, Herbst M, Suopanki J, Scherzinger E, Abraham C, Bauer B, Hasenbank R, Fritzsche A , Ludewig AH, Büssow K, Buessow K, Coleman SH, Gutekunst CA, Landwehrmeyer BG , Lehrach H, Wanker EE (wrzesień 2004). „Sieć interakcji białek łączy GIT1, wzmacniacz agregacji huntingtyny, z chorobą Huntingtona” . Komórka Molekularna . 15 (6): 853–65. doi : 10.1016/j.molcel.2004.09.016 . PMID 15383276 .
- Germain M, Mathai JP, McBride HM, Shore GC (kwiecień 2005). „Retikulum endoplazmatyczne BIK inicjuje regulowaną przez DRP1 przebudowę cristae mitochondriów podczas apoptozy” . Dziennik EMBO . 24 (8): 1546–56. doi : 10.1038/sj.emboj.7600592 . PMC 1142564 . PMID 15791210 .
- Narayanan R, Leonard M, Song BD, Schmid SL, Ramaswami M (kwiecień 2005). „Wewnętrzna domena GAP negatywnie reguluje dynaminę presynaptyczną in vivo: dwuetapowy model funkcji dynaminy” . Journal of Cell Biology . 169 (1): 117–26. doi : 10.1083/jcb.200502042 . PMC 2171915 . PMID 15824135 .
Linki zewnętrzne
- DNM1L w przeglądarce genomu UCSC .
- DNM1L w przeglądarce genomu UCSC .
- Przegląd wszystkich informacji strukturalnych dostępnych w PDB dla UniProt : O00429 (białko podobne do Dynaminy-1) w PDBe-KB .