DUX4
 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Identyfikatory | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| DUX4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| , DUX4L, podwójny homeobox 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| identyfikatory zewnętrzne | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Wikidane | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Podwójny homeoboks, 4 znany również jako DUX4, jest białkiem , które u ludzi jest kodowane przez gen DUX4 . Jego błędna ekspresja jest przyczyną dystrofii twarzowo-łopatkowo-ramiennej (FSHD).
Gen
| CEN | centromerowy koniec | TEL | koniec telomerowy |
| Pudełko NDE | nieusunięty element | PIERWSZEŃSTWO | miejsce poliadenylacji |
| trójkąt | Powtórz D4Z4 | trapez | częściowe powtórzenie D4Z4 |
| białe pudło | pLAM | szare pudełka | Egzony 1, 2, 3 DUX4 |
| strzałki | |||
| narożnik | promotorzy | prosty | transkrypcje RNA |
| czarny | sens | czerwony | antysensowny |
| niebieski | DBE-T | kreski | miejsca do krojenia w kostkę |
Gen ten znajduje się w makrosatelitarnym układzie powtórzeń D4Z4 w regionie subtelomerowym chromosomu 4q35 . Macierz powtórzeń D4Z4 zawiera 11-150 powtórzeń D4Z4 w populacji ogólnej; wysoce homologiczną macierz powtórzeń D4Z4 zidentyfikowano na chromosomie 10. Gen składa się z trzech eksonów . Egzony 1 i 2 są obecne w każdym powtórzeniu D4Z4. Obecna jest tylko jedna kopia egzonu 3, telomerowa względem tablicy powtórzeń D4Z4. ramka odczytu (ORF) jest całkowicie zawarta w eksonie 1 i zawiera dwa homeoboxy . Eksony 2 i 3 kodują trzy główne nieulegające translacji regiony (3′-UTR). W niektórych haplotypach ekson 3 zawiera poliadenylacji . Nie było dowodów na transkrypcję ze standardowych bibliotek cDNA, jednak eksperymenty z RT-PCR i ekspresją in vitro wskazują, że ORF podlega transkrypcji.
Tablica powtórzeń i ORF są zachowane u innych ssaków.
Struktura
Białko DUX4 ma długość 424 aminokwasów . Na N-końcu znajdują się dwie homeodomeny . Domena aktywująca transkrypcję (TAD) i domena wiążąca p300 znajdują się na C-końcu . TAD obejmuje potencjalne dziewięć aminokwasów TAD (9aaTAD).
Dwie homeodomeny i TAD mają dobrze zdefiniowaną strukturę trzeciorzędową. Przewiduje się, że region między drugą homeodomeną a TAD będzie nieuporządkowany.
DUX4 można łączyć w celu wytworzenia mRNA DUX4-S (krótki) lub DUX4-FL (pełnej długości). DUX4-FL mRNA koduje całe białko DUX4. DUX4-S mRNA koduje częściowe białko DUX4, któremu brakuje domeny aktywującej transkrypcję.
Funkcjonować
Białko DUX4 jest aktywatorem transkrypcji wielu genów, jednym z przykładów jest sparowany czynnik transkrypcyjny homeodomeny 1 ( PITX1 ). Prawdopodobnie stymuluje aktywację genomu zygotycznego . [ potrzebne źródło ]
Dwie homeodomeny pozwalają białku DUX4 wiązać się z DNA. Domena C-końcowa bierze udział w aktywacji genu docelowego.
DUX jest zwykle wyrażany w jądrach , grasicy i zarodkach w stadium rozszczepienia .
Znaczenie kliniczne
Niewłaściwa ekspresja DUX4 w komórkach mięśniowych jest przyczyną dystrofii twarzowo-łopatkowo-ramiennej (FSHD).
Nadekspresja DUX4 z powodu translokacji może powodować białaczkę z komórek B. Translokacja łącząca DUX4 z CIC może powodować agresywny rodzaj mięsaka .
Zobacz też
Ten artykuł zawiera tekst z Narodowej Biblioteki Medycznej Stanów Zjednoczonych , która jest własnością publiczną .