Eggerthellaceae

Eggerthellaceae
Naukowa klasyfikacja
Domena:	Bakteria
Gromada:	promieniowiec
Klasa:	Koriobakterie
Zamówienie:	jajeczne Gupta i in . 2013
Rodzina:	Eggerthellaceae Gupta i in . 2013
Rodzaje
Adlercreutzia Maruo i in . 2008 „ Arabia ” Traore i in . 2017 Asaccharobacter Minamida i in . 2008 Cryptobacterium Nakazawa i in . 1999 Denitrobacterium Anderson i in . 2000 Eggerthella Kageyama i in . 1999 Ellagibacter Beltrán i in . 2018 Enteroscipio Danylec i in . 2018 Gordonibacter Würdemann i in . 2009 „ Hugonella ” Elsawi i in . 2017 Paraeggerthella Würdemann i in . 2009 Parvibacter Clavel i in . 2013 „ Phoenicibacter ” Bilen i in . 2017 „ Raoultibacter ” Traore i in . 2016 Rubneribacter Danylec i in . 2018 Senegalimaslia poprawna. Lagier i in . 2014 Slackia Wade i in . 1999

Eggerthellaceae to rodzina Gram-dodatnich Actinomycetota w kształcie pręcików lub ziarniaków . Jest to jedyna rodzina z rzędu Eggerthellales.

Nazwa Eggerthellaceae pochodzi od łacińskiego terminu Eggerthella , odnoszącego się do rodzaju rodziny i przyrostka „-ceae”, końcówki używanej do określenia rodziny. Razem Eggerthellaceae odnosi się do rodziny, której typem nomenklaturowym jest rodzaj Eggerthella .

Charakterystyka biochemiczna i sygnatury molekularne

Członkowie tej rodziny są w większości beztlenowcami, nieruchliwymi (z wyjątkiem niektórych gatunków Gordonibacter i Senegalimassilia , które wykazują ruchliwość), accharolitycznymi i nie tworzą zarodników. Gatunki Eggerthellaceae są powszechnie izolowane z odchodów ludzkich i zwierzęcych oraz innych źródeł ludzkich, takich jak okrężnica, pochwa, jama ustna i krew. Niektóre gatunki zostały również wyizolowane z ludzkich próbek infekcji przyzębia lub endodontycznych, choroby Leśniowskiego-Crohna i ciężkiej bakteriemii we krwi. Zawartość G+C w Eggerthellaceae wynosi od 43,4 do 66,3% molowych.

Analiza sekwencji genomu zidentyfikowała 13 konserwatywnych indeli sygnaturowych (CSI) w różnych białkach, które występują wyłącznie w różnych gatunkach Eggerthellaceae . Białka zawierające te CSI to: podjednostka ABC contaekscynukleazy UvrC, podjednostka alfa polimerazy DNA III , rybonukleaza III , tRNA (N6-izopentenyloadenozyno(37)-C2)-metylotiotransferaza (MiaB), peptydowy czynnik uwalniania łańcucha 2, 16S rRNA (cytozyna ( 1402)-N(4))-metylotransferaza, czynnik wydłużania Tu , UDP-N-acetyloglukozaminy 1-karboksywinylotransferazy DNA polimerazy III podjednostki epsilon, UDP-glukozy 4-epimerazy i DNA-kierowanej polimerazy RNA podjednostki alfa. Zidentyfikowane CSI dostarczają wiarygodnych i ważnych środków do odróżnienia członków Eggerthellaceae od wszystkich innych Coriobacteriia, jak również innych bakterii.

Filogeneza

Drzewo filogenetyczne przedstawiające relacje taksonomiczne w rodzinie Eggerthellaceae. Zidentyfikowano szereg zachowanych indeli sygnaturowych dla rodziny i rodzaju Aldercreutzia , a ich specyfikę zaznaczono na drzewie. Ten diagram jest oparty na Bergery dotyczącym Eggerthellaceae autorstwa Gupta w 2021 r.

Obecnie przyjęta taksonomia oparta jest na Liście nazw prokariotycznych w nomenklaturze (LPSN). Filogeneza opiera się na analizie całego genomu. Zobacz rysunek przedstawiający szczegółowe drzewo filogenetyczne.

	jajeczne Slackia Cryptobacterium Denitrobacterium Senegalimassilia Eggerthella Gordonibacter Adlercreutzia grupa zewnętrzna Coriobacteriales