Element translacji niezależny od wielkich liter
W biologii molekularnej niezależny od czapeczki element translacyjny ( CITE lub 3'CITE ) to sekwencja RNA znaleziona w 3'UTR wielu roślinnych wirusów RNA .
Eukariotyczne mRNA zawierają strukturę czapeczki 5' , która jest wymagana do skutecznego wiązania czynników inicjujących translację . Wiele wirusowych mRNA nie ma czapeczki 5', mRNA wirusów zwierzęcych często zawierają wewnętrzne miejsce wejścia rybosomu , które działa w inicjacji translacji. Wiele mRNA wirusów roślinnych zawiera element translacyjny niezależny od czapeczki. Elementy te pośredniczą w inicjacji translacji białek zakodowanych w mRNA poprzez rekrutację czynników inicjacji translacji lub podjednostki rybosomu 60S do wirusowego RNA. W RNA2 wirusa nekrotycznej mozaiki koniczyny czerwonej (RCNMV) element translacji niezależny od czapeczki jest wymagany do syntezy ujemnej nici RNA.
Istnieje wiele różnych klas strukturalnych elementu translacyjnego niezależnego od czapeczki, bez widocznego podobieństwa strukturalnego lub sekwencyjnego:
| Struktura | Przykładowe gatunki |
|---|---|
| TED (domena wzmacniacza tłumaczeń) | Satelitarny wirus martwicy tytoniu (STNV) |
| BTE (element translacyjny podobny do BYDV) | Wirus żółtej karłowatości jęczmienia (BYDV) |
| PTE (element translacyjny podobny do PMV) | Wirus mozaiki paniki (PMV) |
| TSS (konstrukcja w kształcie litery T) | Wirus marszczenia rzepy (TCV) |
| W kształcie litery Y | Wirus karłowatości pomidora (TBSV) |
| w kształcie litery I | Wirus nekrotycznej smugi kukurydzy (MNeSV) |
Zobacz też
Dalsza lektura
- Nicholson, BL; Zaslaver, O; Mayberry, LK; Browning, KS; Biały, KA (luty 2013). „Wzmacniacz translacji Tombusvirus w kształcie litery Y tworzy kompleks z eIF4F i może być funkcjonalnie zastąpiony przez heterologiczne wzmacniacze translacji” . Dziennik wirusologii . 87 (3): 1872–1883. doi : 10.1128/JVI.02711-12 . PMC 3554133 . PMID 23192876 .