HOMER1

Identyfikatory
HOMER1
	, HOMER, HOMER1A, HOMER1B, HOMER1C, SYN47, Ves-1, homer scaffolding protein 1, homer scaffold protein 1
Identyfikatory zewnętrzne
Lokalizacja genu ( człowiek ) Chr. Zespół Początek Koniec
Lokalizacja genu ( mysz ) Chr. Zespół Początek Koniec
Wzór ekspresji RNA Błagam Człowiek Mysz (ortolog) BioGPS
Ontologia genów Funkcje molekularne Składnik komórkowy Proces biologiczny Źródła: Amigo / QuickGO
ortologi Gatunek Człowiek Mysz Entrez Ensembl UniProt RefSeq (mRNA) RefSeq (białko) Lokalizacja (UCSC) PubMed search
Wikidane
Wyświetl/edytuj człowieka Wyświetl/edytuj mysz

Homolog białka Homera 1 lub Homer1 jest białkiem neuronalnym , które u ludzi jest kodowane przez gen HOMER1 . Inne nazwy to Vesl i PSD-Zip45.

Struktura

Białko Homer1 ma N-końcową domenę EVH1 , zaangażowaną w interakcję z białkami, oraz C-końcową domenę typu coiled-coil zaangażowaną w samoasocjację. Składa się z dwóch głównych wariantów splicingu , forma krótka (Homer1a) i długa (Homer1b i c). Homer1a ma tylko domenę EVH1 i jest monomeryczny, podczas gdy Homer1b i 1c mają zarówno domeny EVH1, jak i cewki spiralnej i są tetrameryczne. Zwiniętą cewkę można dalej podzielić na połowę N-końcową i połowę C-końcową. Przewiduje się, że N-końcowa połowa domeny zwiniętej cewki będzie równoległym dimerem, podczas gdy połowa C-końca jest hybrydą dimerycznej i antyrównoległej tetramerycznej zwiniętej cewki. Przewiduje się, że jako całość długi Homer będzie miał strukturę podobną do hantli, w której dwie pary domen EVH1 znajdują się po dwóch stronach długiej (~ 50 nm) domeny zwojowej. Ssaki mają Homera2 i Homera3 , oprócz Homera1, które mają podobną strukturę domeny. Mają również podobne alternatywnie składane formy.

Dimeryczno-tetrameryczna domena typu coiled-coil Homer1b. Renderowanie PDB na podstawie 3CVE.

Dystrybucja tkanek

Homer1 jest powszechnie wyrażany w ośrodkowym układzie nerwowym, jak również w tkankach obwodowych, w tym w sercu , nerkach , jajnikach , jądrach i mięśniach szkieletowych . Subkomórkowo w neuronach Homer1 jest skoncentrowany w strukturach postsynaptycznych i stanowi większą część gęstości postsynaptycznej .

Funkcjonować

Domena EVH1 oddziałuje z motywem PPXXF. Ten motyw sekwencji istnieje w metabotroficznym receptorze glutaminianu grupy 1 (mGluR1 i mGluR5), receptorach IP ₃ (IP ₃ R), Shank , kanonicznych kanałach rodziny przejściowych potencjałów receptorów (TRPC) , drebranie , oligofreninie, dynaminie3 , CENTG1 i receptor ryanodyny . Dzięki swojej tetramerycznej strukturze proponuje się, aby długie formy Homera (takie jak Homer1b i Homer1c) krzyżowały różne białka. Na przykład grupa 1 mGluR jest powiązana krzyżowo ze swoim szlakiem sygnalizacyjnym, receptorem _{IP3 .} Ponadto, poprzez sieciowanie innego multimerycznego białka Shank, proponuje się, aby zawierało rdzeń o gęstości postsynaptycznej .

Warto zauważyć, że ekspresja Homera 1a jest indukowana przez aktywność neuronów, podczas gdy ekspresja Homera 1b i 1c jest konstytutywna. Tak więc Homer1a jest klasyfikowany jako natychmiastowy wczesny gen . Homer1a działa jako naturalna dominująca forma negatywna, która blokuje interakcje między długimi formami a ich białkami ligandowymi, konkurując z miejscem wiązania EVH1 na białkach ligandów. W ten sposób krótka forma Homera rozprzęga sygnalizację mGluR, a także kurczy kolca dendrytycznego . Dlatego krótka forma Homera jest uważana za część mechanizmu plastyczności homeostatycznej który tłumi reakcję neuronów, gdy aktywność wejściowa jest zbyt wysoka. Długa forma Homer1c odgrywa rolę w plastyczności synaptycznej i stabilizacji zmian synaptycznych podczas długotrwałego wzmacniania .

Doniesiono, że domena zwiniętej cewki oddziałuje z syntaksyną13 i aktywowanym Cdc42 . Interakcja z Cdc42 hamuje aktywność Cdc42 do przebudowy struktury kręgosłupa dendrytycznego.

Szybkie działanie przeciwdepresyjne

Homer1a przełącza sygnalizację mGluR5, aby zwiększyć aktywność receptora AMPA dla szybkich działań przeciwdepresyjnych braku snu.

Zobacz też

• HOMER2
• HOMER3

Dalsza lektura

•    Xiao B, Tu JC, Worley PF (czerwiec 2000). „Homer: związek między aktywnością neuronów a funkcją receptora glutaminianu”. Aktualna opinia w neurobiologii . 10 (3): 370–374. doi : 10.1016/S0959-4388(00)00087-8 . PMID 10851183 . S2CID 8699597 .
•   Maruyama K, Sugano S (styczeń 1994). „Oligo-capping: prosta metoda zastąpienia struktury czapeczki eukariotycznych mRNA oligorybonukleotydami”. gen . 138 (1–2): 171–174. doi : 10.1016/0378-1119(94)90802-8 . PMID 8125298 .
•   Hillier LD, Lennon G, Becker M, Bonaldo MF, Chiapelli B, Chissoe S i in. (wrzesień 1996). „Generowanie i analiza 280 000 znaczników sekwencji wyrażanych przez człowieka” . Badania genomu . 6 (9): 807–828. doi : 10.1101/gr.6.9.807 . PMID 8889549 .
•    Brakeman PR, Lanahan AA, O'Brien R, Roche K, Barnes CA, Huganir RL, Worley PF (marzec 1997). „Homer: białko, które selektywnie wiąże metabotropowe receptory glutaminianu”. Natura . 386 (6622): 284–288. Bibcode : 1997Natur.386..284B . doi : 10.1038/386284a0 . PMID 9069287 . S2CID 4346579 .
•   Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (październik 1997). „Konstrukcja i charakterystyka biblioteki cDNA wzbogaconej o pełnej długości i wzbogaconej o koniec 5'”. gen . 200 (1–2): 149–156. doi : 10.1016/S0378-1119(97)00411-3 . PMID 9373149 .
•    Tu JC, Xiao B, Naisbitt S, Yuan JP, Petralia RS, Brakeman P i in. (lipiec 1999). „Sprzęganie kompleksów mGluR / Homer i PSD-95 przez rodzinę Shank białek gęstości postsynaptycznej” . neuron . 23 (3): 583–592. doi : 10.1016/S0896-6273(00)80810-7 . PMID 10433269 . S2CID 16429070 .
•   Roche KW, Tu JC, Petralia RS, Xiao B, Wenthold RJ, Worley PF (wrzesień 1999). „Homer 1b reguluje handel metabotropowymi receptorami glutaminianu grupy I” . Journal of Biological Chemistry . 274 (36): 25953–25957. doi : 10.1074/jbc.274.36.25953 . PMID 10464340 .
•   Minakami R, Kato A, Sugiyama H (czerwiec 2000). „Interakcja Vesl-1L / Homer 1c z syntaksyną 13”. Komunikaty dotyczące badań biochemicznych i biofizycznych . 272 (2): 466–471. doi : 10.1006/bbrc.2000.2777 . PMID 10833436 .
•    Ango F, Prézeau L, Muller T, Tu JC, Xiao B, Worley PF i in. (czerwiec 2001). „Niezależna od agonisty aktywacja metabotropowych receptorów glutaminianu przez wewnątrzkomórkowe białko Homer”. Natura . 411 (6840): 962–965. doi : 10.1038/35082096 . PMID 11418862 . S2CID 4417727 .
•   Wistow G, Bernstein SL, Wyatt MK, Fariss RN, Behal A, Touchman JW i in. (czerwiec 2002). „Analiza znaczników sekwencji ekspresjonowanej ludzkiego RPE / naczyniówki dla projektu NEIBank: ponad 6000 nieredundantnych transkryptów, nowych genów i wariantów składania”. Wizja molekularna . 8 : 205–220. PMID 12107410 .
•   Feng W, Tu J, Yang T, Vernon PS, Allen PD, Worley PF, Pessah IN (listopad 2002). „Homer reguluje wzmocnienie kompleksu kanałów receptora rianodyny typu 1” . Journal of Biological Chemistry . 277 (47): 44722–44730. doi : 10.1074/jbc.M207675200 . PMID 12223488 .
•   Hwang SY, Wei J, Westhoff JH, Duncan RS, Ozawa F, Volpe P i in. (sierpień 2003). „Różnicowa interakcja funkcjonalna dwóch izoform białka Vesl / Homer z receptorem rianodyny typu 1: nowy mechanizm kontroli wewnątrzkomórkowej sygnalizacji wapnia”. wapń komórkowy . 34 (2): 177–184. doi : 10.1016/S0143-4160(03)00082-4 . PMID 12810060 .
•    Norton N, Williams HJ, Williams NM, Spurlock G, Zammit S, Jones G i in. (lipiec 2003). „Przeszukiwanie mutacji rodziny genów Homera i analiza asocjacji w schizofrenii”. American Journal of Medical Genetics. Część B, Genetyka neuropsychiatryczna . 120B (1): 18–21. doi : 10.1002/ajmg.b.20032 . PMID 12815733 . S2CID 25053099 .
•   Westhoff JH, Hwang SY, Duncan RS, Ozawa F, Volpe P, Inokuchi K, Koulen P (wrzesień 2003). „Białka Vesl / Homer regulują funkcję receptora rianodyny typu 2 i wewnątrzkomórkową sygnalizację wapnia”. wapń komórkowy . 34 (3): 261–269. doi : 10.1016/S0143-4160(03)00112-X . PMID 12887973 .
•    Yuan JP, Kiselyov K, Shin DM, Chen J, Shcheynikov N, Kang SH i in. (wrzesień 2003). „Homer wiąże kanały z rodziny TRPC i jest wymagany do bramkowania TRPC1 przez receptory IP3” . komórka . 114 (6): 777–789. doi : 10.1016/S0092-8674(03)00716-5 . PMID 14505576 . S2CID 10552676 .
•    Rong R, Ahn JY, Huang H, Nagata E, Kalman D, Kapp JA i in. (listopad 2003). „Wzmacniacz kinazy PI3 - kompleks Homera łączy mGluRI z kinazą PI3, zapobiegając apoptozie neuronów”. Natura Neurobiologia . 6 (11): 1153–1161. doi : 10.1038/nn1134 . PMID 14528310 . S2CID 807407 .