Domena WH1
| Identyfikatory | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| domeny WH1 | |||||||||
| Symbol | WH1 | ||||||||
| Pfam | PF00568 | ||||||||
| InterPro | IPR000697 | ||||||||
| MĄDRY | WH1 | ||||||||
| SCOP2 | 1evh / ZAKRES / SUPFAM | ||||||||
| CDD | cd01205 | ||||||||
| |||||||||
Domena WH1 jest konserwowaną ewolucyjnie domeną białkową . Pełni więc ważną funkcję.
Funkcjonować
Domeny WH1 znajdują się na białkach WASP, które często biorą udział w polimeryzacji aktyny. Dlatego WH1 jest ważny dla wszystkich procesów komórkowych z udziałem aktyny, w tym ruchliwości komórek, przemieszczania się komórek, podziału i cytokinezy komórek, sygnalizacji komórkowej oraz tworzenia i utrzymywania połączeń komórkowych i kształtu komórek.
Struktura
Struktura trzeciorzędowa domeny WH1 białka Mena ujawniła podobieństwa strukturalne z domeną plekstryny (PH). Ogólny fałd składa się ze zwartej równoległej kanapki beta, zamkniętej wzdłuż jednej krawędzi długą helisą alfa . Wysoce konserwatywny klaster trzech odsłoniętych na powierzchni aromatycznych łańcuchów bocznych tworzy miejsce rozpoznawania docelowych ligandów cząsteczki .
Interakcje
Rodzina białek WASP kontroluje polimeryzację aktyny poprzez aktywację kompleksu Arp2/3. WASP jest wadliwy w zespole Wiskotta-Aldricha (WAS), w którym u większości pacjentów większość mutacji punktowych występuje w N-końcowej domenie WH1. Metabotropowe receptory glutaminianu mGluR1alpha i mGluR5 wiążą białko zwane homerem, które jest homologiem domeny WH1.
Białka z rodziny WASP zawierają EVH1 (WH1) na swoich N-końcach, które wiążą sekwencje bogate w prolinę w białku oddziałującym z WASP. Białka z rodziny RanBP1 zawierają domenę WH1 w swoim regionie N-końcowym, która wydaje się wiązać inny motyw sekwencji obecny w C-końcowej części białka RanGTP.
Struktura trzeciorzędowa domeny WH1 białka Mena ujawniła podobieństwa struktury z domeną homologii plekstryny (PH). Ogólny fałd składa się ze zwartej równoległej kanapki beta, zamkniętej wzdłuż jednej krawędzi długą helisą alfa. Wysoce konserwatywny klaster trzech odsłoniętych na powierzchni aromatycznych łańcuchów bocznych tworzy miejsce rozpoznawania cząsteczek docelowych ligandów.
EVH1
| EVH1 złożonych | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| identyfikatorów | |||||||||
 domeny n-wasp evh1-wip
| |||||||||
| Symbol | EVH1 | ||||||||
| Pfam | PF00568 | ||||||||
| Klan Pfam | CL0266 | ||||||||
| InterPro | IPR000697 | ||||||||
| MĄDRY | WH1 | ||||||||
| SCOP2 | 1evh / ZAKRES / SUPFAM | ||||||||
| CDD | cd00837 | ||||||||
| |||||||||
Podzbiór domen WH1 został nazwany domeną EVH1 wiążącą motyw poliproliny. Domena EVH1 (znana również jako domena WH1 , RanBP1-WASP lub domena włączona/homologiczna 1 VASP ) jest również konserwowaną ewolucyjnie domeną białkową . Domeny EVH1 rozpoznają i wiążą bogaty w prolinę motyw FPPPP z niskim powinowactwem, następnie powstają dalsze interakcje między resztami flankującymi.
Domena EVH1 znajduje się w wielodomenowych białkach homologii Ena / Vasp zaangażowanych w różnorodne zdarzenia sygnalizacji, transportu jądrowego i cytoszkieletu . Ta domena składająca się z około 115 aminokwasów występuje u różnych gatunków, od drożdży po ssaki . Wiele białek zawierających EVH1 wiąże się ze strukturami opartymi na aktynie i odgrywa rolę w organizacji cytoszkieletu . Domeny EVH1 rozpoznają i wiążą motyw bogaty w prolinę FPPPP o niskim powinowactwie, następnie tworzą się dalsze interakcje między resztami flankującymi.
Przykłady
Ludzkie geny kodujące białka zawierające domenę WH1 (EVH1) obejmują:
Linki zewnętrzne
- Eukariotyczna klasa motywów motywów liniowych LIG_EVH1_1
- Eukariotyczna klasa motywów motywów liniowych LIG_EVH1_2
- klasa motywów motywów liniowych LIG_WH1