halobakterie
Klasyfikacja naukowa | |
---|---|
Halobacteriales | |
Domena: | |
Królestwo: | |
Gromada: | |
Klasa: | |
Zamówienie: |
halobakterie
Grant i Larsen, 1989
|
Rodziny | |
Halobacteriales to rząd halobakterii , występujących w wodzie nasyconej lub prawie nasyconej solą. Nazywa się je również halofilami , chociaż ta nazwa jest również używana w odniesieniu do innych organizmów żyjących w nieco mniej stężonej słonej wodzie. Są powszechne w większości środowisk, w których dostępne są duże ilości soli, wilgoci i substancji organicznych. Duże kwiaty wydają się czerwonawe, od pigmentu bakteriorodopsyny . Ten pigment służy do pochłaniania światła, które dostarcza energii do tworzenia ATP . Halobakterie posiadają również drugi pigment, halorodopsyna , która pompuje jony chlorkowe w odpowiedzi na fotony, tworząc gradient napięcia i pomagając w produkcji energii ze światła. Proces ten nie ma związku z innymi formami fotosyntezy obejmującymi transport elektronów; jednak halobakterie nie są w stanie wiązać węgla z dwutlenku węgla .
Halobakterie mogą istnieć w słonych środowiskach, ponieważ chociaż są tlenowcami , mają odrębny i inny sposób wytwarzania energii poprzez fotosyntezę . Części błon halobakterii mają kolor purpurowy. Części te przeprowadzają reakcje fotosyntetyczne raczej z barwnikiem siatkówki niż z chlorofilem . To pozwala im stworzyć gradient protonów w poprzek błony komórki, który może być wykorzystany do wytworzenia ATP na własny użytek. Niektóre gatunki w tej kolejności są wykorzystywane jako organizmy modelowe do badania, w jaki sposób niektóre mikroorganizmy mogą przetrwać w środowiskach hipersalinowych, do zrozumienia procesów komórkowych i do badania ich fizjologii.
Ekologia
Siedliska
Zazwyczaj Halobacteriales rosną w środowiskach tlenowych i o wysokim zasoleniu. Halobacteriales zostały znalezione w słonych jeziorach, morskich salternach, wodzie morskiej, solach słonecznych i solonych produktach spożywczych. W większości przedstawiciele rzędu Halobacteriales mogą przebywać w środowiskach, w których stężenie soli (NaCl) przekracza 25%. Jednak mogą również przetrwać w środowiskach o niskim stężeniu soli, od 1 do 3,5%. Badania pokazują, że Halobacteriales można znaleźć również w środowiskach, w których zachodzi redukcja siarki, a także w zasolonych solach, czarnych palaczach wody morskiej, przybrzeżnych słonych bagnach i konstrukcjach kominów. Wyniki te pokazują, że Halobacteriales potrzebują tylko wystarczającej ilości soli, aby zapobiec ich lizie, a zatem mogą rosnąć w środowiskach o niskim stężeniu zasolenia.
Obecna taksonomia
Halobacteriales była dużą, zróżnicowaną filogenetycznie linią, obejmującą wszystkie gatunki Halobacteria. Szeroka gama cech biochemicznych i różne nisze ekologiczne klasy Haloarchaea okazały się niewiarygodnym narzędziem w wyjaśnianiu ewolucyjnych powiązań Halobacteria powyżej poziomu rodzaju.
W 2015 roku Gupta i in. zaproponował podział klasy Halobacteria na trzy rzędy, Halobacteriales, Haloferacales i Natrialbales , w oparciu o porównawcze analizy genomiczne i wzór rozgałęzień różnych drzew filogenetycznych zbudowanych z kilku różnych zestawów danych konserwowanych białek i sekwencji 16S rRNA. Podział ten znacznie ograniczył przynależność do rzędu Halobacteriales , obejmując tylko gatunki blisko spokrewnione z rodzajem typu Halobacterium.
Kolejne badanie badające wyższe zależności taksonomiczne w obrębie rzędu Halobacteriales zaowocowało podziałem rzędu na trzy rodziny, Halobacteriaceae , Haloarculaceae i Halococcaceae , z których każdy można odróżnić od siebie i wszystkich innych gatunków dzięki obecności wielu wysoce specyficznych sygnatur molekularnych , znane jako zachowane indele sygnaturowe .
Dalsza lektura
Czasopisma
- Wright AG (czerwiec 2006). „Związki filogenetyczne w kolejności Halobacteriales wywnioskowanej z sekwencji genów 16S rRNA” . International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology . 56 (Pt 6): 1223-1227. doi : 10.1099/ijs.0.63776-0 . PMID 16738095 .
- Komisja sądowa Międzynarodowego Komitetu Systematyki Prokariotów (styczeń 2005). „Nomenklaturalne typy rzędów Acholeplasmatales, Halanaerobiales, Halobacteriales, Methanobacteriales, Methanococcales, Methanobacteriales, Planctomycetales, Prochlorales, Sulfobales, Thermococcales, Thermoproteales i Verrucomicrobiales to rodzaje Acholeplasma, Halanaerobium, Halobacterium, Methanobacterium, Methanococcus, Methanomic robium, Planctomyces, Prochloron, Sulfolobus , odpowiednio Thermococcus, Thermoproteus i Verrucomicrobium. Opinia 79" . International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology . 55 (część 1): 517–518. doi : 10.1099/ijs.0.63548-0 . PMID 15653928 .
- Cavalier-Smith T (styczeń 2002). „Neomurańskie pochodzenie archebakterii, negibakteryjny korzeń drzewa uniwersalnego i megaklasyfikacja bakterii” . International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology . 52 (część 1): 7–76. doi : 10.1099/00207713-52-1-7 . PMID 11837318 .
- Euzéby JP, Tindall BJ (marzec 2001). „Rozporządzenia typu nomenklaturowego: konieczne poprawki zgodnie z regułami 15 i 21a Kodeksu bakteriologicznego (wersja 1990) oraz oznaczenie odpowiednich typów klas i podklas nomenklaturalnych. Prośba o opinię” . International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology . 51 (część 2): 725–727. doi : 10.1099/00207713-51-2-725 . PMID 11321122 .
- Cavalier-Smith T (1986). „Królestwa organizmów”. Natura . 324 (6096): 416–7. Bibcode : 1986Natur.324..416C . doi : 10.1038/324416a0 . PMID 2431320 . S2CID 5242667 .
- Gupta RS, Naushad S, Baker S (marzec 2015). „Analizy filogenomiczne i sygnatury molekularne dla klasy Halobacteria i jej dwóch głównych kladów: propozycja podziału klasy Halobacteria na poprawiony rząd Halobacteriales i dwa nowe rzędy, Haloferacales ord. Nov. I Natrialbales ord. Nov., Zawierające nowe rodziny Haloferacaceae fam. nov. i Natrialbaceae fam. nov" . International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology . 65 (część 3): 1050–1069. doi : 10.1099/ijs.0.070136-0 . PMID 25428416 .
Książki
- Grant WD, Kamekura M, McGenity TJ, Ventosa A (2001). „Klasa III. Halobacteria klasa. lis.” . W DR Boone, RW Castenholz (red.). Bergey's Manual of Systematic Bacteriology, tom 1: Archaea i głęboko rozgałęzione i fototroficzne bakterie (wyd. 2). Nowy Jork: Springer Verlag . P. 169 . ISBN 978-0-387-98771-2 .
- Grant WD, Larsen H (1989). „Grupa III. Niezwykle halofilne archeobakterie. Zamów Halobacteriales ord. Nov.”. W JT Staley, poseł Bryant, N Pfennig, JG Holt (red.). Bergey's Manual of Systematic Bacteriology, tom 3 (wyd. 1). Baltimore: The Williams & Wilkins Co. str. 169.