Mały cytoplazmatyczny RNA związany z MALAT1
| Mały cytoplazmatyczny RNA związany z MALAT1 | |
|---|---|
 Przewidywana struktura drugorzędowa i konserwacja sekwencji mascRNA-menRNA
| |
| identyfikatorów | |
| Symbol | mascRNA-menRNA |
| Rfam | RF01684 |
| Inne dane | |
| typ RNA | Gen |
| Domeny | Eukariota |
| IŚĆ | GO:2000147 |
| WIĘC | SO: 0001263 |
| Struktury PDB | PDBe |
Mały cytoplazmatyczny RNA związany z MALAT1 , znany również jako mascRNA , jest niekodującym RNA znajdującym się w cytozolu . Jest to mały RNA, o długości około 53-61 nukleotydów, który jest przetwarzany ze znacznie dłuższego ncRNA zwanego MALAT1 przez enzym zwany RNazą P. Ten RNA ulega ekspresji w wielu różnych tkankach ludzkich, jest wysoce konserwowany przez ewolucję i ma niezwykłe podobieństwo do tRNA który jest również wytwarzany przez RNazę P, ale ten RNA nie jest aminoacylowany w komórkach HeLa. Pierwotny transkrypt, MALAT1 (transkrypt gruczolakoraka płuc związany z przerzutami 1), wydaje się być regulowany w górę w kilku nowotworach złośliwych . Inny mały RNA, który jest homologiczny do mascRNA, zwany menRNA, jest przetwarzany z innego długiego ncRNA, zwanego MEN beta.
Wydaje się, że MALAT1 bierze udział w regulacji alternatywnego splicingu . MALAT1 oddziałuje z białkami SR , wpływając na ich rozmieszczenie w domenach plamek jądrowych .
Zobacz też
Dalsza lektura
- Bernard D, Prasanth KV, Tripathi V, Colasse S, Nakamura T, Xuan Z, Zhang MQ, Sedel F, Jourdren L, Coulpier F, Triller A, Spector DL, Bessis A (2010). „Długi niekodujący RNA zatrzymywany w jądrze reguluje synaptogenezę poprzez modulację ekspresji genów” . EMBO J. 29 (18): 3082–3093. doi : 10.1038/emboj.2010.199 . PMC 2944070 . PMID 20729808 .
- Tano K, Mizuno R, Okada T, Rakwal R, Shibato J, Masuo Y, Ijiri K, Akimitsu N (2010). „MALAT-1 zwiększa ruchliwość komórek komórek gruczolakoraka płuc poprzez wpływ na ekspresję genów związanych z ruchliwością”. FEBS Lett . 584 (22): 4575–4580. doi : 10.1016/j.febslet.2010.10.008 . PMID 20937273 .