Modulibakterie
| Klasyfikacja naukowa | |
|---|---|
| Modulibacteria | |
| Domena: | |
| Gromada: |
„ Modulibakterie ”
|
| Klasa: |
„ modulifleksja ”
|
| Zamówienie: |
„ Moduliflexales ”
|
| Rodzina: |
„Moduliflexaceae”
Sekiguchi i in. 2015
|
| Rodzaj | |
|
|
Modulibacteria to typ bakterii znany wcześniej jako KS3B3 lub GN06 . Jest kandydującym , co oznacza, że nie ma kulturowych przedstawicieli tej grupy. Członkowie rodzaju Modulibacteria są znani z tego, że powodują śmiertelny przerost włókien (pęcznienie) w wysokowydajnych przemysłowych beztlenowych bioreaktorach do oczyszczania ścieków .
Typ Modulibacteria został po raz pierwszy zaproponowany w 2006 roku przez dwie niezależne grupy badawcze na podstawie analiz sekwencji genów 16S rRNA . Jedna grupa odzyskała sekwencje Modulibacteria z hipersalinowej maty mikrobiologicznej z Guerrero Negro (Baja California Sur, Meksyk) i użyła tymczasowej nazwy GN06 dla nowego typu , podczas gdy druga odzyskała sekwencje z osadów morskich z czarnego błota bogatego w siarkę (CA, USA) i używał tymczasowej nazwy KSB3.
Pierwszy wgląd genomiczny w gromadę uzyskano w 2015 r., Kiedy to zaproponowano nazwę „Modulibacteria”. Dwa genomy odzyskano z metanogennych próbek osadu pełnoskalowego reaktora z beztlenowym kocem szlamowym (UASB) z przepływem w górę, oczyszczającego ścieki organiczne o wysokiej zawartości alkoholu odprowadzane z fabryki przetwórstwa spożywczego.
Dzięki połączeniu opartej na genomie rekonstrukcji metabolicznej i obserwacji mikroskopowej ustalono, że dwa badane gatunki Modulibacteria ( Moduliflexus flocculans i Vecturithrix granuli ) wytwarzają struktury nitkowate i są Gram-ujemnymi , ściśle beztlenowymi fermentorami zdolnymi do ruchu ślizgowego bez wici. Obie mają niezwykle dużą liczbę genów regulujących czucie i odpowiedź w porównaniu z innymi bakteriami.
Członkowie gromady Modulibacteria zostali wykryci w różnych środowiskach oprócz bioreaktorów i mat hipersalinowych, takich jak osady mokradeł ( FJ516883.1 ), usta delfina i tubeworm z coldseep ( FM165273 ).
Taksonomia
Następująca taksonomia została zaproponowana przez Sekiguchi i in. 2015. Filogeneza autorstwa Annotree v1.2.0, która wykorzystuje GTDB 05-RS95 ( baza danych taksonomii genomu )
- Klasa „ Moduliflexia ” Sekiguchi i in. 2015 ["Vecturitrichia" Sekiguchi i in. 2015 ]
- Zamów „ Moduliflexales ” Sekiguchi et al. 2015 ["Vecturatrichales" Sekiguchi i in. 2015 ]
- Rodzina „Moduliflexaceae” Sekiguchi et al. 2015 ["Vecturatrichaceae" Sekiguchi i in. 2015 ]
-
Rodzaj „ Candidatus Moduliflexus” Sekiguchi et al. 2015
- Gatunek „ C. M. flocculans” Sekiguchi et al. 2015
-
Rodzaj „ Candidatus Vecturithrix” Sekiguchi et al. 2015
- Gatunek „ C. V. granuli” Sekiguchi et al. 2015
-
Rodzaj „ Candidatus Moduliflexus” Sekiguchi et al. 2015
- Rodzina „Moduliflexaceae” Sekiguchi et al. 2015 ["Vecturatrichaceae" Sekiguchi i in. 2015 ]
- Zamów „ Moduliflexales ” Sekiguchi et al. 2015 ["Vecturatrichales" Sekiguchi i in. 2015 ]