PPIB

PPIB
Protein PPIB PDB 1cyn.png
Dostępne konstrukcje
WPB Wyszukiwanie ortologów:
Identyfikatory
, CYP-S1, CYPB, HEL-S-39, OI9, SCYLP, izomeraza peptydyloprolilowa B, B
Identyfikatory zewnętrzne
ortologi
Gatunek Człowiek Mysz
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNA)

RefSeq (białko)

Lokalizacja (UCSC)
PubMed search
Wikidane
Wyświetl/edytuj człowieka Wyświetl/edytuj mysz

Peptydylo-prolilo cis-trans izomeraza B jest enzymem kodowanym przez gen PPIB . Jako członek rodziny izomerazy cis-trans peptydylo-prolilu (PPIaza), białko to katalizuje izomeryzację cis-trans imidowych wiązań peptydowych proliny, co pozwala mu regulować fałdowanie białek kolagenu typu I. Ogólnie rzecz biorąc, PPIazy występują we wszystkich eubakteriach i eukariontach , a także w kilku archebakteriach , a zatem są wysoce konserwatywne.

Struktura

Podobnie jak inne cyklofiliny , PPIB tworzy strukturę β-beczki z hydrofobowym rdzeniem. Ta beczka β składa się z ośmiu antyrównoległych nici β i jest ograniczona dwiema helisami α na górze i na dole. Ponadto β-zwoje i pętle w pasmach przyczyniają się do elastyczności lufy. W szczególności PPIB jest białkiem o masie cząsteczkowej 21 kDa, które zawiera C-końcowy motyw retencyjny ER, który kieruje białko do organelli ER , podczas gdy jego N-końcowe przedłużenie przyłącza je do swoich substratów .

Funkcjonować

PPIB należy do rodziny izomerazy cis-trans peptydylo-prolilu ( PPIazy ). PPIazy katalizują izomeryzację cis-trans imidowych wiązań peptydowych proliny oraz regulują fałdowanie i dojrzewanie białek. Prolina jest jedynym aminokwasem, o którym wiadomo, że istnieje zarówno z szybkością izomeryzacji cis , jak i trans in vivo i często jest etapem ograniczającym szybkość ponownego fałdowania białka. Rodzina PPIaz jest dalej podzielona na trzy strukturalnie odrębne podrodziny: cyklofilina (CyP), białko wiążące FK506 ( FKBP ) i parwulina (Pvn). Chociaż każda rodzina wykazuje aktywność PPIazy, rodziny nie mają sekwencji podobieństw strukturalnych. Jako cyklofilina, PPIB wiąże cyklosporynę A (CsA) i może być znaleziona w komórce lub wydzielana przez komórkę.

Ludzki PPIB

PPIB jest drugą z 18 cyklofilin zidentyfikowanych u ludzi, po CypA. PPIB lokalizuje się w retikulum endoplazmatycznym (ER) i bierze udział w wielu procesach biologicznych, w tym w metabolizmie mitochondriów , apoptozie , redoks i stanach zapalnych , a także w powiązanych chorobach i stanach, takich jak niedokrwienne uszkodzenie reperfuzyjne , AIDS i rak . Jest to również związane z infekcjami wirusowymi. U eukariontów cyklofiliny lokalizują się wszechobecnie w wielu typach komórek i tkanek. Oprócz aktywności PPIazy i białka opiekuńczego , cyklofiliny działają w metabolizmie mitochondriów , apoptozie , odpowiedzi immunologicznej, zapaleniu oraz wzroście i proliferacji komórek . Wraz z PPIC , PPIB lokalizuje się w retikulum endoplazmatycznym (ER), gdzie utrzymuje homeostazę redoks . Wyczerpanie tych dwóch cyklofilin prowadzi do hiperutleniania ER.

W ER PPIB oddziałuje z białkami, takimi jak P3H1, CRTAP, BiP, GRP94, PDI i kalretikulina, tworząc kompleksy foldazy i białek opiekuńczych oraz ułatwiając fałdowanie białek, zwłaszcza kolagenu typu I. Białko to jest główną PPIazą dla kolagenu typu I, ponieważ kolagen zawiera mnóstwo prolin, które wymagają izomeryzacji cis-trans do prawidłowego fałdowania. Tak więc PPIB jest niezbędny do biosyntezy kolagenu i modyfikacji potranslacyjnych oraz wpływa na składanie włókienek, sieciowanie macierzy i mineralizację kości.

Ponadto jest związana ze szlakiem wydzielniczym i uwalniana w płynach biologicznych. Białko to może wiązać się z komórkami pochodzącymi z limfocytów T i B i może regulować immunosupresję, w której pośredniczy cyklosporyna A. W jednym eksperymencie dodanie PPIB do hodowli komórkowych indukowało chemotaksję in vitro i adhezję komórek T za pośrednictwem integryny do macierzy pozakomórkowej (ECM), co sugeruje, że może działać we wrodzonej odporności poprzez rekrutację komórek T do zakażonej tkanki in vivo.

Znaczenie kliniczne

Jako cyklofilina, PPIB wiąże lek immunosupresyjny CsA, tworząc kompleks CsA-cyklofilina, który następnie celuje w kalcyneurynę w celu zahamowania szlaku sygnałowego aktywacji komórek T.

Zaobserwowano, że w komórkach mięśnia sercowego cyklofiliny są aktywowane przez szok termiczny i niedotlenienie -reoksygenację, a także kompleksy z białkami szoku cieplnego . Zatem cyklofiliny mogą działać kardioprotekcyjnie podczas uszkodzenia niedokrwienno-reperfuzyjnego.

PPIB przyczynia się do replikacji i infekcji wirusów powodujących choroby, takie jak AIDS , wirusowe zapalenie wątroby typu C , odra i grypa A. Zatem ukierunkowanie terapeutyczne PPIB za pomocą selektywnych inhibitorów może okazać się skuteczne w zwalczaniu infekcji wirusowych i stanów zapalnych. Obecnie PPIB jest wykorzystywany jako biomarker różnych typów nowotworów. Co więcej, istnieją dwa epitopy antygenowe (CypB84-92 i CypB91-99) rozpoznawane przez ograniczone do HLA-A24 i specyficzne dla nowotworu cytotoksyczne limfocyty T , które mogą być stosowane jako szczepionki przeciwnowotworowe i faktycznie były stosowane w leczeniu raka płuc w badaniu klinicznym.

Bakteryjny PPIB

PPIB zidentyfikowano zarówno u bakterii Gram-ujemnych , jak i Gram-dodatnich jako białko wewnątrzkomórkowe. Wykazano, że w Escherichia coli PPIB ma zarówno aktywność PPIazy , jak i aktywność białka opiekuńczego . U Staphylococcus aureus wykazano, że PPIB ma aktywność PPIazy i bezpośrednio pomaga w ponownym fałdowaniu nukleazy gronkowcowej . Oprócz tych bakterii, PPIB zidentyfikowano w Brucella abortus , Mycobacterium tuberculosis , Bacillus subtilis i inne bakterie.

Interakcje

Wykazano, że PPIB wchodzi w interakcje z:

Dalsza lektura

Linki zewnętrzne

Pobrano z „ https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=PPIB&oldid=1142732186 ”