Pacific Blue (barwnik)
|
|
| Nazwy | |
|---|---|
|
Preferowana nazwa IUPAC
kwas 6,8-difluoro-7-hydroksy-2-okso-2H - 1-benzopirano-3-karboksylowy |
|
| Identyfikatory | |
|
Model 3D ( JSmol )
|
|
| CHEBI | |
| CHEMBL | |
| ChemSpider | |
|
Identyfikator klienta PubChem
|
|
|
|
|
|
| Nieruchomości | |
| C 10 H 4 F 2 O 7 | |
| Masa cząsteczkowa | 274,132 g·mol -1 |
|
O ile nie zaznaczono inaczej, dane podano dla materiałów w stanie normalnym (przy 25°C [77°F], 100 kPa).
|
|
Pacific Blue , czyli systematycznie 3-karboksy-6,8-difluoro-7-hydroksykumaryna, jest fluoroforem stosowanym w biologii komórki . Jego wzbudzenia przypada na 401 nm, a maksimum emisji na 452 nm. W przeciwieństwie do mniej kwaśnej 7-hydroksy-3-karboksykumaryny (pKa=7,0), wysoka kwasowość fenolu Pacific Blue (pKa=3,7) powoduje, że jego fluorescencja pozostaje bardzo wysoka przy obojętnym pH.
Pacific Blue należy do grupy barwników Pacific, która obejmuje Pacific Orange, Pacific Green i Pacific Blue. Wszystkie te barwniki fluorescencyjne mają maksimum absorpcji między 400 a 410 nm, ale z różnymi widmami emisji: umożliwia to jednoczesne wzbudzenie za pomocą jednego lasera, wytwarzając emisję przy maksimach odpowiednio 551 nm, 500 nm i 455 nm (uwaga: maksima absorpcji i emisji mogą różnią się w zależności od producenta).
W cytometrii przepływowej Pacific Blue (podobnie jak inne barwniki Pacific) absorbuje blisko 405 nm, uniemożliwiając jednoczesne użycie z innymi fluoroforami, które mają podobne widma wzbudzenia i/lub emisji, takimi jak Brilliant Violet 421 (BV421) lub V450.
Stosowanie
Do celów immunohistochemii lub ogólnie barwienia ukierunkowanego, do znakowania przeciwciał ukierunkowanych stosuje się reaktywne formy Pacific Blue . Pochodne Pacific Blue zostały wykorzystane do badania interakcji małych cząsteczek z białkami przy użyciu transferu energii rezonansu fluorescencji (FRET). Pacific Blue był również używany do badania interakcji leku przeciwnowotworowego paklitakselu (taksol) z tubuliną w żywych komórkach. Stosowane formy reaktywne obejmują ester sukcynimidylowy Pacific Blue i C5- maleimid Pacific Blue .