ChemSpider
 | |
| Treść | |
|---|---|
| Opis | Baza danych struktur chemicznych zapewniająca szybki dostęp do ponad 100 milionów struktur, właściwości i powiązanych informacji. |
| Kontakt | |
| Centrum Badań | Raleigh, Karolina Północna , Stany Zjednoczone |
| Laboratorium | |
| Dostęp | |
| Strona internetowa | www.chemspider.com |
| Narzędzia | |
| Samodzielny | https://itunes.apple.com/us/app/chemspider/id458878661 |
| Różnorodny | |
| Licencja | Creative Commons Uznanie autorstwa Na tych samych warunkach |
ChemSpider to baza danych chemikaliów . ChemSpider jest własnością Królewskiego Towarzystwa Chemii .
Baza danych
Baza danych zawiera informacje o ponad 100 milionach cząsteczek z ponad 270 źródeł danych, w tym:
- EPA DSSTOx
- Amerykańska Agencja ds. Żywności i Leków (FDA)
- Baza danych ludzkiego metabolomu
- Dziennik Chemii Heterocyklicznej
- KEGG
- KUMGM
- LeadScope
- LipidMAPS
- Marinlit
- MDPI
- MICAD
- MLSMR
- MMDB
- MOLI
- MTDP
- Nanogen
- Przyroda Biologia chemiczna
- NCGC
- NIAID
- Narodowe Instytuty Zdrowia (NIH)
- Program badań przesiewowych leków zatwierdzony przez NINDS
- NIST
- NIST Chemii WebBook
- NMMLSC
- NMRShiftDB
- PIÓROPUSZ
- PCMD
- PDSP
- Peptydy
- Prous Science Leki przyszłości
- QSAR
- Chemikalia badawczo-rozwojowe
- Centrum Genomiki Chemicznej w San Diego
- SGCOxZwiązki, SGCStoZwiązki
- SMID
- Okular
- Konsorcjum Genomiki Strukturalnej
- SureChem
- Synthon-Lab
- Thomson Pharma
- Wszystkie bloki konstrukcyjne TOSLab
- UM-BBD
- UPCMLD
- PrzydatneChem
- Sieć nauki
- xPharm
Każda substancja chemiczna otrzymuje unikalny identyfikator , który stanowi część odpowiedniego adresu URL. Na przykład aceton ma 175, a zatem ma adres URL http://www.chemspider.com/Chemical-Structure.175.html
Crowdsourcing
Bazę danych ChemSpider można aktualizować za pomocą wkładu użytkowników, w tym osadzania struktury chemicznej , osadzania spektralnego i kontroli użytkowników. Jest to crowdsourcingowe do opracowania internetowej bazy danych chemii. Dzięki gromadzeniu danych opartemu na crowdsourcingu powstał słownik nazw chemicznych związanych ze strukturami chemicznymi, który był używany w zastosowaniach eksploracji tekstu literatury biomedycznej i chemicznej.
Jednak prawa do bazy danych nie są uchylane, a zrzut danych nie jest dostępny; w rzeczywistości często zadawane pytania stwierdzają nawet, że dozwolone jest tylko ograniczone pobieranie: dlatego prawo do rozwidlenia nie jest gwarantowane, a projektu nie można uznać za wolny / otwarty .
Badawczy
Dostępnych jest kilka dostępnych modułów wyszukiwania:
- Wyszukiwanie standardowe umożliwia wyszukiwanie nazw systematycznych , nazw handlowych i synonimów oraz numerów rejestrów
- Wyszukiwanie zaawansowane umożliwia interaktywne wyszukiwanie według struktury chemicznej, podstruktury chemicznej, przy użyciu wzoru cząsteczkowego i zakresu mas cząsteczkowych , numerów CAS , dostawców itp. Wyszukiwanie może służyć do poszerzania lub zawężania już znalezionych wyników.
- Wyszukiwanie struktury na urządzeniach mobilnych można wykonać za pomocą bezpłatnych aplikacji na system iOS (iPhone/iPod/iPad) oraz Android (system operacyjny) .
Oznaczenie dokumentu chemii
Baza danych ChemSpider została wykorzystana w połączeniu z eksploracją tekstu jako podstawa oznaczania dokumentów chemicznych . ChemMantis, Chemistry Markup And Nomenclature Transformation Integrated System wykorzystuje algorytmy do identyfikowania i wydobywania nazw chemicznych z dokumentów i stron internetowych oraz konwertuje nazwy chemiczne na struktury chemiczne za pomocą algorytmów konwersji nazw na struktury i przeszukiwania słowników w bazie danych ChemSpider . Rezultatem jest zintegrowany system między dokumentami chemicznymi a wyszukiwaniem informacji za pośrednictwem ChemSpider w ponad 150 źródłach danych.
Historia
ChemSpider został przejęty przez Royal Society of Chemistry (RSC) w maju 2009 r. Przed przejęciem przez RSC ChemSpider był kontrolowany przez prywatną korporację ChemZoo Inc. System został uruchomiony po raz pierwszy w marcu 2007 r. w wersji beta i przeszedł do wydania w marcu 2008 r.
Usługi
Szereg usług jest udostępnianych online. Obejmują one konwersję nazw chemicznych na struktury chemiczne , generowanie łańcuchów SMILES i InChI , a także przewidywanie wielu parametrów fizykochemicznych oraz integrację z usługą internetową umożliwiającą przewidywanie NMR .
Strony syntetyczne
SyntheticPages to bezpłatna interaktywna baza danych procedur chemii syntetycznej obsługiwana przez Królewskie Towarzystwo Chemii . Użytkownicy zgłaszają do publikacji w serwisie syntetyczne procedury, które sami przeprowadzili. Procedury te mogą być oryginalnymi pracami, ale częściej opierają się na reakcjach literatury. W stosownych przypadkach podano odniesienia do pierwotnie opublikowanej procedury. Przed opublikowaniem są sprawdzane przez redaktora naukowego. Strony nie podlegają formalnej recenzji, jak artykuł w czasopiśmie naukowym , ale komentarze mogą być zamieszczane przez zalogowanych użytkowników. Komentarze są również moderowane przez redaktorów naukowych. Celem jest zebranie praktycznego doświadczenia w prowadzeniu użytecznej syntezy chemicznej w laboratorium. Podczas gdy metody eksperymentalne opublikowane w zwykłym czasopiśmie akademickim są wymienione formalnie i zwięźle, procedury w ChemSpider SyntheticPages są podane z bardziej praktycznymi szczegółami. Zachęca się do nieformalności. Uwzględniono również komentarze zgłaszających. Inne publikacje o porównywalnej ilości szczegółów obejmują Organic Syntheses i Inorganic Syntheses . Witryna SyntheticPages została pierwotnie założona przez profesorów Kevina Bookera-Milburna ( Uniwersytet w Bristolu ), Stephena Caddicka ( Uniwersytet College w Londynie ), Petera Scotta ( Uniwersytet w Warwick ) i dr Maxa Hammonda. W lutym 2010 roku ogłoszono fuzję z wyszukiwarką struktur chemicznych ChemSpider Królewskiego Towarzystwa Chemii i utworzenie ChemSpider | SyntheticPages (CS | SP).
Otwórz PHACTS
ChemSpider służył jako repozytorium związków chemicznych w ramach projektu Open PHACTS , inicjatywy w zakresie leków innowacyjnych . Otwarte PHACTS opracowane zgodnie z otwartymi standardami, z otwartym dostępem, do sieci semantycznej w celu rozwiązania wąskich gardeł w odkrywaniu leków małocząsteczkowych - odmiennych źródeł informacji, braku standardów i nadmiaru informacji.