Parhyale hawaiensis
|
|
|
|
| Parhyale hawaiensis | |
|---|---|
| Dorosły samiec | |
| Żywi się plasterkiem marchwi | |
| Klasyfikacja naukowa | |
| Królestwo: | |
| Gromada: | |
| podtyp: | |
| Klasa: | |
| Zamówienie: | |
| Rodzina: | |
| Rodzaj: | |
| Gatunek: |
P. hawaiensis
|
| Nazwa dwumianowa | |
|
Parhyale hawaiensis
Dana , 1853
|
|
Parhyale hawaiensis to gatunek skorupiaka obunogowego , który jest wykorzystywany w analizach rozwojowych i genetycznych . Jest klasyfikowany jako wyłaniający się organizm modelowy, ponieważ ustalono główne techniki biologiczne niezbędne do badania organizmu.
Siedlisko
P. hawaiensis jest detrytożercą , który występuje w wodach okołotropikalnych , ogólnoświatowych, międzypływowych i płytkich wodach morskich i może występować jako kompleks gatunkowy . Donoszono, że występuje w dużych populacjach (ponad 3000 na metr kwadratowy) na rozkładającym się namorzynowych w środowiskach narażonych na gwałtowne zmiany zasolenia . Zdolność do tolerowania szybkich zmian temperatury i osmotycznych pozwala temu gatunkowi rozwijać się w typowych warunkach laboratoryjnych. Jest to wytrzymały gatunek i jest rozważany w akwakulturze.
Koło życia
Samice produkują zarodki co 2 tygodnie po osiągnięciu dojrzałości płciowej . Embriogeneza jest stosunkowo krótka i trwa około 10 dni w temperaturze 26 ° C (79 ° F). Samice zwykle wysiadują zarodki w brzusznej torbie lęgowej . Dokładne badanie rozwoju embrionalnego P. hawaiensis stworzyło najbardziej szczegółowy system stopniowania dla wszystkich skorupiaków. Pełna embriogeneza została podzielona na 30 oddzielnych etapów, które można łatwo zidentyfikować u żywych zwierząt lub za pomocą wspólnych markerów molekularnych w stałych egzemplarzach. Pisklęta posiadają kompletny zestaw segmentów i przydatków, które są morfologicznie podobne do tych u dorosłych zwierząt.
Badania genetyczne
P. hawaiensis jest wykorzystywana w badaniach genetycznych, ponieważ jajami i zarodkami można łatwo manipulować. Zarodki można szybko i łatwo wyjąć z worka z czerwiem i przechowywać w wodzie morskiej. Jaja można zbierać i wylęgać się pojedynczo, a dojrzałe zwierzęta można następnie wykorzystywać w kojarzeniach parami siostra-brat lub matka-syn w celu wytworzenia wsobnych .
stosunkowo łatwo wykonać mikroiniekcję i izolację blastomerów . Rozwijające się zarodki P. hawaiensis są klarowne, co pozwala zarówno na szczegółowe analizy mikroskopowe in situ , jak i na wykorzystanie fluorescencyjnie znakowanych cząsteczek znacznikowych w żywych zarodkach. Wczesne rozszczepienie jest holoblastyczne (całkowite), co pozwala na zbadanie losów poszczególnych wczesnych komórek poprzez manipulację eksperymentalną.
Transkryptom P. hawaiensis został początkowo wygenerowany przy użyciu techniki pirosekwencjonowania . Ten zasób jest swobodnie dostępny do pobrania . Kolejne, pełniejsze transkryptomy zostały wygenerowane przy użyciu sekwencjonowania Illumina. transkryptomu można wykorzystać do tworzenia sond in situ i innych narzędzi eksperymentalnych. Genom jest dostępny z NCBI
Genom P. hawaiensis jest dostępny i został zsekwencjonowany przy użyciu sekwencjonowania krótkiego odczytu Illumina . Ta pierwsza wersja ( V3.0 ) genomu została ostatnio zastąpiona bardziej ciągłą wersją wygenerowaną przez sekwencjonowanie Chicago za pośrednictwem platformy Dovetail. Nowa wersja Phaw_5.0 jest dostępna na NCBI.
Dalsza lektura
- E. Jaya Rehma; Roberta L. Hannibal; R. Crystal Chaw; Mario A. Vargas-Vila; Nipam H. Patel (2009). „Skorupiak Parhyale hawaiensis : nowy model rozwoju stawonogów”. Protokoły z Cold Spring Harbor . 2009 (1): pdb.emo114. doi : 10.1101/pdb.emo114 . PMID 20147009 .