Amidaza peptydo-N4-(N-acetylo-beta-glukozaminylo)asparaginy
| amidaza peptydo-N4-(N-acetylo-beta-glukozaminylo)asparaginy | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 Renderowanie na podstawie <a i=2>identyfikatorów
| |||||||||
| Identifiers | |||||||||
| nr WE | 3.5.1.52 | ||||||||
| nr CAS | 83534-39-8 | ||||||||
| Bazy danych | |||||||||
| IntEnz | Widok IntEnz | ||||||||
| BRENDA | Wpis BRENDY | ||||||||
| ExPASy | Widok NiceZyme | ||||||||
| KEGG | Wpis KEGG | ||||||||
| MetaCyc | szlak metaboliczny | ||||||||
| PRYM | profil | ||||||||
| Struktury PDB | RCSB PDB PDBe PDB suma | ||||||||
| Ontologia genów | AmiGO / QuickGO | ||||||||
| |||||||||
W enzymologii amidaza peptydo -N4-(N-acetylo-beta-glukozaminylo)asparaginy ( EC 3.5.1.52 ) jest enzymem , który katalizuje reakcję chemiczną , która rozszczepia resztę N 4- (acetylo-beta-D- glukozaminylo ) asparaginy w którym reszta glukozaminy może być dalej glikozylowana , z wytworzeniem (podstawionej) N-acetylo-beta-D-glukozaminyloaminy i peptydu zawierającego resztę asparaginianu . Enzym ten należy do rodziny hydrolazy , szczególnie te działające na wiązania węgiel-azot inne niż wiązania peptydowe w amidach liniowych.
Gen NGLY1 koduje ortolog tego enzymu u ludzi.
Nomenklatura
Systematyczna nazwa tej klasy enzymów to amidohydrolaza N-glikopeptydu-(N-acetylo-beta-D-glukozaminylo)-L-asparaginy . Inne powszechnie używane nazwy to:
- glikopeptyd N-glikozydaza,
- glikopeptydaza,
- glikopeptydaza N-oligosacharydowa,
- N-glikanaza,
- glikopeptydaza z fasoli szparagowej,
- PNGaza A i
- PNGaza F
Studia strukturalne
Enzym wykorzystuje katalityczną triadę cysteiny-histydyny-asparaginianu w swoim miejscu aktywnym do hydrolizy na drodze katalizy kowalencyjnej . Peptyd o podobnej funkcjonalności został odkryty w 2014 roku przez grupę z Uniwersytetu Fudan w Szanghaju w Chinach. Peptyd ten rozszczepia również wiązania alfa 1,3 i został nazwany PNGazą F-II.
Dalsza lektura
- Plummer TH, Tarentino AL (październik 1981). „Łatwe rozszczepianie złożonych oligosacharydów z glikopeptydów przez peptyd emulsyny migdałowej: N-glikozydaza” . Journal of Biological Chemistry . 256 (20): 10243–6. doi : 10.1016/S0021-9258(19)68610-2 . PMID 7287707 .
- Takahashi N (czerwiec 1977). „Wykazanie nowej amidazy działającej na glikopeptydy”. Komunikaty dotyczące badań biochemicznych i biofizycznych . 76 (4): 1194–201. doi : 10.1016/0006-291X(77)90982-2 . PMID 901470 .
- Takahashi N, Nishibe H (grudzień 1978). „Niektóre cechy nowej glikopeptydazy działającej na wiązania aspartyloglikozyloaminowe”. Dziennik Biochemii . 84 (6): 1467–73. doi : 10.1093/oxfordjournals.jbchem.a132270 . PMID 738997 .
- Tarentino AL, Gómez CM, Plummer TH (sierpień 1985). „Deglikozylacja glikanów połączonych z asparaginą przez peptyd: N-glikozydazę F”. Biochemia . 24 (17): 4665–71. doi : 10.1021/bi00338a028 . PMID 4063349 .
