RNA SRG1
| SRG1 | |
|---|---|
 Konserwatywna struktura drugorzędowa
| |
| identyfikatorów RNA SRG1 | |
| Symbol | SRG1 |
| Rfam | RF01765 |
| Inne dane | |
| typ RNA | gen ; Cis-reg ; |
| Domeny | Saccharomyces |
| Struktury PDB | PDBe |
SRG1 RNA ( gen regulatorowy SER3 1) jest niekodującym RNA , który hamuje ekspresję SER3 (YER081W). SER3 to gen kodujący dehydrogenazę fosfoglicerynianową biorącą udział w biosyntezie seryny . SRG1 tłumi SER3 poprzez interferencję transkrypcyjną i pod tym względem jest pierwszym transkryptem międzygenowym tego rodzaju.
SRG1 został zidentyfikowany, gdy testy immunoprecypitacji chromatyny (ChIP) wykazały, że w Saccharomyces cerevisiae , nawet gdy SER3 był represjonowany, białko wiążące TATA i polimeraza RNA II były nadal związane z DNA SER3 w taki sposób, który powinien był spowodować aktywną transkrypcję . Dalsza analiza wykazała drugą kasetę TATA 558 pz powyżej SER3 . Skan bioinformatyczny zidentyfikował ten sam element skrzynki TATA jako powiązany Saccharomyces . Stwierdzono, że SRG1 działa cis , nie miał efektu represyjnego, gdy był w trans .
RNA SRG1 nie jest spokrewniony z genem związanym ze starzeniem się 1 (SRG1), genem kodującym białko znalezionym w Arabidopsis thaliana , a także różni się od genu odpowiedzi na stres 1 (SRG1) znalezionego w Medicago sativa .
Dalsza lektura
- Cullen BR, Lomedico PT, Ju G (1984). „Interferencja transkrypcyjna w ptasich retrowirusach - implikacje dla modelu leukaemogenezy z wstawieniem promotora”. Natura . 307 (5948): 241–245. Bibcode : 1984Natur.307..241C . doi : 10.1038/307241a0 . PMID 6363938 . S2CID 4277058 .
- Cawley S, Bekiranov S, Ng HH, Kapranov P, Sekinger EA, Kampa D, Piccolboni A, Sementchenko V, Cheng J, Williams AJ, Wheeler R, Wong B, Drenkow J, Yamanaka M, Patel S, Brubaker S, Tammana H , Helt G, Struhl K, Gingeras TR (luty 2004). „Bezstronne mapowanie miejsc wiążących czynniki transkrypcyjne wzdłuż ludzkich chromosomów 21 i 22 wskazuje na powszechną regulację niekodujących RNA” . komórka . 116 (4): 499–509. doi : 10.1016/S0092-8674(04)00127-8 . PMID 14980218 .
- Valerius O, Brendel C, Düvel K, Braus GH (czerwiec 2002). „Wiele czynników zapobiega interferencji transkrypcji w locus ARO4-HIS7 drożdży” . Journal of Biological Chemistry . 277 (24): 21440–21445. doi : 10.1074/jbc.M201841200 . PMID 11937506 .
- Adhya S, Gottesman M (lipiec 1982). „Okluzja promotora: transkrypcja przez promotor może hamować jego aktywność”. komórka . 29 (3): 939–944. doi : 10.1016/0092-8674(82)90456-1 . PMID 6217898 . S2CID 24587523 .
- Hurowitz EH, Brown PO (2003). „Analiza całego genomu długości mRNA w Saccharomyces cerevisiae” . Biologia genomu . 5 (1): R2. doi : 10.1186/gb-2003-5-1-r2 . PMC 395734 . PMID 14709174 .