Represor LexA
Identyfikatory mutantów | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
domeny wiążącej DNA LexA | |||||||||
Symbol | LexA_DNA_bind | ||||||||
Pfam | PF01726 | ||||||||
Klan Pfamów | CL0123 | ||||||||
InterPro | IPR006199 | ||||||||
SCOP2 | 1leb / ZAKRES / SUPFAM | ||||||||
|
Represor LexA lub LexA to represor transkrypcji ( EC 3.4.21.88 ), który tłumi geny odpowiedzi SOS kodujące głównie podatne na błędy polimerazy DNA , enzymy naprawy DNA i inhibitory podziału komórkowego . LexA wraz z RecA tworzy de facto dwuelementowy system regulacyjny , który wykrywa uszkodzenie DNA w zablokowanych widełkach replikacyjnych, tworząc monofilamenty i uzyskując aktywną konformację zdolną do wiązania się z LexA i powodując rozszczepienie LexA w procesie zwanym autoproteolizą .
Uszkodzenia DNA mogą być spowodowane działaniem antybiotyków , bakteriofagów i światła UV . Potencjalnie interesujące klinicznie jest indukowanie odpowiedzi SOS przez antybiotyki, takie jak cyprofloksacyna . Bakterie wymagają topoizomerazy , takiej jak gyraza DNA lub topoizomeraza IV do replikacji DNA . Antybiotyki, takie jak cyprofloksacyna, mogą zapobiegać działaniu tych cząsteczek, przyłączając się do kompleksu wirującego-DNA, co prowadzi do zatrzymania widełek replikacyjnych i indukcji odpowiedzi SOS. Ekspresja polimeraz podatnych na błędy w odpowiedzi SOS zwiększa podstawowy współczynnik mutacji bakterii. Chociaż mutacje są często śmiertelne dla komórki, mogą również zwiększać przeżycie. W konkretnym przypadku topoizomerazy niektóre bakterie zmutowały jeden ze swoich aminokwasów, w związku z czym cyprofloksacyna może tworzyć jedynie słabe wiązanie z topoizomerazą. Jest to jedna ze metod stosowanych przez bakterie, aby uzyskać oporność na antybiotyki. Leczenie cyprofloksacyną może zatem potencjalnie prowadzić do wytworzenia mutacji, które mogą spowodować, że bakterie będą oporne na cyprofloksacynę. Ponadto wykazano również, że cyprofloksacyna indukuje poprzez odpowiedź SOS rozprzestrzenianie się czynników zjadliwości i determinantów oporności na antybiotyki , a także aktywację integraz integronowych , potencjalnie zwiększając prawdopodobieństwo nabycia i rozpowszechnienia oporności na antybiotyki przez bakterie.
Wykazano, że upośledzona proteoliza LexA zakłóca oporność na cyprofloksacynę. Daje to potencjał dla terapii skojarzonej , która łączy chinolony ze strategiami mającymi na celu zakłócanie działania LexA, bezpośrednio lub poprzez RecA.
domenę wiążącą DNA . Skrzydlaty motyw HTH LexA jest odmianą motywu wiążącego DNA helisa-zwrot-helisa i zwykle znajduje się na N-końcu białka.