Rhodobacteraceae

Rhodobacteraceae
Klasyfikacja naukowa
Domena:	Bakteria
Gromada:	pseudomonadota
Klasa:	alfaproteobakterie
Zamówienie:	rodobakterie
Rodzina:	Rhodobacteraceae Garrity i in . 2006
Rodzaje
Zobacz tekst.
Synonimy
grupa Rhodobacter grupa Roseobacter proteobakterie alfa-3

Rhodobacteraceae to rodzina Pseudomonadota z rzędu Rhodobacterales w podgrupie alfa. Podobnie jak wszystkie Pseudomonadota, są Gram-ujemne . Zawiera bakterie chemoorganotroficzne i fotoheterotroficzne . Wiele występuje w siedliskach wodnych.

Rodzaje

Zaakceptowane Genery

Następujące rodzaje zostały skutecznie i prawidłowo opublikowane:

• Acidimangrovimonas Ren i in . 2019
• Actibacterium Lucena i in . 2012
• Aestuariibius Park i in . 2018
• Aestuariicoccus Feng i in . 2018
• Aestuariihabitans Yoon i in . 2014
• Aestuariivita Park i in . 2014
• Aestuarium Yu i in . 2019
• Agaricicola Chu i in . 2010
• Albibacillus Hordt i in . 2020
• Albidovulum Albuquerque i in . 2003
• Albimonas Lim i in . 2008
• Albirhodobacter Nupur i in . 2015
• Aliiroseovarius Park i in . 2015
• Aliishimia Kim i in . 2019
• Alkalilacustris Zhang i in . 2019
• Allgaiera Hördt i in . 2020
• Allosediminivita Hördt et al . 2020
• Amaricoccus Maszenan i in . 1997
• Amylibacter Teramoto i Nishijima 2014
• Antarcticimicrobium Zhang et al . 2020
• Antarctobacter Labrenz i in . 1998
• Aquicoccus Feng i in . 2018
• Aquimixticola Park i in . 2015
• Arenibacillus Kim i in . 2019
• Arenibacterium Baek i in . 2020
• Ascidiaceihabitans Kim et al . 2014
• Boseongicola Park i in . 2014
• Brevirhabdus Wu i in . 2015
• Carideicomes Wang i in . 2020
• Celeribacter Ivanova i in . 2010
• Cereibacter Suresh i in . 2015
• Chachezhania Yuan i in . 2020
• Citreimonas Choi i Cho 2006
• Cognatishimia Wirth i Whitman 2018
• Cognatiyoonia Wirth i Whitman 2018
• Cribrihabitans Chen i in . 2014
• Cypionkella Hordt i in . 2020
• Defluviimonas Foesel i in . 2013
• Dinoroseobacter Biebl i in . 2005
• Donghicola Yoon i in . 2007
• Epibacterium Penesyan i in . 2013
• Falsirhodobacter Subhash i in . 2013
• Fertoeibacter Szuroczki i in . 2021
• Flavimaricola Wirth i Whitman 2018
• Fluviibacterium Sun i in . 2020
• Frigidibacter Li i Zhou 2015
• Gemmobacter Rothe i in . 1988
• Haematobacter Helsel i in . 2007
• Hahyoungchilella Kim i Lee 2020
• Halocynthiibacter Kim i in . 2014
• Halodurantibacterium Lv et al . 2015
• Halovulum Sun i in . 2015
• Hasllibacter Kim i in . 2012
• Histidinibacterium Wang i in . 2019
• Hwanghaeicola Kim i in . 2010
• Jannaschia Wagner-Döbler i in . 2003
• Jhaorihella Rekha i in . 2011
• Kandeliimicrobium Wang i in . 2018
• Kangsaoukella Lee i in . 2020
• Lacimonas Zhong i in . 2015
• Leisingera Schaefer i in . 2002
• Lentibacter Li i in . 2012
• Limibaculum Shin i in . 2017
• Limimaricola Wirth i Whitman 2018
• Litoreibacter Romanenko i in . 2011
• Litorizediminicola Yoon i in . 2013
• Litorisediminivivens Park i in . 2016
• Litorivita Hetharua i in . 2018
• Loktanella Van Trappen i in . 2004
• Lutimaribacter Yoon i in . 2009
• Maliponia Jung i in . 2016
• Mameliella Zheng i in . 2010
• Mangrovicoccus Yu i in . 2018
• Maribius Choi i in . 2007
• Marimonas Thongphrom i in . 2017
• Marinibacterium Li i in . 2015
• Marinovum Martens i in . 2006
• Maritimibacter Lee i in . 2007
• Marivita Hwang i in . 2009
• Marivivens Park i in . 2016
• Meinhardsimonia Hördt i in . 2020
• Meridianimarinicoccus Ren i in . 2019
• Methylarcula Doronina i in . 2000
• Monaibacterium Czernikowa i in . 2017
• Neptunicoccus Zhang i in . 2018
• Nereida Pujalte i in . 2005
• Nioella Rajasabapathy i in . 2015
• Oceanibium Chang i in . 2019
• Oceanicella Albuquerque i in . 2012
• Oceanicola Cho i Giovannoni 2004
• Oceaniglobus Li i in . 2017
• Octadecabacter Gosink i in . 1998
• Pacificibacter Romanenko i in . 2011
• Pacificitalea Hördt i in . 2020
• Paenimaribius Park i in . 2019
• Paenirhodobacter Wang i in . 2014
• Palleronia Martínez-Checa i in . 2005
• Paracoccus Davis 1969 (listy zatwierdzone 1980)
• Paradonghicola Lee i in . 2019
• Paraphaeobacter Cai i in . 2017
• Pararhodobacter Foesel i in . 2013
• Parasedimentitalea Ding i in . 2020
• Paroceanicella corrig. Liu i in . 2020
• Pelagicola Kim i in . 2008
• Pelagimonas Hahnke i in . 2013
• Pelagivirga Ji i in . 2018
• Pelagovum Ren i in . 2020
• Phaeobacter Martens i in . 2006
• Phycocomes Zhu i in . 2019
• Planktomarina Giebel i in . 2013
• Planktotalea Hahnke i in . 2012
• Pontibaca Kim i in . 2010
• Ponticoccus Hwang i Cho 2008
• Pontivivens Park i in . 2015
• Poseidonocella Romanenko i in . 2012
• Primorskyibacter Romanenko i in . 2011
• Profundibacter Le Moine Bauer i in . 2019
• Profundibacterium Lai i in . 2013
• Pseudaestuariivita Wirth i Whitman 2018
• Pseudodonghicola Hameed i in . 2014
• Pseudogemmobacter Suman i in . 2019
• Pseudohalocynthiibacter Won i in . 2015
• Pseudomaribius Park i in . 2018
• Pseudooceanicola Lai i in . 2015
• Pseudooctadecabacter Billerbeck i in . 2015
• Pseudophaeobacter Breider i in . 2014
• Pseudoprimorskyibacter Hördt i in . 2020
• Pseudopuniceibacterium Zhang i in . 2019
• Pseudorhodobacter Uchino i in . 2003
• Pseudoroseicyclus Park i in . 2016
• Pseudoruegeria Yoon i in . 2007
• Pseudoseohaeicola Park i in . 2015
• Pseudotioklawa Kim i Lee 2020
• Psychromararinibacter Qiao i in . 2017
• Pukyongiella Kim i in . 2020
• Puniceibacterium Liu i in . 2014
• Qingshengfaniella Wang i in . 2021
• Rhodobaca Milford i in . 2001
• Rhodobacter Imhoff i in . 1984
• Rhodobaculum Bryantseva i in . 2015
• Rhodophyticola Jung i in . 2019
• Rhodosalinus Guo i in . 2017
• Rhodovulum Hiraishi i Ueda 1994
• Roseibaca Labrenz i in . 2009
• Roseibacterium Suzuki i in . 2006
• Roseicitreum Yu i in . 2011
• Roseicyclus Rathgeber i in . 2005
• Roseinatronobacter Sorokin i in . 2000
• Roseisalinus Labrenz i in . 2005
• Roseivivax Suzuki i in . 1999
• Roseobacter Shiba 1991
• Roseovarius Labrenz i in . 1999
• Rubellimicrobium Denner et al . 2006
• Rubribacterium Boldareva i in . 2010
• Rubricella Yang i in . 2017
• Rubrimonas Suzuki i in . 1999
• Ruegeria Uchino i in . 1999
• Sagittula Gonzalez i in . 1997
• Salinihabitans Yoon i in . 2009
• Salinovum Qu i in . 2017
• Salipiger Martínez-Cánovas i in . 2004
• Sedimentitalea Breider i in . 2014
• Sediminimonas Wang i in . 2009
• Seohaeicola Yoon i in . 2009
• Shimia Choi i Cho 2006
• Silicimonas Crenn i in . 2016
• Sinirhodobacter corrig. Yanga i in . 2018
• Solirhodobacter Chu i in . 2020
• Sulfitobacter Sorokin 1996
• Tabrizicola Tarhriz i in . 2014
• Tateyamaria Kurahashi i Yokota 2008
• Thalassobius Arahal i in . 2005
• Thalassococcus Lee i in . 2007
• Thioclava Sorokin i in . 2005
• Tranquillimonas Harwati i in . 2008
• Tritonibacter Klotz i in . 2018
• Tropicibacter Harwati i in . 2009
• Tropicimonas Harwati i in . 2009
• Vannielia Hördt i in . 2020
• Wenxinia Ying i in . 2007
• Xinfangfangia Hu i in . 2018
• Yoonia Wirth i Whitman 2018
• Youngimonas Hameed i in . 2014

Tymczasowe rodzaje

Następujące rodzaje zostały opublikowane, ale nie zostały zatwierdzone zgodnie z Kodeksem bakteriologicznym :

• „ Aliisedimentitalea ” Kim i in . 2015
• „ Alterinioella ” Kong i in . 2021
• „ Falsigemmobacter ” Li i in . 2020
• „ Jindonia ” Park i in . 2017
• „ Ketogulonicigenium ” poprawione. Urbance i in . 2001
• " Nitropelagi " Jeong i Lee 2016
• „ Oceaniovalibus ” Liu i in . 2012
• „ Oceanomikrobium ” Dai i in . 2021
• „ Piezobacter ” Takai i in . 2009
• Park i in . 2021 " Pikeienuella "
• „ Plastorhodobacter ” Xie i in . 2015
• „ Polymorphum ” Cai i in . 2011
• „ Pseudopontivivens ” Park i in . 2018
• „ Roseibacula ” Nuyanzina-Boldareva i Gorlenko 2014
• „ Zongyanglinia ” Xu i in . 2021

Rodzaje Candidatus

Opublikowano następujące rodzaje candidatus :

• „ Candidatus Halichondriibacter” poprawione. Knobloch i in . 2019
• „ Candidatus Kopriimonas ” Quinn i in . 2012

Filogeneza

Obecnie przyjęta taksonomia oparta jest na Liście nazw prokariotycznych z obowiązującą nomenklaturą, a filogeneza oparta jest na sekwencjach całego genomu.

Rhodobacteraceae Rubrimonas Albimonas Oceanicella Pontivivens Monaibacterium Amylibacter Neptunicoccus Hasllibacter Jannaschia Dinoroseobacter Jannaschia Planktomarina Nereida Litoreibacter Brevirhabdus Kandeliimicrobium Oceaniglobus Tranquillimonas Palleronia Hwanghaeicola Maribius Meinhardsimonia Silicimonas Boseongicola Pararhodobacter Roseicit reum Roseinatronobacter Rhodobaca Defluviimonas Albidovulum Wagnerdoeblera Cereibacter Pseudorhodobacter Gemmobacter Cypionkella Tabrizicola Frigidibacter Bieblia Thioclava Paenirhodobacter Rhodobacter Haematobacter Paracoccus Rhodovulum Actibacterium Pacificitalea Vannielia Tropicimonas Pseudoruegeria Halocynthiibacter Maritimibacter Aliiroseovarius Donghicola Mangrovicoccus Aquimix ticola Celeribacter Pacificibacter Marivivens Rubellimicrobium Wenxinia Pseudoroseicyclus Limimaricola Roseisalinus Oceanicola Flavimaricola Loktanella Cognatiyoonia Yoonia Pseudooctadecabacter Octadecabacter Pseudooceanicola Rhodosalinus Marinovum Poseidonocella Primorskyibacter Pseudoprimorskyibacter Marivita Puniceibacterium Thalassococcus Roseivivax Allosedimini vita Citreimonas Salipiger Pelagimonas Tropicibacter Ponticoccus Sagittula Maliponia Antarctobacter Mameliella Roseovarius Salinihabitans Pseudopelagicola Pelagicola Shimia Cognatishimia Lentibacter Sediminimonas Lutimaribacter Thalassobius Pseudaestuariivita Planktotalea Roseobacter Sulfitobacter Ascidiaceihabitans Aestuariivita Marinibacterium Pseudodonghicola Albibacillus Pontibaca Se dimentitalea Phaeobacter Pseudophaeobacter Leisingera Epibacterium Tritonibacter Jhaorihella Cribrihabitans Ruegeria grupa zewnętrzna Neomegalonemataceae

Zobacz też

• biowodór

Dalsza lektura

•   Garrity GM, Holt JG (2001). „Zarys taksonomiczny archeonów i bakterii” . W DR Boone, RW Castenholz (red.). Bergey's Manual of Systematic Bacteriology, tom 1: Archaea i głęboko rozgałęzione i fototroficzne bakterie (wyd. 2). Nowy Jork: Springer Verlag. s. 155–166 . ISBN 978-0-387-98771-2 .