Ruegeria

Klasyfikacja naukowa
Ruegerii
Domena:	Bakteria
Gromada:	pseudomonadota
Klasa:	alfaproteobakterie
Zamówienie:	rodobakterie
Rodzina:	Rhodobacteraceae
Rodzaj:	Ruegeria Uchino i in . 1999
Gatunki typu
Ruegeria atlantica (Rüger i Höfle 1992) Uchino et al . 1999
Gatunki
Ruegeria arenilitoris Park i Yoon 2013 Ruegeria atlantica (Rüger i Höfle 1992) Uchino et al . 1999 Ruegeria conchae Lee i in . 2012 Ruegeria denitrificans Arahal et al . 2018 Ruegeria faecimaris Oh i in . 2011 „ Ruegeria haliotis ” Cao i in . 2021 Ruegeria halocynthiae Kim i in . 2012 Ruegeria intermedia Kämpfer et al . 2013 Ruegeria lacuscaerulensis (Petursdottir i Kristjansson 1999) Yi i in . 2007 Ruegeria litorea (Lucena i in . 2014) Wirth i Whitman 2018 Ruegeria marina Huo et al . 2011 Ruegeria marisrubri Zhang et al . 2017 Ruegeria mediterranea (Lucena i in . 2014) Wirth i Whitman 2018 Ruegeria meonggei Kim i in . 2014 Ruegeria meteori (Rüger i Höfle 1992) Hördt et al . 2020 Ruegeria pomeroyi (González i in . 2003) Yi i in . 2007 Ruegeria profundi Zhang et al . 2017 Ruegeria sediminis Baek et al . 2020
Synonimy
Silicibacter Petursdottir i Kristjansson 1999

W taksonomii Ruegeria jest rodzajem Rhodobacteraceae . _ _ Ten rodzaj był wcześniej znany jako morski Agrobacterium , zanim został ponownie sklasyfikowany w 1998 roku. W rzeczywistości nosi imię Hansa-Jürgena Rügera, niemieckiego mikrobiologa, za jego wkład w taksonomię morskich gatunków Agrobacterium .

Charakterystyka

Rodzaj charakteryzuje się członkami, którzy są:

• Gram-ujemne (jak wszystkie proteobakterie)
• komórki jajowate do pręcikowatych 0,6–1,6 × 1,0–4,0 µm
• ruchliwe przez wici polarne lub nieruchliwe
• niebędące zarodnikami
• aerobik
• dodatnie pod względem oksydazy i katalazy
• nie są zdolne do fotosyntezy
• brak bakteriochlorofilu a
• głównym chinonem jest ubichinon 10
• % molowy G+C DNA wynosi 55–59
• członek rodziny Rhodobacteraceae , która jest fenotypowo, metabolicznie, ekologicznie zróżnicowana i zdefiniowana na podstawie danych dotyczących sekwencji 16S

Filogenetycznie jest bardzo zbliżony do rodzaju Silicibacter , ale te dwa pozostają odrębnymi gatunkami ze względu na różnice fenotypowe - dwa gatunki, dla których jest to problematyczne, to Ruegeria lacuscaerulensis i Ruegeria pomeroyi .

Dwa gatunki, które zostały usunięte z rodzaju to Marinovum algicola (Ruegeria algicola) i Thalassobius gelatinovorus (Ruegeria gelatinovora). ^{[i odnośniki w nim]}

Małe niekodujące RNA

, że bardzo liczne bakteryjne małe RNA są obecne w bakteriach poddanych chronicznemu ograniczeniu składników odżywczych. W Ruegeria pomeroyi analiza RNAseq zidentyfikowała 99 przypuszczalnych sRNA. Mechanizmy regulacyjne bakteryjnych sRNA są zwykle oparte na bezpośredniej interakcji RNA-RNA z docelowym mRNA. Docelowe grupy genów zidentyfikowane przez Riversa i in. były geny zaangażowane w transport, geny pośredniczące w interakcjach komórka-komórka, transdukcji sygnału i regulacji transkrypcji.

Dalsza lektura

Czasopisma naukowe

• Martens T, Heidorn T, Pukall R, Simon M, Tindall BJ, Brinkhoff T (2006). „Reklasyfikacja Roseobacter gallaeciensis Ruiz-Ponte et al. 1998 jako Phaeobacter gallaeciensis gen. nov., comb. nov., opis Phaeobacter inhibens sp. nov., wytwarzających antybiotyki członków kladu Roseobacter, reklasyfikacja Ruegeria algicola (Lafay i in. wsp. 1995) Uchino i wsp. 1998 jako Marinovum algicola gen. nov., grzebień nov. i zmienione opisy rodzajów Roseobacter, Ruegeria i Leisingera” . Int. J. Syst. ewolucja Mikrobiol . 56 (Pt 6): 1293-1304. doi :   10.1099/ijs.0.63724-0 . PMID 16738106 .

Książki naukowe

•   Garrity GM, Holt JG (2001). „Zarys taksonomiczny archeonów i bakterii” . W DR Boone, RW Castenholz (red.). Bergey's Manual of Systematic Bacteriology, tom 1: Archaea i głęboko rozgałęziające się i fototroficzne bakterie (wyd. 2). Nowy Jork: Springer Verlag. s. 155–166 . ISBN 978-0-387-98771-2 .