Robert Stevens (naukowiec)

Robert Stevens
DrRobertDavidStevens.jpg
Robert Stevens
Urodzić się
Roberta Davida Stevensa

( 11.02.1965 ) 11 lutego 1965 (wiek 58)
Narodowość brytyjski
Alma Mater
Znany z TAMBISZ
Kariera naukowa
Pola
Instytucje Uniwersytet w Manchesterze
Praca dyplomowa   Zasady projektowania interfejsów słuchowych do prezentowania złożonych informacji osobom niewidomym (1996)
Doradca doktorski Alistaira Edwardsa
Strona internetowa www.research.manchester.ac.uk/portal/robert.stevens.html _ _ _ _ _ _ _ _

Robert David Stevens (ur. 1965) jest profesorem informatyki biozdrowia . i były kierownik Wydziału Informatyki na Uniwersytecie w Manchesterze

Edukacja

Stevens uzyskał tytuł Bachelor of Science w dziedzinie biochemii na Uniwersytecie w Bristolu w 1986 r., tytuł magistra bioinformatyki w 1991 r. oraz tytuł doktora nauk komputerowych w 1996 r., oba na Uniwersytecie w Yorku .

Kariera i badania

Obecne zainteresowania badawcze Stevensa to budowa ontologii biologicznych , takich jak ontologia genów , oraz pogodzenie heterogeniczności semantycznej w bioinformatyce. Badania te zostały sfinansowane przez Radę ds. Badań nad Inżynierią i Naukami Fizycznymi (EPSRC) , Radę ds. Badań nad Biotechnologią i Naukami Biologicznymi (BBSRC) oraz Unię Europejską .

Stevens był głównym badaczem wielu projektów badawczych, w tym Ondex, ComparaGrid, SWAT (Semantic Web Authoring Tool) i Ontogeneza Network.

Stevens był przewodniczącym programu i współorganizatorem Międzynarodowej Konferencji Ontologii Biomedycznej (ICBO) 2012 oraz współzałożycielem UK Ontology Network. Uczestniczył również w Healthcare and Life Sciences Interest Group (HCLSIG) konsorcjum World Wide Web Consortium (W3C) . Stevens jest obecnie członkiem zespołu redakcyjnego Journal of Biomedical Semantics . Stevens zaczynał jako wykładowca , następnie został starszym wykładowcą, czytelnikiem , aw sierpniu 2013 r. został profesorem.

Stevens wykładał na kilku kursach licencjackich i podyplomowych z inżynierii oprogramowania, baz danych, bioinformatyki oraz prowadzi kursy wprowadzające i zaawansowane w zakresie języka ontologii internetowej . Był głównym promotorem pięciu odnoszących sukcesy doktorantów i współpromotorem kilku innych.

Od lipca 2016 pełni funkcję kierownika Katedry Informatyki na Uniwersytecie w Manchesterze.

  1. Bibliografia _ _ Stevens, R .; Ng, G.; Bechhofer S.; Paton, NW ; Piekarz, PG; Peim, M.; Mosiądz, A. (2001). „Przejrzysty dostęp do wielu źródeł informacji bioinformatycznych” (PDF) . Dziennik systemów IBM . 40 (2): 532–551. doi : 10.1147/sj.402.0532 .
  2. Bibliografia   _ _ Baker, P.; Bechhofer S.; Ng, G.; Jacoby, A.; Paton, NW ; Goble, Kalifornia ; Mosiądz, A. (2000). „TAMBIS: przejrzysty dostęp do wielu źródeł informacji bioinformatycznych” . Bioinformatyka . 16 (2): 184–185. doi : 10.1093/bioinformatyka/16.2.184 . PMID 10842744 .
  3. Bibliografia   _ Mosiądz, A.; Bechhofer S.; Goble, C.; Paton, N.; Stevens, R. (1998). „TAMBIS - przejrzysty dostęp do wielu źródeł informacji bioinformatycznych” . Obrady. Międzynarodowa Konferencja Inteligentnych Systemów Biologii Molekularnej . 6 : 25–34. PMID 9783206 .
  4. ^ Pole, D .; Garrity, G.; Szary, T .; Morrison, N.; Selengut, J.; Sterk, P.; Tatusowa, T.; Thomson, N.; Allen, MJ; Angiuoli, SV; Ashburner, M.; Axelrod, N.; Baldauf S.; Ballard, S.; Boore, J.; Cochrane, G.; Cole, J.; Dawyndt, P.; De Vos, P.; Depamphilis, C.; Edwards, R.; Faruque, N.; Feldman R.; Gilbert, J.; Gilna, P.; Glöckner, FO; Goldstein, P.; Guralnick, R.; Haft, D.; i in. (2008). „Minimalne informacje o specyfikacji sekwencji genomu (MIGS)” . Biotechnologia przyrody . 26 (5): 541–7. doi : 10.1038/nbt1360 . PKW    2409278 . PMID 18464787 .
  5. Bibliografia    _ _ Harper, S.; Stevens, R. (2000). „Cierpienia osób niedowidzących podróżujących po sieci” (PDF) . Obrady jedenastego ACM w sprawie hipertekstu i hipermediów - HYPERTEXT '00 . P. 1. doi : 10.1145/336296.336304 . ISBN 978-1581132274 . S2CID 7099946 .
  6. ^ Stevens, Robert (2007). „Dzień z życia niepełnosprawnego (?) naukowca: niewidomy w nauce” (PDF) . Biochemik . doi : 10.1042/BIO02903030 . Źródło 20 czerwca 2013 r .
  7. ^ a b Publikacje Roberta Stevensa indeksowane przez Google Scholar Edit this at Wikidata
  8. ^ a b     Stevens, Robert David (1996). Zasady projektowania interfejsów słuchowych do prezentacji złożonych informacji osobom niewidomym (PDF) (praca doktorska). Uniwersytet Yorku. OCLC 931328170 . EThOS uk.bl.ethos.319718 .
  9. ^ „Profesor Robert Stevens, profil badawczy - dane osobowe (Uniwersytet w Manchesterze)” . Zarchiwizowane od oryginału w dniu 28 grudnia 2011 r . . Źródło 10 czerwca 2012 r .
  10. Bibliografia    _ Eales, J.; Zürbig, P.; Vlahou, A.; Mischak, H.; Stevens, R. (2013). „Proteasix: narzędzie do zautomatyzowanego przewidywania na dużą skalę proteaz zaangażowanych w naturalnie występujące wytwarzanie peptydów” . Proteomika . 13 (7): 1077–1082. doi : 10.1002/pmic.201200493 . PMID 23348921 . S2CID 8604093 .
  11. ^ a b „Tygodniowy biuletyn dla Szkoły CS” . 11 lipca 2016 r. Zarchiwizowane od oryginału w dniu 3 października 2019 r.
  12. ^    Meng, YB; Stevens, RD ; Chiny, W.; McGill, S.; Ashburner, M. (1988). „Pięć genów tRNA glicylu w kompleksie genów noc Drosophila melanogaster” . Badania kwasów nukleinowych . 16 (14): 7189. doi : 10.1093/nar/16.14.7189 . PMC 338370 . PMID 3136440 .
  13. ^ Robert Stevens z DBLP Bibliography Server Edit this at Wikidata
  14. ^ Publikacje Roberta Stevensa indeksowane przez bibliograficzną bazę danych Scopus . (wymagana subskrypcja)
  15. ^ Strona profilu autora Roberta Stevensa w Bibliotece Cyfrowej ACM Edit this at Wikidata
  16. Bibliografia    _ Brązowy, A.; Lister, AL; Ison, J.; Kadłub, D.; Parkinson, H.; Stevens, R. (2014). „The Software Ontology (SWO): źródło odtwarzalności w analizie danych biomedycznych, kuracji i ochronie cyfrowej” . Journal of Biomedical Semantics . 5:25 . doi : 10.1186/2041-1480-5-25 . PMC 4098953 . PMID 25068035 .
  17. ^    Panie, P .; Stevens, R. (2010). Friedberg, Iddo (red.). „Dodanie odrobiny rzeczywistości do budowania ontologii dla biologii” . PLOS JEDEN . 5 (9): e12258. Bibcode : 2010PLoSO...512258L . doi : 10.1371/journal.pone.0012258 . PMC 2933225 . Identyfikator PMID 20838431 .
  18. Bibliografia    _ Stevens, R .; Hoehndorf, R. (2012). „Logiczne adnotacje ontologii genów (GOAL): badanie adnotacji ontologii genów za pomocą OWL” . Journal of Biomedical Semantics . 3 Suplement 1 (Suppl 1): S3. doi : 10.1186/2041-1480-3-S1-S3 . PMC 3337258 . PMID 22541594 .
  19. ^    Kalankesh, LR; Stevens, R .; Mosiądz, A. (2012). „Język ontologii genów: analiza prawa Zipfa” . BMC Bioinformatyka . 13 : 127. doi : 10.1186/1471-2105-13-127 . PMC 3473240 . PMID 22676436 .
  20. ^    Panie, PW; Stevens, RD ; Mosiądz, A.; Goble, Kalifornia (2003). „Miary podobieństwa semantycznego jako narzędzia do badania ontologii genów” (PDF) . Sympozjum Pacyfiku na temat biokomputerów : 601–612. doi : 10.1142/9789812776303_0056 . ISBN 978-981-238-217-7 . PMID 12603061 .
  21. Bibliografia    _ Stevens, R .; Goble, Kalifornia ; Ashburner, M. (2003). „Metodologia migracji ontologii genów do środowiska logiki opisu przy użyciu DAML + OIL”. Pacyficzne sympozjum na temat biokomputerów : 624–635. doi : 10.1142/9789812776303_0058 . ISBN 978-981-238-217-7 . PMID 12603063 .
  22. ^ „Heterogeniczność semantyczna w zasobach bioinformatycznych” . Cs.man.ac.uk . Źródło 10 stycznia 2019 r .
  23. ^   Panie, PW; Stevens, RD ; Mosiądz, A .; Goble, Kalifornia (2003). „Badanie miar podobieństwa semantycznego w ontologii genów: związek między sekwencją a adnotacją” . Bioinformatyka . 19 (10): 1275–1283. doi : 10.1093/bioinformatyka/btg153 . PMID 12835272 .
  24. Bibliografia    _ Magka D.; Batchelor, C.; Duan, L.; Stevens, R .; Ennis, M.; Steinbeck, C. (2012). „Klasyfikacja oparta na strukturze i ontologia w chemii” . Journal of Cheminformatics . 4 : 8. doi : 10.1186/1758-2946-4-8 . PMC 3361486 . PMID 22480202 .
  25. ^ a b c „Granty przyznane Robertowi Stevensowi przez EPRSC” . Źródło 21 czerwca 2012 r .
  26. ^ „Zarchiwizowana kopia” . Zarchiwizowane od oryginału w dniu 22 lutego 2015 r . Źródło 22 lutego 2015 r . {{ cite web }} : CS1 maint: zarchiwizowana kopia jako tytuł ( link )
  27. ^ „Szczegóły badacza / przełożonego - Robert Stevens @ BBSRC” . Źródło 21 czerwca 2012 r .
  28. Bibliografia    _ Nenadic, G.; Mosiądz, A .; Robertson, DL; Stevens, R. (2013). „BioNerDS: eksploracja bazy danych i oprogramowania bioinformatycznego poprzez eksplorację literatury” . BMC Bioinformatyka . 14 : 194. doi : 10.1186/1471-2105-14-194 . PMC 3693927 . PMID 23768135 .
  29. Bibliografia   _ Baumbach, J.; Taubert, J.; Specht, M.; Skusa, A.; Ruegg, A.; Rawlings, C.; Verrier, P.; Philippi, S. (2006). „Analiza oparta na wykresach i wizualizacja wyników eksperymentów za pomocą ONDEX” . Bioinformatyka . 22 (11): 1383–1390. doi : 10.1093/bioinformatyka/btl081 . PMID 16533819 .
  30. ^ „Szczegóły nagrody BBSRC BB / F006012/1: Ondex” .
  31. ^ „Szczegóły nagrody BBSRC BBS / B / 17131: ComparaGrid - umożliwiające technologie GRID dla genomiki porównawczej” .
  32. Bibliografia _ _ Źródło 19 czerwca 2012 r .
  33. ^ Sieć ontologii w Wielkiej Brytanii http://www.ukontology.org/
  34. Bibliografia _ _ Listy.w3.org . Źródło 10 stycznia 2019 r .
  35. ^ „Journal of Biomedical Semantics” . Journal of Biomedical Semantics . Źródło 10 stycznia 2019 r .
  36. ^ Egaña Aranguren, Mikel (2009). Rola i zastosowanie wzorców projektowych ontologii w bioontologiach (praca doktorska). Uniwersytet w Manchesterze.
  37. ^     Brenchley, Rachela (2009). W kierunku zautomatyzowanej adnotacji fosfataz białkowych (praca doktorska). Uniwersytet w Manchesterze. OCLC 855121149 . EThOS uk.bl.ethos.509724 }.
  38. ^ Brązowy, Andrew J. (2007). Niewizualna interakcja z wykresami (praca doktorska). Uniwersytet w Manchesterze. Zarchiwizowane od oryginału w dniu 3 lutego 2014 r.
  39. Bibliografia     _ W kierunku systematycznego podejścia do wielkoskalowej analizy korelacji genotyp-fenotyp (praca doktorska). Uniwersytet w Manchesterze. OCLC 711956205 . EThOS uk.bl.ethos.516331 .
  40. ^     Kadłub, Duncan (2008). Dopasowanie semantyczne bioinformatycznych serwisów internetowych (praca doktorska). Uniwersytet w Manchesterze. OCLC 1064135556 . EThOS uk.bl.ethos.497578 .
  41. ^   Yesilada, Yeliz (2005). Adnotacja i transformacja stron internetowych w celu poprawy mobilności użytkowników z dysfunkcją wzroku (praca doktorska). Uniwersytet w Manchesterze. Copac 36711980 .
  42. ^ Zhao, czerwiec (2007). Model koncepcyjny pochodzenia e-nauki (PDF) (praca doktorska). Uniwersytet w Manchesterze. Zarchiwizowane od oryginału (PDF) w dniu 6 października 2012 r.
  43. ^ „Prof Robert Stevens - Uniwersytet w Manchesterze” . Research.manchester.ac.uk . Źródło 10 stycznia 2019 r .
Biura akademickie
Poprzedzony
Kierownik Wydziału Informatyki, University of Manchester 2016 – obecnie
Beneficjant