SPTLC2
| Identyfikatory | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| SPTLC2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| , HSN1C, LCB2, LCB2A, NSAN1C, SPT2, hLCB2a, palmitoilotransferaza serynowa, podstawowa podjednostka o długim łańcuchu 2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Identyfikatory zewnętrzne | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Wikidane | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Palmitoilotransferaza serynowa, długołańcuchowa podjednostka zasadowa 2 , znana również jako SPTLC2 , jest białkiem , które u ludzi jest kodowane przez gen SPTLC2 . SPTLC2 należy do rodziny aminotransferaz zależnych od fosforanu pirydoksalu klasy II.
Funkcjonować
SPTLC2 koduje długołańcuchową podjednostkę zasadową palmitoilotransferazy serynowej (SPT). Heterodimer utworzony z LCB1/SPTLC1 stanowi rdzeń katalityczny. Katalizuje pirydoksalu 5'-fosforanową kondensację L- seryny z tioestrem acylo-CoA z wytworzeniem aminoalkoholu. Skład kompleksu SPT determinuje preferencje substratu. Kompleks SPTLC1-SPTLC2-SPTSSA wykazuje silną preferencję dla substratu C16-CoA, podczas gdy kompleks SPTLC1-SPTLC2-SPTSSB wykazuje preferencję dla substratu C18-CoA.
Kompleks SPT syntetyzuje cząsteczki wykorzystywane w różnych procesach biologicznych. Na przykład sfingozyna, 18-węglowy aminoalkohol z nienasyconym łańcuchem węglowodorowym, może być fosforylowana przez kinazę sfingozyny. Powstały sfingozyno-1-fosforan jest silnym lipidem sygnałowym. Sfingozyna jest również substratem do syntezy różnych innych cząsteczek, w tym ceramidów , sfingomieliny , cerebrozydów i globozydów .
Ceramidy naskórkowe mają kluczowe znaczenie dla prawidłowego funkcjonowania bariery skórnej, a SPTLC2 ulega zróżnicowanej ekspresji w różnych miejscach ciała, aby regulować skład ceramidów naskórka. W szczególności SPTLC2 jest regulowany w górę w keratynocytach warstwy ziarnistej akralnej .
Dystrybucja tkanek
SPTLC2 jest szeroko eksprymowany we wszystkich tkankach.
Znaczenie kliniczne
Mutacje w SPTLC2 zidentyfikowano u pacjentów z dziedziczną neuropatią czuciową typu I.
W odpowiedzi na IL-17A i TNF, SPTLC2 jest silnie regulowany w łuszczycy i jest prawdopodobnie odpowiedzialny za niektóre zmiany ceramidów naskórka obserwowane w blaszkach łuszczycowych.
Zidentyfikowano alternatywne splicingowe warianty kodujące różne izoformy SPTLC2.
Ekspresja SPTLC2 jest silnie zwiększona na poziomie białka w mózgach pacjentów z chorobą Alzheimera . Nie obserwuje się zmian na poziomie mRNA.
Dalsza lektura
- Takeda J, Yano H, Eng S, Zeng Y, Bell GI (listopad 1993). „Inwentarz molekularny ludzkich wysepek trzustkowych: analiza sekwencji 1000 klonów cDNA”. Genetyka molekularna człowieka . 2 (11): 1793–1798. doi : 10.1093/hmg/2.11.1793 . PMID 7506601 .
- Hillier LD, Lennon G, Becker M, Bonaldo MF, Chiapelli B, Chissoe S i in. (wrzesień 1996). „Generowanie i analiza 280 000 znaczników sekwencji wyrażanych przez człowieka” . Badania genomu . 6 (9): 807–828. doi : 10.1101/gr.6.9.807 . PMID 8889549 .
- Nagiec MM, Lester RL, Dickson RC (październik 1996). „Synteza sfingolipidów: identyfikacja i charakterystyka cDNA ssaków kodujących podjednostkę Lcb2 palmitoilotransferazy serynowej”. gen . 177 (1–2): 237–241. doi : 10.1016/0378-1119(96)00309-5 . PMID 8921873 .
- Weiss B, Stoffel W (październik 1997). „Ludzka i mysia transferaza serynowo-palmitoilo-CoA - klonowanie, ekspresja i charakterystyka kluczowego enzymu w syntezie sfingolipidów” . Europejski Dziennik Biochemii . 249 (1): 239–247. doi : 10.1111/j.1432-1033.1997.00239.x . PMID 9363775 .
- Nagase T, Ishikawa K, Miyajima N, Tanaka A, Kotani H, Nomura N, Ohara O (luty 1998). „Przewidywanie sekwencji kodujących niezidentyfikowanych ludzkich genów. IX. Kompletne sekwencje 100 nowych klonów cDNA z mózgu, które mogą kodować duże białka in vitro” . Badania DNA . 5 (1): 31–39. doi : 10.1093/dnares/5.1.31 . PMID 9628581 .
- Hanada K, Hara T, Nishijima M (marzec 2000). „Oczyszczanie kompleksu palmitoilotransferazy serynowej odpowiedzialnego za syntezę zasad sfingoidów za pomocą technik chromatografii peptydów powinowactwa” . Journal of Biological Chemistry . 275 (12): 8409–8415. doi : 10.1074/jbc.275.12.8409 . PMID 10722674 .
- Dias Neto E, Correa RG, Verjovski-Almeida S, Briones MR, Nagai MA, da Silva W, et al. (marzec 2000). „Sekwencjonowanie typu shotgun ludzkiego transkryptomu za pomocą znaczników sekwencji wyrażanych w ORF” . Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 97 (7): 3491–3496. Bibcode : 2000PNAS...97.3491D . doi : 10.1073/pnas.97.7.3491 . PMC 16267 . PMID 10737800 .
- Dawkins JL, Brahmbhatt S, Auer-Grumbach M, Wagner K, Hartung HP, Verhoeven K i in. (październik 2002). „Wykluczenie podjednostki 2 zasady palmitoilotransferazy serynowej (SPTLC2) jako wspólnej przyczyny dziedzicznej neuropatii czuciowej”. Zaburzenia nerwowo-mięśniowe . 12 (7-8): 656-658. doi : 10.1016/S0960-8966(02)00015-9 . PMID 12207934 . S2CID 1248860 .
- Stachowitz S, Alessandrini F, Abeck D, Ring J, Behrendt H (listopad 2002). „Przerwanie bariery przepuszczalności zwiększa poziom palmitoilotransferazy serynowej w ludzkim naskórku” . The Journal of Investigative Dermatology . 119 (5): 1048–1052. doi : 10.1046/j.1523-1747.2002.19524.x . PMID 12445191 .
- Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N i in. (październik 2005). „W kierunku mapy w skali proteomu sieci interakcji białko-białko człowieka”. Natura . 437 (7062): 1173–1178. Bibcode : 2005Natur.437.1173R . doi : 10.1038/natura04209 . PMID 16189514 . S2CID 4427026 .
- Olsen JV, Blagoev B, Gnad F, Macek B, Kumar C, Mortensen P, Mann M (listopad 2006). „Globalna, in vivo i specyficzna dla miejsca dynamika fosforylacji w sieciach sygnalizacyjnych” . komórka . 127 (3): 635–648. doi : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . PMID 17081983 .
- Chen M, Han G, Dietrich CR, Dunn TM, Cahoon EB (grudzień 2006). „Zasadniczy charakter sfingolipidów w roślinach, ujawniony przez funkcjonalną identyfikację i charakterystykę podjednostki Arabidopsis LCB1 palmitoilotransferazy serynowej” . Komórka Roślinna . 18 (12): 3576–3593. doi : 10.1105/tpc.105.040774 . PMC 1785403 . PMID 17194770 .
- Hornemann T, Wei Y, von Eckardstein A (lipiec 2007). „Czy palmitoilotransferaza serynowa ssaków jest kompleksem o dużej masie cząsteczkowej?” . Dziennik biochemiczny . 405 (1): 157–164. doi : 10.1042/BJ20070025 . PMC 1925250 . PMID 17331073 .