SYBR Bezpieczny

SYBR Bezpieczny

Nazwy
nazwa IUPAC ( Z )-4-((3-metylobenzo[ d ]tiazol-2(3H ) -ylideno)metylo)-1-propylochinolin-1-ium
Identyfikatory
Numer CAS	1030826-36-8   Y
Model 3D ( JSmol )	Interaktywny obraz
InChI InChI=1S/C21H21N2S.C7H8O3S/c1-3-13-23-14-12-16(17-8-4-5-9-18(17)23)15-21-22(2)19-10- 6-7-11-20(19)24-21;1-6-2-4-7(5-3-6)11(8,9)10/h4-12,14-15H,3,13H2, 1-2H3;2-5H,1H3,(H,8,9,10)/q+1;/p-1 Klucz: YTHKVAWQFBVEJQ-UHFFFAOYSA-M
UŚMIECHA SIĘ CCC[n+]1ccc(C=C2Sc3cccc3N2C)c2ccccc21.Cc1ccc(S(=O)(=O)[O-])cc1
Nieruchomości
Wzór chemiczny	C 28 H 28 N 2 O 3 S 2
Masa cząsteczkowa	504,66 g·mol -1
Rozpuszczalność	Rozpuszczalny w dimetylosulfotlenku
O ile nie zaznaczono inaczej, dane dotyczą materiałów w ich stanie normalnym (w temperaturze 25 °C [77 °F], 100 kPa).   Y ( co to jest Y N ?) Referencje w Infoboksie

SYBR Safe to barwnik cyjaninowy stosowany jako barwnik kwasów nukleinowych w biologii molekularnej . SYBR Safe to jeden z wielu barwników SYBR produkowanych przez firmę Life Technologies Corporation. SYBR Safe wiąże się z DNA . Powstały kompleks barwnikowy DNA pochłania światło niebieskie (λ _max = 509 nm) i emituje światło zielone (λ _max = 524 nm).

Bezpieczeństwo

SYBR Safe jest sprzedawany jako bezpieczniejsza alternatywa dla bromku etydyny . Jednakże, ponieważ sama cząsteczka jest nieco większa niż bromek etydyny, nie wiąże się ona tak łatwo z kolumną ekstrakcji żelowej, co czyni ją mniej efektywną przy próbie klonowania fragmentu DNA do plazmidu. SYBR Safe ma bardzo podobną budowę do oranżu tiazolowego, który posiada grupę metylową przyłączoną do naładowanego azotu, natomiast SYBR Safe posiada grupę N -propylową. Wykazano, że Thiazole Orange jest trzy do czterech razy mniej mutagenny niż bromek etydyny, podczas gdy SYBR Safe jest cztery do pięciu razy mniej mutagenny. Ponadto, według strony internetowej Life Technologies, SYBR Safe nie jest śmiertelny dla szczurów w dawkach tak wysokich jak 5 g/kg, a szczury nie wykazują objawów ostrej toksyczności. W tej dawce oranż tiazolowy wykazuje toksyczność.

Podobne barwniki cyjaninowe

• TO (pomarańcza tiazolowa)
• SYBR Zielony I
• SYBR Zielony II
• SYBR Złoto
• YO (żółcień oksazolowa)
• PG (PicoGreen)

Zobacz też

• GelGreen - konkurencyjny produkt o innej strukturze molekularnej i wielkości