Terri Attwood

Terri Attwood
Portret Terri Attwood autorstwa Lindy Bussey
Urodzić się	Teresa K. Attwood ( 20.11.1959 ) 20 listopada 1959
Alma Mater	Uniwersytet w Leeds
Znany z	Baza DRUKÓW Narzędzia UTOPII
Nagrody	Stypendium badawcze Royal Society University 1993–2002
Kariera naukowa
Pola	Bioinformatyka Pobieranie odcisków palców białek
Instytucje	Uniwersytet w Manchesterze University College London Uniwersytet w Leeds EMBL-EBI
Praca dyplomowa	Mezofazy chromonowe (1984)
Doradca doktorski	Johna E. Lydona
Doktoranci	Manuela Corpsa
Strona internetowa	www.bioinf.manchester.ac.uk/dbbrowser _ _ _ _ _ manchester.ac.uk/research/fls/Teresa.k.attwood _ _ _ _ _ _ _

Teresa K. Attwood jest profesorem bioinformatyki na Wydziale Informatyki i Wydziału Nauk Biologicznych na Uniwersytecie w Manchesterze oraz gościnnie w Europejskim Instytucie Bioinformatyki (EMBL-EBI) . W latach 1993-1999 była stypendystką Royal Society University Research Fellowship na University College London (UCL) oraz na University of Manchester w latach 1999-2002.

Edukacja

Attwood uzyskała tytuł Bachelor of Science in Biophysics na Uniwersytecie w Leeds w 1982 roku. Tytuł doktora , również z biofizyki, uzyskała dwa lata później, w 1984 roku pod kierunkiem Johna E. Lydona, badającego mezofazy chromonowe .

Badania i kariera

Attwood podjęła badania podoktoranckie w Leeds do 1993 r., kiedy to przeniosła się na University College London na pięć lat, po czym przeniosła się na Uniwersytet w Manchesterze w 1999 r. Jej badania dotyczą dopasowania sekwencji białek i analizy białek .

Zainspirowany stworzeniem PROSITE , Attwood opracował metodę pobierania odcisków palców białek i wykorzystał ją do stworzenia bazy danych PRINTS . Wraz z Amosem Bairochem starała się ujednolicić prace nad klasyfikacją i adnotacją rodzin białek , ostatecznie wspólnie z Rolfem Apweilerem zdobywając dotację Unii Europejskiej na utworzenie InterPro , z Pfam , ProDom i Swiss-Prot/TrEMBL jako partnerami konsorcjum w 1997 roku.

Attwood kierował dużymi projektami, w tym konsorcjum eksploracji tekstu BioMinT FP5 , konsorcjum edukacji bioinformatycznej EMBER (w tym EBI i Szwajcarski Instytut Bioinformatyki jako partnerzy) oraz platformą EPSRC PARADIGM. Jest głównym badaczem w Manchesterze w projektach SeqAhead ( sieć analizy danych sekwencjonowania nowej generacji ) i AllBio (infrastruktura bioinformatyczna dla nauk o komórkach, zwierzętach i roślinach), a także była Manchester PI na EMBRACE i EuroKUP (proteomika nerek i moczu). Attwood był członkiem Komitetu Strategii Szkoleń Bioinformatycznych ELIXIR (Pakiet Roboczy 11) podczas fazy przygotowawczej ELIXIR. Obecnie jest przewodniczącą EMBnet Global Bioinformatics Network, była członkiem komitetów wykonawczych International Society for Biocuration i Bioinformatics Training Network, a niedawno został wybrany do Rady Dyrektorów Międzynarodowego Towarzystwa Biologii Obliczeniowej. W 2012 r. przewodziła utworzeniu GOBLET (Globalnej Organizacji Nauki, Edukacji i Szkoleń Bioinformatycznych), z głównymi stowarzyszeniami, sieciami i organizacjami zajmującymi się bioinformatyką, biologią obliczeniową i biokuracją jako partnerami. Od 2016 roku Attwood jest przewodniczącym zarządu GOBLET.

Oprócz tego, że jest biokuratorką , współtworzyła narzędzia do wyrównywania i wizualizacji sekwencji i struktur białek, w tym Ambrosia i CINEMA. Grupa buduje komponenty oprogramowania wielokrotnego użytku do tworzenia użytecznych aplikacji bioinformatycznych za pośrednictwem UTOPIA (narzędzia bioinformatyczne) i opracowuje nowe podejścia do automatycznej adnotacji i eksploracji tekstu , takie jak PRECIS, METIS, BioIE, oraz semantyczne podejścia do integracji danych, takie jak Semantic Biochemical Journal opublikowane przez Portland Press . Narzędzia UTOPIA stanowią podstawę zarówno Semantic Biochemical Journal oraz wspólny projekt z firmami Pfizer i AstraZeneca mający na celu opracowanie XXI-wiecznego interfejsu do literatury biomedycznej i zarządzania danymi.

Badania Attwood otrzymały fundusze od Rady ds. Badań Inżynierii i Nauk Fizycznych , Rady ds. Badań Biotechnologii i Nauk Biologicznych , Wellcome Trust , Towarzystwa Królewskiego , Unii Europejskiej i przemysłu.

Nauczanie

Attwood wykłada na kursach licencjackich i podyplomowych oraz był doradcą doktoranckim lub współpromotorem kilku doktorantów (np. Manuel Corpas ). Attwood jest współautorem kilku rozdziałów w książkach i trzech popularnych podręczników bioinformatyki: Wprowadzenie do bioinformatyki i bioinformatyki oraz Ewolucja molekularna . Attwood jest współautorem podręcznika bioinformatyki Bioinformatics Challenges at the Interface of Biology and Computer Science: Mind the Gap with Steve Pettifer i Dave'a Thorne'a.

Usługa akademicka

Attwood jest członkiem zespołu redakcyjnego Biochemical Journal , Database: The Journal of Biological Databases and Curation and Cellular Proteomics , Journal of Molecular Graphics and Modeling oraz EMBnet.journal

Nagrody i wyróżnienia

Attwood był członkiem Royal Society University Research Fellowship (URF) w latach 1993-2002.