Amosa Bairocha

„Bairoch” przekierowuje tutaj. Dla historyka gospodarczego, patrz Paul Bairoch .

Amos Bairoch
Amos Bairoch
Urodzić się	( 22.11.1957 ) 22 listopada 1957
Alma Mater	Uniwersytet Genewski
Znany z	Swiss-Prot ExPASy
Nagrody	Nagroda pioniera proteomiki (2013) Nagroda Otto Naegeli (2010) Europejska Nagroda Latsis (2004)
Kariera naukowa
Pola	Biologia obliczeniowa Bioinformatyka Proteomika
Instytucje	Szwajcarski Instytut Bioinformatyki
Strona internetowa	web .expasy .org /groups /people /amos .html

Amos Bairoch (ur. 22 listopada 1957 r.) To szwajcarski bioinformatyk i profesor bioinformatyki na Wydziale Nauk Białkowych Uniwersytetu Genewskiego, gdzie kieruje grupą CALIPHO w Szwajcarskim Instytucie Bioinformatyki (SIB), łącząc bioinformatykę, kurację i eksperymenty. próby funkcjonalnego scharakteryzowania ludzkich białek.

Jego ojcem był historyk gospodarczy Paul Bairoch .

Edukacja

Jego pierwszy projekt jako doktorat. studentem był rozwój PC/Gene, pakietu oprogramowania opartego na MS-DOS do analizy sekwencji białek i nukleotydów. PC/Gene został skomercjalizowany najpierw przez szwajcarską firmę (Genofit), a następnie przez firmę Intelligenetics w USA, którą później kupił Oxford Molecular.

Badania

Jego główna praca dotyczy analizy sekwencji białek, aw szczególności rozwoju baz danych i narzędzi programowych do tego celu. Jego najważniejszym wkładem jest wkład ludzkiej wiedzy poprzez staranne ręczne adnotacje w danych związanych z białkami.

Pracując nad PC/Gene, zaczął opracowywać bazę danych sekwencji białek z adnotacjami, która stała się Swiss-Prot i została po raz pierwszy opublikowana w lipcu 1986. Od 1988 roku był to wspólny projekt z grupą Data Library Europejskiego Laboratorium Biologii Molekularnej , który później przekształciła się w Europejski Instytut Bioinformatyki (EBI).

Baza danych Swiss-Prot jest głównym zasobem sekwencji białek na świecie i była kluczowym instrumentem badawczym zarówno dla bioinformatyków, jak i naukowców laboratoryjnych w bardzo szerokim zakresie zastosowań. Miarą jej sukcesu jest niedawny rozwój UniProt, najobszerniejszego na świecie katalogu informacji o białkach. UniProt to centralne źródło informacji o sekwencjach i funkcjach białek, stworzone przez połączenie informacji zawartych w Swiss-Prot , TrEMBL i American Protein Information Resource (PIR) .

W 1988 roku zaczął rozwijać PROSITE , bazę danych rodzin i domen białek. Nieco później stworzył ENZYME, bazę danych nazewnictwa enzymów, a także SeqAnalRef, bibliograficzną bazę danych do analizy sekwencji.

We współpracy z Ronem Appelem zainicjował w sierpniu 1993 roku pierwszy serwer WWW dla biologii molekularnej, ExPASy . To, co miało być prototypem, szybko przekształciło się w główną witrynę, która zapewnia dostęp do wielu baz danych utworzonych częściowo lub całkowicie w Genewie, a także do wielu narzędzi do analizy białek (proteomika).

W 1998 wraz z kolegami w Genewie i Lozannie był jednym z założycieli SIB Swiss Institute of Bioinformatics, którego misją jest stworzenie w Szwajcarii centrum doskonałości w dziedzinie bioinformatyki z naciskiem na badania, edukację, usługi i rozwój baz danych i narzędzi.

W listopadzie 1997 wraz z Ronem Appelem i Denisem Hochstrasserem założył GeneBio (Geneva Bioinformatics SA), firmę zajmującą się wiedzą biologiczną. W kwietniu 2000 roku powyższe osoby wraz z Keithem Rose i Robinem Offordem założyły GeneProt (Geneva Proteomics), firmę zajmującą się proteomiką o dużej przepustowości, która zakończyła działalność w 2005 roku.

Od 2009 roku w ramach kierowanej przez siebie i Lydie Lane grupy CALIPHO jest zaangażowany w rozwój neXtProt , zasobu, który ma na celu dostarczenie naukowcom szerokiego spektrum wiedzy na temat wszystkich ludzkich białek.

Jest również zaangażowany w rozwój Cellosaurus, źródła wiedzy o liniach komórkowych.

Według Google Scholar i Scopus , od 2015 roku jego najczęściej cytowane artykuły w czasopismach naukowych były publikowane w Nucleic Acids Research , Biochemical Journal , Nature , Briefings in Bioinformatics i Database .

Nagrody i wyróżnienia

Bairoch był laureatem 1993 Friedrich Miescher Award od Swiss Society of Biochemistry, 1995 Helmut Horten Foundation Incentive Award, 2004 Pehr Edman Award, 2004 European Latsis Prize, 2010 Otto Naegeli Prize , 2011 HUPO Distinguished Achievement Award w Proteomic Sciences., nagrodę pioniera proteomiki EUPA w 2013 r., aw 2018 r. nagrodę ABRF Award .

cytaty

W miarę jak proces się zatrzymuje, dochodzimy do punktu, w którym każdy genom, który można zsekwencjonować, zostanie zsekwencjonowany.