Bonnie Bergera

Bonnie Bergera
Urodzić się	Bonnie Anna Berger
Alma Mater	Brandeis University (SB) Massachusetts Institute of Technology (doktorat)
Nagrody	Narodowa Akademia Nauk , członek (2020) AWM-SIAM Nagroda za wykład Soni Kowalewskiej (2020) Stypendysta AMS (2019) Nagroda Starszego Naukowca ISCB (2019) Stypendysta AIMBE (2016) Amerykańska Akademia Sztuki i Nauki , członek (2012) Stypendysta ISCB (2012) Stypendysta ACM (2003) Nagroda TR100 recenzji technologii (1999) Międzynarodowy Kongres Matematyków Zaproszony mówca (1998) Nagroda Margaret Oakley Dayhoff (1997) Nagroda Machteya (1989)
Kariera naukowa
Pola	Bioinformatyka
Praca dyplomowa	Używanie losowości do projektowania wydajnych algorytmów deterministycznych (1990)
Doradca doktorski	Sylwio Mikali
Doktoranci	Manolisa Kellisa Serafin Batzoglou Lior Pachter Mona Singh
Strona internetowa	ludzie .csail .mit .edu /bab

Bonnie Anne Berger jest amerykańską matematyczką i informatykiem , która pracuje jako profesor matematyki Simons oraz profesor elektrotechniki i informatyki w Massachusetts Institute of Technology . Jej zainteresowania badawcze to algorytmy , bioinformatyka i obliczeniowa biologia molekularna .

Edukacja

Berger ukończyła studia licencjackie na Brandeis University i uzyskała doktorat na MIT w 1990 roku pod kierunkiem Silvio Micali . Jako studentka zdobyła nagrodę Machteya w 1989 roku za artykuł na temat algorytmów równoległych , który opublikowała wraz z innym studentem Johnem Rompelem na Sympozjum na temat podstaw informatyki .

Kariera i badania

Po uzyskaniu doktoratu Berger pozostała w MIT w celu prowadzenia badań podoktoranckich , gdzie została członkiem wydziału w 1992 r. Jej badania w dziedzinie bioinformatyki zostały opublikowane w wiodących recenzowanych czasopismach naukowych, w tym Science , Journal of Algorithms . Wśród jej byłych doktorantów znaleźli się Serafim Batzoglou , Lior Pachter , Mona Singh , Manolis Kellis i Phil Bradley .

Berger był wiceprezesem Międzynarodowego Towarzystwa Biologii Obliczeniowej (ISCB) i przewodniczącym komitetu sterującego RECOMB .

Nagrody i wyróżnienia

Berger był laureatem nagrody Margaret Oakley Dayhoff w 1997 roku . W 1998 r. była zaproszonym mówcą Międzynarodowego Kongresu Matematyków w Berlinie (nie mogła jednak wystąpić osobiście). W 1999 roku Berger znalazł się na liście 100 najlepszych innowatorów opublikowanej przez Technology Review . W 2003 roku Berger została członkiem Association for Computing Machinery (ACM), aw 2012 roku została wybraną członkinią American Academy of Arts and Sciences oraz członkiem International Society for Computational Biology (ISCB). W 2016 roku Berger został wprowadzony do kolegium stypendystów Amerykańskiego Instytutu Inżynierii Medycznej i Biologicznej (AIMBE). Została włączona do klasy stypendystów Amerykańskiego Towarzystwa Matematycznego 2019 „za wkład w biologię obliczeniową, bioinformatykę, algorytmy i mentoring”. Otrzymała również doktorat honoris causa École Polytechnique Fédérale de Lausanne (EPFL). Pełni funkcję członkini-at-large Sekcji Matematyki w American Association for the Advancement of Science (AAAS). W 2019 roku otrzymała nagrodę ISCB Accomplishment by a Senior Scientist Award. W 2020 roku wygłosiła AWM - SIAM Sonia Kovalevsky, a dodatkowo została wybrana do Narodowej Akademii Nauk. Została wybrana na członka Towarzystwa Matematyki Przemysłowej i Stosowanej w klasie stypendystów SIAM 2022 „za pionierską pracę w obliczeniowej biologii molekularnej, w tym genomikę porównawczą i kompresyjną, wnioskowanie sieciowe, prywatność genomową i przewidywanie struktury białek”.