Temple F. Smith

Temple Smith
Temple Smith na Uniwersytecie Yale w 2008 roku
Urodzić się	Temple Ferris Smith 7 marca 1939 ( 07.03.1939 ) (wiek 84) Auburn, Nowy Jork
Alma Mater	Uniwersytet Purdue University of Colorado Boulder (doktorat)
Znany z	Algorytm Smitha-Watermana
Nagrody	Nagroda Starszego Naukowca ISCB (2007) Stypendysta ISCB (2009)
Kariera naukowa
Instytucje	Uniwersytet Bostoński
Praca dyplomowa	Amplitudy deuteronów z teorii rozpraszania jądrowego cząstek złożonych (1969)
Wpływy	Michała Watermana
Strona internetowa	www .bu .edu /pol /profile /temple-f-smith-ph-d /

Temple Ferris Smith (ur. 7 marca 1939 r.) Jest emerytowanym profesorem inżynierii biomedycznej , który pomógł opracować algorytm Smitha-Watermana wraz z Michaelem Watermanem w 1981 r. Algorytm Smitha-Watermana służy jako podstawa do porównań wielu sekwencji, identyfikujących segment z maksymalne lokalne podobieństwo sekwencji, patrz dopasowanie sekwencji . Algorytm ten służy do identyfikacji podobnych segmentów DNA , RNA i białek . Był dyrektorem w BioMolecular Engineering Research Center na Uniwersytecie Bostońskim od dwudziestu lat i jest teraz emerytowany profesor .

Edukacja

Smith uzyskał tytuł licencjata w 1963 roku na Wydziale Fizyki Uniwersytetu Purdue , a następnie uzyskał stopień doktora w 1969 roku na Wydziale Fizyki Uniwersytetu Kolorado w Boulder .

Badania i kariera

Po uzyskaniu doktoratu Smith prowadził badania podoktoranckie od marca 1969 do sierpnia 1971 na Wydziale Biofizyki i Genetyki Szkoły Medycznej Uniwersytetu Kolorado w Boulder.

Jego badania koncentrują się na zastosowaniu różnych metod informatycznych i matematycznych do odkrywania wzorców składniowych i semantycznych w sekwencjach kwasów nukleinowych i aminokwasów. W ostatnich latach skupiono się na ewolucji molekularnej rodzin białek. takie jak śmigła beta powtórzeń WD, GTPaza związana z translacją i białka rybosomalne. Znany jest ze stworzenia algorytmu Smitha-Watermana .

Smith zajmował następujące nominacje:

• 1965-1966: instruktor , US Air Force Lowery, Denver, CO
• 1971–1984: profesor , Wydział Fizyki, Uniwersytet Północnego Michigan, Marquette, MI
• 1985–1991: Dyrektor , Zasoby Badań Komputerowych Biologii Molekularnej, Dana-Farber Cancer Institute, Harvard Medical School i Harvard School of Public Health
• 1991–2009: Dyrektor Centrum Zasobów Inżynierii BioMolekularnej na Uniwersytecie Bostońskim
• 1999– : Współorganizator , 1999 Instytut Promocji Naukowej Młodzieży Odkrywającej Dzień Biotechnologii
• 2000– : współzałożyciel i dyrektor ds. informacji w Modular Genetics, Inc.
• 2000–: Młodzieżowy trener hokeja

Wybrane publikacje

• M. Mariotti, TF Smith, PH Sudmant i G. Goldberger, „Pseudogenizacja specyficznego dla jąder Lfg5 poprzedza dywergencję człowiek/neandertalczyk”, Journal of Human Genetics 59, 288–291 (2014)
• Hyman Hartman i Temple F. Smith „Ewolucja rybosomu i kodu genetycznego”, Życie, 4 (2), 227–249 (2014)
• Hartman, H i TF Smith, „GTPazy i pochodzenie rybosomu”, Biology Direct, 5:36-39, (2010)
• Hartman, Hyman i Smith, Temple F. „Ewolucja rzęski i komórki eukariotycznej” Ruchliwość komórek i cytoszkielet.66: 215-219. (2009)
• Hu, Lan, Smith, Temple F. i Goldberger, Gabriel. „LFG: kandydująca rodzina genów regulujących apoptozę” Apoptoza. 14: 1255-1265. (2009)
• Smith, Temple F., Lee, Jung C., Gutell, Robin R. i Hartman, Hyman. „Pochodzenie i ewolucja rybosomu” Biology Direct 3: 16, 1–13 (2008)
• Smith, Temple F. „Rozdział 2: Różnorodność białek powtórzeń WD” The Coronin Family of Proteins, 20–30 (2008)
• Bhutkar, Arjun V., Gelbart, William M. i Smith, Temple F. (2007). Wnioskowanie o filogenezie rearanżacji w skali genomu i kolejności genów przodków: studium przypadku Drosophila. Biologia genomu 8, R236
• Bhutkar, Arjun, Russo, Susan M., Smith, Temple F. i Gelbart, William M. „Analiza genów przemieszczonych w skali genomu” Genome Research 17: 1880-1887 (2007)
• Hartman, Hyman, Favaretto, Paola i Smith, Temple F. „Archealne początki eukariotycznego systemu translacyjnego” Archaea 2: 1-9 (2006)
• Bieńkowska, Jadwiga, Hartman, Hyman i Smith, Temple F. (2003). Metoda poszukiwania homologów małych białek, białek podobnych do ubikwityny w komórkach prokariotycznych? Inżynieria białek 16 (12), 897–904.
• Venkatesan, Kavitha, McManus, Heather R., Mello, Craig C., Smith, Temple F. i Hansen, Ulla. (2003). Konserwacja funkcjonalna między członkami starożytnej rodziny zduplikowanych czynników transkrypcyjnych, LSF / Grainyhead. Badania kwasów nukleinowych 31 (15), 4304–4316.
• Zhang YX1, Fox JG, Ho Y, Zhang L, Stills HF Jr, Smith TF. Porównanie genu głównego białka błony zewnętrznej (MOMP) mysiego zapalenia płuc (MoPn) i chomika SFPD szczepów Chlamydia trachomatis z innymi szczepami Chlamydia. Mol Biol Evol. Listopad 1993; 10 (6): 1327–42.
• Figge J, Smith TF. Motyw sekwencji podziału komórki. Nature 334 (6178), 109 (14 lipca 1988) |pmid=3290690 |doi=10.1038/334109a0.

Nagrody i wyróżnienia

Smith otrzymał nagrodę ISCB Senior Scientist Award i został wybrany członkiem ISCB Fellow w 2009 roku przez International Society for Computational Biology .

W 2002 roku został przyjęty do Amerykańskiego Instytutu Inżynierii Medycznej i Biologicznej (AIMBE) „za niezwykły wkład w zdefiniowanie i rozwój dziedziny bioinformatyki, z naciskiem na nowatorskie metody inżynieryjne do przewidywania struktury i funkcji białek”.