Michała Watermana

Michael Waterman
Michael Waterman w 2004 roku
Urodzić się	Michaela Spencera Watermana 28 czerwca 1942 ( 28.06.1942 ) (wiek 80) Coquille, Oregon , Stany Zjednoczone
Alma Mater	Uniwersytet Stanowy Oregon Uniwersytet Stanowy Michigan (doktorat)
Znany z	Algorytm Smitha-Watermana Formuła Landera-Watermana Montaż sekwencji De Bruijna
Nagrody	Stypendium Guggenheima (1995) Międzynarodowa Nagroda Fundacji Gairdnera (2002) Stypendysta ISCB (2009) Nagroda im. Dana Davida (2015)
Kariera naukowa
Pola	Biologia obliczeniowa Prawdopodobieństwo Statystyka Informatyka Matematyka dyskretna Kombinatoryka
Instytucje	Uniwersytet Wirginii Uniwersytet Południowej Kalifornii Narodowe Laboratorium Los Alamos Uniwersytet Stanowy Idaho
Praca dyplomowa	Niektóre właściwości ergodyczne wielowymiarowych rozszerzeń F (1969)
Doradca doktorski	Johna Rankina Kinneya
Znani studenci	Pavel Pevzner (postdoc) Tandy Warnow (postdoc)
Wpływy	Temple F. Smith
Strona internetowa	dornsife .usc .edu /labs /msw /

Michael Spencer Waterman (ur. 28 czerwca 1942 r.) jest profesorem biologii , matematyki i informatyki na Uniwersytecie Południowej Kalifornii (USC) , gdzie pełni funkcję profesora nauk biologicznych, matematyki i informatyki. On wcześniej zajmował stanowiska w Los Alamos National Laboratory i Idaho State University .

Edukacja i wczesne życie

Waterman dorastał w pobliżu Bandon w stanie Oregon i uzyskał tytuł licencjata z matematyki na Oregon State University , a następnie uzyskał doktorat ze statystyki i prawdopodobieństwa na Michigan State University w 1969 roku.

Badania i kariera

Waterman jest jednym z założycieli i obecnych liderów w dziedzinie biologii obliczeniowej . Koncentruje się na zastosowaniu matematyki, statystyki i technik informatycznych do różnych problemów biologii molekularnej . Jego praca przyczyniła się do powstania niektórych z najczęściej używanych narzędzi w tej dziedzinie. W szczególności algorytm Smitha-Watermana (opracowany z Temple F. Smith ) jest podstawą wielu programów dopasowywania sekwencji . W 1988 roku Waterman i Eric Lander opublikował przełomowy artykuł opisujący model matematyczny mapowania odcisków palców. Ta praca stanowiła jeden z teoretycznych kamieni węgielnych wielu późniejszych projektów mapowania i sekwencjonowania DNA, zwłaszcza Human Genome Project . Artykuł Idury'ego i Watermana z 1995 roku przedstawił sekwencji Eulera-De Bruijna , który jest szeroko stosowany w projektach sekwencjonowania nowej generacji.

Wraz z Pavelem A. Pevznerem (byłym pracownikiem naukowym ze stopniem doktora w jego laboratorium) rozpoczął międzynarodową konferencję Research in Computational Molecular Biology (RECOMB) i jest założycielem i redaktorem Journal of Computational Biology . Waterman jest także autorem jednego z najwcześniejszych podręczników w tej dziedzinie: Wprowadzenie do biologii obliczeniowej .

Nagrody i wyróżnienia

Wraz z Cyrusem Chothią i Davidem Hausslerem Waterman otrzymał w 2015 roku nagrodę im. Dana Davida za wkład w dziedzinę bioinformatyki . Otrzymał tytuł doktora honoris causa Uniwersytetu w Tel Awiwie w 2011 r. oraz doktorat honoris causa Uniwersytetu Południowej Danii w 2013 r.

Waterman jest członkiem Amerykańskiej Akademii Sztuki i Nauki od 1995 r. członkiem Narodowej Akademii Inżynierii USA od 2012 r. członkiem Chińskiej Akademii Nauk od 2013 r. i członek Narodowej Akademii Nauk Stanów Zjednoczonych od 2001 r. Był akademikiem Francuska Akademia Nauk od 2005 r.

Waterman został wybrany członkiem ISCB Fellow w 2009 roku przez Międzynarodowe Towarzystwo Biologii Obliczeniowej i otrzymał nagrodę ISCB Senior Scientist Award w 2009 roku.

Życie osobiste

Waterman napisał pamiętnik „ Getting Outside ” o dzieciństwie spędzonym na odosobnionym ranczo na południowym wybrzeżu Oregonu w połowie XX wieku.