Alexa Batmana

Alex Bateman
Alex Bateman przemawia na konferencji Intelligent Systems for Molecular Biology (ISMB) w Berlinie w 2013 r.
Urodzić się	Aleksandra Jerzego Batemana ( 09.10.1972 ) 9 października 1972
Alma Mater	Uniwersytet w Newcastle (licencjat) Uniwersytet Cambridge (doktorat)
Znany z	UniProt Pfam Rfam MiRBase
Nagrody	Nagroda Benjamina Franklina (2010) Stypendysta ISCB (2017)
Kariera naukowa
Pola	Bioinformatyka Biologia obliczeniowa Struktura białka RNA
Instytucje	Instytut Wellcome Trust Sanger Europejski Instytut Bioinformatyki Pracownia Biologii Molekularnej
Praca dyplomowa	Ewolucja struktury i funkcji nadrodziny immunoglobulin (1997)
Doradca doktorski	Cyrus Chotia
Inni doradcy akademiccy	Richarda M. Durbina
Strona internetowa	www .ebi .ac .uk /about /people /alex-bateman

Alexander George Bateman jest biologiem obliczeniowym i kierownikiem działu zasobów sekwencji białek w Europejskim Instytucie Bioinformatyki (EBI) , będącym częścią Europejskiego Laboratorium Biologii Molekularnej (EMBL) w Cambridge w Wielkiej Brytanii. Kierował rozwojem Pfam i wprowadził bazę danych rodzin RNA Rfam . Był również zaangażowany w wykorzystywanie Wikipedii do społecznościowego dodawania adnotacji do biologicznych baz danych.

Edukacja

Bateman uzyskał tytuł Bachelor of Science w dziedzinie biochemii na Uniwersytecie w Newcastle w 1994 r. Stopień doktora uzyskał na Uniwersytecie w Cambridge w 1997 r. za badania nadzorowane przez Cyrusa Chothię nad ewolucją nadrodziny białek immunoglobulin . W tym czasie współpracował również z Seanem Eddym nad odkrywaniem nowych domen białkowych za pomocą oprogramowania HMMER .

Kariera i badania

W 1997 Bateman dołączył do Wellcome Trust Sanger Institute , aby kierować rozwojem biologicznej bazy danych Pfam . W 2003 roku wprowadził bazę rodzin RNA firmy Rfam . Był również zaangażowany w dostarczanie analizy białek do publikacji ludzkiego genomu.

Od 2012 roku jest szefem działu Protein Sequence Resources w EMBL-EBI.

Bateman był również zaangażowany w promowanie korzystania z Wikipedii w społeczności naukowej, aw szczególności w społecznościowych adnotacjach biologicznych baz danych za pośrednictwem Wikipedii, na przykład adnotacja bazy danych Rfam za pośrednictwem WikiProject RNA .

Bateman był redaktorem naczelnym czasopisma Bioinformatics w latach 2004-2012, a także redaktorem Nucleic Acids Research , Genome Biology i Current Protocols in Bioinformatics . W 2014 roku został mianowany jednym z pierwszych Honorowych Redaktorów Bioinformatyki . Od 2015 roku Bateman zasiada również w Radzie Dyrektorów ISCB.

Nagrody i wyróżnienia

Bateman otrzymał w 2010 roku nagrodę Benjamina Franklina w dziedzinie bioinformatyki. Został trzecim byłym członkiem Richarda Durbina , który zdobył tę nagrodę, po Seanie Eddym i Ewanie Birneyu . Bateman został wybrany członkiem ISCB Fellow w 2017 roku przez Międzynarodowe Towarzystwo Biologii Obliczeniowej .

Alex Bateman (po lewej) i Cyrus Chothia (po prawej) na konferencji ISMB w Dublinie w 2015 roku