Gary'ego Stormo

Gary Stormo
Gary Stormo przemawia na konferencji ISMB/ECCB 2013.
Urodzić się	Gary'ego Deana Stormo 1950 (wiek 72–73) Południowa Dakota, Stany Zjednoczone
Alma Mater	Kalifornijski Instytut Technologiczny University of Colorado Boulder
Kariera naukowa
Pola	Bioinformatyka Genetyka Biologia molekularna
Instytucje	University of Colorado Boulder Washington University w St. Louis
Praca dyplomowa	Wspomagana komputerowo charakterystyka miejsc inicjacji translacji w E. coli (1981)

Gary Stormo (ur. 1950) to amerykański genetyk, a obecnie profesor Joseph Erlanger na Wydziale Genetyki i Centrum Nauk o Genomie i Biologii Systemów w Washington University School of Medicine w St Louis . Uważany jest za jednego z pionierów bioinformatyki i genomiki . Jego badania łączą podejście eksperymentalne i obliczeniowe w celu zidentyfikowania i przewidywania sekwencji regulatorowych w DNA i RNA oraz ich wkładu w sieci regulacyjne kontrolujące ekspresję genów .

Edukacja

Stormo początkowo specjalizował się w fizyce jako student w California Institute of Technology , ale przeszedł na biologię na młodszym roku. Doktorat z biologii molekularnej uzyskał w 1981 roku na Uniwersytecie Kolorado w Boulder .

Badania

Po uzyskaniu doktoratu Stormo pozostał na University of Colorado jako członek wydziału na wydziale Biologii Molekularnej, Komórkowej i Rozwoju, zostając profesorem, zanim przeniósł się na Washington University w St. Louis w 1999 roku.

Badania Stormo łączą podejście eksperymentalne i obliczeniowe, aby zrozumieć regulację ekspresji genów. Jego prace eksperymentalne koncentrują się na interakcjach białko-DNA i ich roli w regulacji genów. Jego praca obliczeniowa obejmuje analizę tych interakcji i opracowywanie algorytmów rozpoznawania wzorców w celu odkrywania miejsc regulacyjnych w DNA i RNA.

W 1982 roku Stormo i jego współpracownicy wprowadzili Macierz Wagi Pozycji (PWM), obecnie powszechnie używaną reprezentację motywów (wzorców) w sekwencjach biologicznych. Sekwencje konsensusowe były wcześniej używane do reprezentowania wzorców w sekwencjach biologicznych, ale miały trudności z przewidywaniem nowych wystąpień tych wzorców. Pierwszym zastosowaniem PWM było odkrycie RNA , które działają jako miejsca inicjacji translacji . Przewaga PWM nad sekwencjami konsensusowymi sprawiła, że ​​PWM stały się popularną metodą przedstawiania wzorców w sekwencjach biologicznych i istotnym elementem nowoczesnych algorytmów wykrywania motywów .

Opublikował ponad 150 prac naukowych.

Role i zaszczyty

Stormo zasiadał w radzie dyrektorów Międzynarodowego Towarzystwa Biologii Obliczeniowej (ISCB) od 2000 do 2004 roku i został uhonorowany tytułem członka ISCB w 2010 roku. W 2001 roku został wybrany na członka Amerykańskiego Stowarzyszenia Informatyki Medycznej .

Stormo był redaktorem naczelnym czasopisma Bioinformatics w latach 1994-1999. W 2014 roku został mianowany jednym z pierwszych honorowych redaktorów czasopisma Bioinformatics . Stormo był także zastępcą redaktora naczelnego czasopisma PLOS Computational Biology . Obecnie jest współredaktorem czasopisma Current Protocols in Bioinformatics .