Helena M. Berman

Ten artykuł dotyczy profesora chemii. Dla malarza zobacz Helen Berman .

Helen Berman
Helen Berman w 2008 roku.
Urodzić się	Heleny Miriam Berman 1943 (wiek 79–80) Chicago, Illinois
Alma Mater	Kolegium Barnarda Uniwersytet w Pittsburghu
Małżonkowie	Wiktor Berman Peter Young (1976–1999)
Dzieci	Jason Asher Young
Nagrody	Nagroda DeLano (2013) Nagroda Benjamina Franklina (2014)
Kariera naukowa
Pola	Biologia strukturalna Bioinformatyka strukturalna Bazy danych
Instytucje	Uniwersytet w Rutgers
Praca dyplomowa	Struktury krystaliczne alfa-prim i beta-D-mannitolu, galaktolu, metylo-alfa-D-glukopiranozydu i hydroksymocznika (1967)
Doradca doktorski	George A. Jeffrey
Inni doradcy akademiccy	Barbara Low , Jenny Glusker
Strona internetowa	rutchem .rutgers .edu /berman-helen-m

Helen Miriam Berman jest profesorem chemii i biologii chemicznej na Uniwersytecie Rutgers oraz byłym dyrektorem RCSB Protein Data Bank (jednej z organizacji członkowskich Worldwide Protein Data Bank ). Biolog strukturalny, jej praca obejmuje analizę strukturalną kompleksów białko-kwas nukleinowy oraz rolę wody w interakcjach molekularnych. Jest także założycielką i dyrektorką Nucleic Acid Database oraz kierowała bazą wiedzy Protein Structure Initiative Structural Genomics Knowledgebase.

Tło i wykształcenie

Berman urodził się w Chicago w stanie Illinois, a dorastał na Brooklynie w Nowym Jorku. Jej ojciec, David Bernstein, był lekarzem, a jej matka, Dorothy Bernstein (z domu Skupsky), zarządzała praktyką biurową ojca. Zainspirowana pracowitym i uczonym ojcem, jako młoda dziewczyna interesowała się nauką i planowała zostać naukowcem lub lekarzem. Jej matka, która była mocno zaangażowana w działalność społeczną i wolontariat, wpłynęła na jej zaangażowanie w działalność społeczną przez całe życie.

W szkole średniej Berman pracował w laboratorium Ingrith Deyrup w Barnard College . Deyrup zachęcił Bermana do uczęszczania do Barnarda jako student. Podczas studiów pracowała w Columbia University College of Physicians and Surgeons z Barbarą Low . Tam Berman poznał krystalografię , która stała się jego życiową pasją. Ukończyła Barnard z AB w chemii w 1964 roku.

Po ukończeniu college'u Berman uczęszczała na studia podyplomowe na University of Pittsburgh , miejsce, które wybrała, ponieważ było to jedyne miejsce w kraju z wydziałem krystalografii i jedno z nielicznych, w których jako przedmiot oferowano krystalografię. Tam pracowała z George'em A. Jeffreyem nad strukturą węglowodanów, uzyskując tytuł doktora. w 1967 r. Berman pozostał na Uniwersytecie w Pittsburghu jeszcze przez dwa lata jako naukowy ze stopniem doktora .

Kariera

W 1969 roku Berman przeniosła się do Fox Chase Cancer Center w Filadelfii, gdzie pracowała w laboratorium Jenny P. Glusker przed rozpoczęciem własnego niezależnego programu badawczego jako członek wydziału w 1973 roku. W Fox Chase Berman zainteresował się strukturami kwasów nukleinowych oraz w bioinformatyce. Wiedziała, że ​​logiczna organizacja danych sprawi, że będą one przydatne dla różnych naukowców.

W czerwcu 1971 roku Berman wziął udział w sympozjum w Cold Spring Harbor Laboratory , gdzie kilku naukowców zgodziło się, że dane dotyczące rosnącej liczby struktur białkowych powinny być archiwizowane w bazie danych. To spotkanie doprowadziło do utworzenia Protein Data Bank (PDB) w Brookhaven National Laboratory .

W 1989 r. Berman przeniosła się do Rutgers, aw 1992 r. wraz z innymi naukowcami założyła bazę danych kwasów nukleinowych (NDB) w celu gromadzenia i rozpowszechniania informacji o strukturze kwasów nukleinowych. W Rutgers kontynuowała badania kwasów nukleinowych, ich interakcji z białkami, a także badała strukturę kolagenu we współpracy z Barbarą Brodsky i Jordim Bellą. Od 1992 do 2011 jest wymieniona jako deponent 38 struktur w PDB kompleksów białko/kwas nukleinowy i ich składników (np. 1RUN, 3SSX, 2B1B), fragmentów kolagenu (np. 1CGD, 1EI8) i innych makrocząsteczek.

W 1998 roku Berman i Philip Bourne wspólnie rywalizowali i wygrali kontrakt na Protein Data Bank, a baza danych została przeniesiona z Brookhaven pod auspicjami Research Collaboratory for Structural Bioinformatics (RCSB), obecnie współpraca między Rutgers i University of California, San Diego. Wraz ze współpracownikami Berman przeprojektował system zarządzania danymi, dodał nowe narzędzia użytkownika i umożliwił przeszukiwanie bazy danych. Od 2003 roku archiwum PDB jest zarządzane przez światowy Bank Danych Białkowych (wwPDB), partnerstwo założone przez Bermana, które składa się z organizacji działających jako centra gromadzenia, przetwarzania i dystrybucji danych PDB – RCSB, PDBe w Europie i PDBj w Japonii. W 2006 roku bank danych BioMagResData (BMRB) dla magnetycznego rezonansu jądrowego (NMR) został czwartym członkiem wwPDB. Od lipca 2018 r. NDB zawiera ponad 9600 struktur kwasów nukleinowych, a PDB zawiera ponad 142 000 struktur makrocząsteczkowych.

Wiosną 2008 r. uruchomiono bazę wiedzy o genomice strukturalnej inicjatywy Protein Structure Initiative (PSI) , również prowadzoną przez RCSB, aby zapewnić stale aktualizowany portal do danych badawczych i innych zasobów pochodzących z wysiłków PSI.

Berman był również aktywny w środowisku naukowym, pełniąc funkcję prezesa Amerykańskiego Stowarzyszenia Krystalograficznego w 1988 roku, doradzając zarówno Narodowym Instytutom Zdrowia, jak i Narodowej Fundacji Nauki oraz zasiadając w radach redakcyjnych kilku czasopism. Jej prace były szeroko publikowane w recenzowanych czasopismach naukowych .

Berman był producentem wykonawczym i twórcą serialu dokumentalnego Target Zero, który koncentruje się na medycznych i społecznych aspektach leczenia i profilaktyki HIV. Trzy filmy krótkometrażowe przeplatają się z prawdziwymi historiami pacjentów, wywiadami z czołowymi lekarzami, dostawcami usług medycznych i naukowcami; i najnowocześniejsze animacje molekularne. Relacje te rzucają światło na złożoną historię kontrolowania epidemii HIV i ujawniają ciągłą potrzebę współczującej, skoncentrowanej na pacjencie opieki oraz prawdziwego zrozumienia na poziomie komórkowym nauki stojącej za leczeniem.

Honory i nagrody

• Kobieta osiągnięć z New Jersey (1993)
• Fellow, American Association for the Advancement of Science (1996)
• Nagroda dla wybitnej kobiety naukowca, Association for Women in Science , New York Chapter (1999)
• Wybitny wykładowca, Sigma Xi : The Scientific Research Society (2007–2009)
• Nagroda za wybitną służbę, Towarzystwo Biofizyczne (2000) [1]
• Kolega, Towarzystwo Biofizyczne (2001)
• Nagroda MJ Buerger, Amerykańskie Stowarzyszenie Krystalograficzne (2006)
• Nagroda Wydziału Chemii Alumni Uniwersytetu w Pittsburghu (2010)
• Stypendysta Amerykańskiego Stowarzyszenia Krystalograficznego (2011) [2]
• Nagroda Carla Brändéna od Protein Society (2012)
• DeLano Award for Computational Biosciences od Amerykańskiego Towarzystwa Biochemii i Biologii Molekularnej (2013)
• Nagroda Benjamina Franklina za otwarty dostęp w naukach przyrodniczych (2014)

Życie osobiste

Berman była dwukrotnie zamężna, z inżynierem Victorem Bermanem w latach 60. i biologiem molekularnym Peterem Youngiem w latach 1976-1999. Z drugiego małżeństwa ma syna Jasona Ashera Younga (ur. 1979), fizyka.

W latach 80. u Bermana zdiagnozowano raka piersi. To doświadczenie sprawiło, że bardziej skoncentrowała się na swoim życiu i karierze oraz zainteresowała się wspieraniem innych kobiet, które stoją przed tą samą diagnozą.

Linki zewnętrzne

• Transkrypt wywiadu z historii mówionej dla Helen M. Berman w dniu 28 kwietnia 2020 r., American Institute of Physics, Niels Bohr Library and Archives