Celozaur
| Treść | |
|---|---|
| Opis | Cellosaurus : źródło wiedzy na temat linii komórkowych |
| Przechwycone typy danych |
Linie komórkowe |
| Organizmy | Kręgowiec , Owad , Kleszcz |
| Kontakt | |
| Centrum Badań | Szwajcarski Instytut Bioinformatyki |
| Laboratorium | KALIFON |
| Autorski | Amosa Bairocha |
| Dostęp | |
| Format danych | Baza danych plików płaskich , OBO i XML |
| Strona internetowa | |
| Pobierz URL | ftp://ftp.expasy.org/databases/cellosaurus |
| Adres URL usługi internetowej | API https://api.cellosaurus.org/ |
| Narzędzia | |
| Sieć | Szukaj |
| Różnorodny | |
| Licencja | Creative Commons CC BY 4.0 |
| Wersjonowanie | Tak |
| Częstotliwość udostępniania danych |
4 do 6 wydań rocznie |
| Polityka kuracji | Tak – ręczny |
| Obiekty z zakładkami |
Tak - pojedyncze wpisy linii komórkowych |
Cellosaurus to internetowa baza wiedzy na temat linii komórkowych , która próbuje udokumentować wszystkie linie komórkowe wykorzystywane w badaniach biomedycznych . Jest dostarczany przez Szwajcarski Instytut Bioinformatyki (SIB). Jest to ELIXIR , a także uznany zasób IRDiRC. Jest to źródło informacji dla linii komórkowych w Portalu Identyfikacji Zasobów. Według stanu na grudzień 2022 r. zawiera informacje dotyczące ponad 144 000 linii komórkowych.
Jego zakres obejmuje unieśmiertelnione linie komórkowe , naturalnie nieśmiertelne linie komórkowe (przykład: embrionalne komórki macierzyste ) oraz linie komórkowe o ograniczonej żywotności, jeśli są one szeroko rozpowszechnione i stosowane. Cellosaurus zapewnia bogactwo ręcznie dobranych informacji; dla każdej linii komórkowej podaje zalecaną nazwę, synonimy i gatunek pochodzenia. Inne rodzaje informacji obejmują ustandaryzowaną dotyczącą chorób (dla linii komórkowych raka lub zaburzeń genetycznych ), transformant użyty do unieśmiertelnienia linii komórkowej, transfekowane lub wyeliminowane geny, niestabilność mikrosatelitarną , czas podwojenia , płeć i wiek dawcy (pacjenta lub zwierzęcia) , ważne odmiany sekwencji, łącza internetowe, odniesienia do publikacji i odsyłacze do blisko 100 różnych baz danych, ontologii, kolekcji komórek i innych odpowiednich zasobów.
Ponieważ wiele linii komórkowych wykorzystywanych w badaniach zostało błędnie zidentyfikowanych lub skażonych , Cellosaurus śledzi problematyczne linie komórkowe, w tym wszystkie wymienione w tabelach Międzynarodowego Komitetu Uwierzytelniania Linii Komórkowych (ICLAC). W przypadku ludzkich i niektórych psich zapewnia informacje o profilu krótkich powtórzeń tandemowych (STR). Od lipca 2018 r. linie komórkowe Cellozaura są reprezentowane jako pozycje w Wikidanych . W marcu 2020 roku Cellosaurus stworzył stronę zawierającą informacje o linii komórkowej istotne dla SARS-CoV-2 w odpowiedzi na pandemię COVID-19 .
Encyklopedia Cellosaurus jest powszechnie uznawana za wiarygodne źródło informacji o liniach komórkowych, dostarczające unikalnych identyfikatorów i źródło wyselekcjonowanych informacji.