Thorarchaeota
| Klasyfikacja naukowa | |
|---|---|
| Thorarchaeota | |
| Domena: | Archeony |
| Królestwo: | proteoarcheota |
| supertyp: | Asgard |
| Gromada: |
" Candidatus Thorarchaeota" Baker 2015 |
" Candidatus Thorarchaeota ", lub po prostu Thorarchaeota , jest typem należącym do supertypu Asgard archaea . Asgard superphylum reprezentuje najbliższych prokariotycznych krewnych eukariontów . Ponieważ istnieje tak bliski związek między tymi dwiema różnymi domenami, dostarcza to dalszych dowodów teorii dwudomenowego drzewa życia , która stwierdza, że eukarionty wywodzą się z archeonów domena. Archaea Asgard to jednokomórkowe drobnoustroje morskie, które zawierają rozgałęzione wyrostki i mają geny podobne do eukarii. Asgard archaea superphylum składa się z Thorarchaeota, Lokiarchaeota , Odinarchaeota i Heimdallarchaeota . Thorarchaeota po raz pierwszy zidentyfikowano w strefie przejściowej siarczan-metan w osadach wód pływowych. Thorarcheota są szeroko rozpowszechnione w osadach morskich i słodkowodnych.
Odkrycie
Thorarchaeota odkryto analizując osady ujściowe uzyskane z rzeki White Oak w Karolinie Północnej . Estuaria to słonawe zbiorniki wodne, w których spotykają się wody słodkie i morskie, zapewniając bogaty i unikalny obszar składników odżywczych. Doktorant z University of Texas odkrył nowe cechy Thorarchaeota, które żyją pod osadami i z niedotlenieniem nieruchomości. Absolwenci udowodnili ponadto, że archeony pomagają w degradacji materii organicznej, wiązaniu węgla nieorganicznego i redukcji siarki. Genomy Thorarchaeota, które uzyskano z organizmów morskich, wydają się mieć różnorodne szlaki metaboliczne z potencjałem degradacji i wchłaniania białek i węglowodanów.
Opis
Thorarchaeota nie były hodowane w laboratorium. To, co wiadomo o Thorarchaeota, pochodzi z analizy częściowych i prawie kompletnych genomów. Z częściowych genomów zsekwencjonowano 3029 białek. Te genomy zawierają geny, które sugerują, że Thorarchaeota może mieć zdolność degradacji materii organicznej, co sugeruje rolę w obiegu węgla i rolę pośrednią w cyklu siarki . Znaleziono geny prawie kompletnego szlaku Wooda-Ljungdahla, ale brakowało im genów dehydrogenazy mrówczanowej . Może to być spowodowane posiadaniem niekompletnych genomów. Thorachaeota może używać tetrahydrometanopteryna Szlak Wooda-Ljungdahla w celu redukcji dwutlenku węgla. Thorarchaeota mają geny degradacji i asymilacji białek, które obejmują geny clostripain i gingipain . Mają także geny peptydaz zewnątrzkomórkowych . Te geny mogą sugerować, że głównym źródłem węgla dla Thorarchaeota są białka i peptydy. Częściowe genomy zsekwencjonowane Thorarchaeota mają również obecne geny glikolizy . Brakuje im genów dla heksokinaz , ale mają geny dla kinaz pirogronianowych i syntaza fosfoenolopirogronianowa . Obecność genów dla tych enzymów może odgrywać rolę w zdolności adaptacji do różnych warunków środowiskowych. W większości próbek zawierających częściowe genomy znaleziono geny wiązania azotu , jednak nie znaleziono genów enzymów katalizujących redukcję azotynów . Niektóre z sekwencjonowanych częściowych genomów mają prawie kompletne szlaki Calvina-Bensona-Bassama i stwierdzono, że wykorzystują RuBisCO typu IV . Podczas gdy inne typy w Asgard Superphylum używają RuBisCO typu III i IV, żaden nie ma szlaku Calvina-Bensona-Basshama.