U eukariontów introny w transkrybowanym pre-mRNA muszą najpierw zostać usunięte przez spliceosom , aby utworzyć dojrzały mRNA. Spliceosom składa się z małych jądrowych rybonukleoprotein (snRNP ) i małych jądrowych RNA (snRNA). A czynnik splicingowy można podzielić na białka snRNP i inne niż snRNP. Czynnik pomocniczy U2 (U2AF), składający się z dużego i małego podjednostka jest białkiem innym niż snRNP wymaganym do wiązania U2 snRNP z miejscem rozgałęzienia pre-mRNA. Gen ten koduje dużą podjednostkę U2AF, która zawiera specyficzny dla sekwencji region wiążący RNA z 3 motywami rozpoznawania RNA i domenę bogatą w Arg/Ser niezbędną do splicingu. Duża podjednostka wiąże się z przewodem polipirymidynowym intronów na wczesnym etapie składania spliceosomu . Dla tego genu wykryto wiele składanych alternatywnie , ale do tej pory określono pełną naturę tylko dwóch.
U ludzi i innych czworonogów wykazano, że bez U2AF2 proces składania jest hamowany. Jednak u danio pręgowanego i innych teleostów proces składania RNA może nadal zachodzić w przypadku niektórych genów pod nieobecność U2AF2. Może to być spowodowane tym, że 10% genów ma naprzemienne pary zasad TG i AC odpowiednio w miejscu splicingowym 3' (3'ss) i miejscu splicingowym 5' (5's) odpowiednio na każdym intronie, co zmienia drugorzędową strukturę RNA i wpływa na splicing.
Czynnik splicingowy U2AF65 może specyficznie rozpoznawać przewód polipirymidynowy (przewód Py), ponieważ U2AF65 składa się z 3 domen wiążących RNA (RRM), wszystkie z nich mają wysokie powinowactwo wiązania z przewodem Py w sąsiednim miejscu splicingowym 3 '. RRM1 i RRM2 są wystarczające do specyficznego wiązania RNA/białko, podczas gdy RRM3 jest odpowiedzialny za interakcje białko/białko. Na przykład C-Terminal RRM3 przyczynia się do ustanowienia kontaktów białko-białko z czynnikami splicingowymi, takimi jak UAP56, SAP155 i mBBP / SF1.
Neubauer G, King A, Rappsilber J, Calvio C, Watson M, Ajuh P i in. (wrzesień 1998). „Spektrometria mas i przeszukiwanie bazy danych EST umożliwia scharakteryzowanie wielobiałkowego kompleksu spliceosomów”. Genetyka przyrody . 20 (1): 46–50. doi : 10.1038/1700 . PMID 9731529 . S2CID 585778 .
