USP4

USP4
Dostępne konstrukcje WPB Wyszukiwanie ortologów: Lista kodów identyfikacyjnych PDB
Identyfikatory
	, UNP, Unph, peptydaza specyficzna dla ubikwityny 4
identyfikatory zewnętrzne
Lokalizacja genu ( człowiek ) Chr. Zespół Początek Koniec
Lokalizacja genu ( mysz ) Chr. Zespół Początek Koniec
Wzór ekspresji RNA Błagam Człowiek Mysz (ortolog) BioGPS
Ontologia genów Funkcja molekularna Komponent komórkowy Proces biologiczny Źródła: Amigo / QuickGO
Ortologi Gatunek Człowiek Mysz Entrez Ensembl UniProt RefSeq (mRNA) RefSeq (białko) Lokalizacja (UCSC) PubMed search
Wikidane
Wyświetl/edytuj człowieka Wyświetl/edytuj mysz

Specyficzna dla ubikwityny proteaza 4 (USP4) jest enzymem , który odszczepia ubikwitynę od wielu substratów białkowych. Przed standaryzacją nomenklatury USP4 był znany jako UNP i był jednym z pierwszych enzymów deubikwitynujących zidentyfikowanych u ssaków. U myszy i człowieka białko USP4 jest kodowane przez gen zawierający 22 eksony .

Białko to należy do rodziny peptydaz cysteinowych C19. Jako enzym deubikwitynujący ma niezwykłą zdolność do rozszczepiania wiązań ubikwityna- prolina . Ta właściwość może odzwierciedlać elastyczność strukturalną w miejscu aktywnym enzymu i może wyjaśniać jego zdolność do rozszczepiania łańcuchów ubikwityny o różnych wiązaniach. USP4 ma substraty o ważnej funkcji w wielu szlakach sygnalizacji komórkowej, w tym NF-κB , TGF-β , Wnt/β-katenina , p53 i spliceosom ścieżki. Inne substraty obejmują receptor adenozyny A2A i białko Ro52 ( TRIM21 ).

USP4 jest nukleocytoplazmatycznym wahadłowym białkiem , które przenosi funkcjonalny sygnał lokalizacji jądrowej (NLS) ⁷⁶⁶ QPQKKKK ⁷⁷² i jądrowy sygnał eksportu (NES) ¹³³ VEVYLLELKL ¹⁴² . Sygnały te inicjują translokację USP4 do jądra odpowiednio z cytoplazmy i odwrotnie. Proporcja puli cytoplazmatycznej do jądrowej USP4 zmienia się w zależności od typu komórki, fazy cyklu komórkowego i poziomu ekspresji białka.

Interakcje

Wykazano, że USP4 oddziałuje z białkiem supresorowym guza pRb i białkami p107 i p130 związanymi z kieszeniami .

Dalsza lektura

•   D'Andrea A, Pellman D (1999). „Enzymy deubikwitynujące: nowa klasa regulatorów biologicznych”. Krytyk. Wielebny Biochem. Mol. Biol . 33 (5): 337–352. doi : 10.1080/10409239891204251 . PMID 9827704 .
•   Gray DA, Inazawa J, Gupta K i in. (1995). „Podwyższona ekspresja Unph, protoonkogenu w 3p21.3, w ludzkich guzach płuc”. Onkogen . 10 (11): 2179–83. PMID 7784062 .
•   Maruyama K, Sugano S (1994). „Oligo-capping: prosta metoda zastąpienia struktury czapeczki eukariotycznych mRNA oligorybonukleotydami”. gen . 138 (1–2): 171–174. doi : 10.1016/0378-1119(94)90802-8 . PMID 8125298 .
•   Gupta K, Chevrette M, szary DA (1994). „Protoonkogen Unp koduje białko jądrowe”. Onkogen . 9 (6): 1729–31. PMID 8183569 .
•   Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K i in. (1997). „Konstrukcja i charakterystyka biblioteki cDNA wzbogaconej o pełnej długości i wzbogaconej o koniec 5'”. gen . 200 (1–2): 149–156. doi : 10.1016/S0378-1119(97)00411-3 . PMID 9373149 .
•   Di Donato F, Chan EK, Askanase AD i in. (2001). „Interakcja między 52 kDa SSA / Ro a enzymem deubikwitynującym UnpEL: wskazówka do funkcji”. Int. J. Biochem. Biol komórkowy . 33 (9): 924–934. doi : 10.1016/S1357-2725(01)00055-3 . PMID 11461834 .
•   Blanchette P, Gilchrist CA, Baker RT, Gray DA (2001). „Związek UNP, proteazy specyficznej dla ubikwityny, z białkami kieszonkowymi pRb, p107 i p130” . Onkogen . 20 (39): 5533–5537. doi : 10.1038/sj.onc.1204823 . PMID 11571651 .
•   DeSalle LM, Latres E, Lin D i in. (2001). „Enzym usuwający ubikwitynację Unp oddziałuje z białkiem siatkówczaka” . Onkogen . 20 (39): 5538–5542. doi : 10.1038/sj.onc.1204824 . PMID 11571652 .
•    Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH i in. (2003). „Generowanie i wstępna analiza ponad 15 000 pełnej długości sekwencji cDNA człowieka i myszy” . proc. Natl. Acad. nauka USA . 99 (26): 16899–16903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M . doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932 .
•    Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA i in. (2004). „Stan, jakość i ekspansja projektu cDNA pełnej długości NIH: Kolekcja genów ssaków (MGC)” . Genom Res . 14 (10B): 2121–2127. doi : 10.1101/gr.2596504 . PMC 528928 . PMID 15489334 .
•   Wada K, Tanji K, Kamitani T (2006). „Białko onkogenne UnpEL / Usp4 deubikwitynuje Ro52 dzięki swojej aktywności izopeptydazy”. Biochem. Biofiza. Rez. Komuna . 339 (3): 731–736. doi : 10.1016/j.bbrc.2005.11.076 . PMID 16316627 .
•   Wada K, Kamitani T (2006). „UnpEL / Usp4 jest ubikwitynowany przez Ro52 i sam deubikwitynowany”. Biochem. Biofiza. Rez. Komuna . 342 (1): 253–258. doi : 10.1016/j.bbrc.2006.01.144 . PMID 16472766 .

Linki zewnętrzne

• Przegląd wszystkich informacji strukturalnych dostępnych w PDB dla UniProt : Q13107 (hydrolaza końca karboksylowego ubikwityny 4) w PDBe-KB .